170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_2086 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_2086  BioY protein  100 
 
 
197 aa  369  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00325943  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0991  BioY protein  44.62 
 
 
199 aa  141  8e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_967  biotin biosynthesis protein BioY  38.42 
 
 
215 aa  137  1e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000844147  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0995  BioY protein  38.42 
 
 
215 aa  135  4e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1184  BioY family protein  38.92 
 
 
215 aa  121  7e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000330178  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1156  BioY protein  41.11 
 
 
199 aa  111  7.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0586  biotin synthesis BioY protein  38.98 
 
 
187 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2139  BioY protein  45.62 
 
 
192 aa  107  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.990413  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21300  hypothetical protein  45.83 
 
 
197 aa  107  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.380414 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0230  BioY protein  44.87 
 
 
204 aa  105  3e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.949273  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2213  BioY protein  38.24 
 
 
182 aa  102  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012911  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0018  BioY protein  44.59 
 
 
205 aa  101  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000199845 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2689  BioY protein  43.6 
 
 
197 aa  101  8e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2725  BioY protein  35.26 
 
 
184 aa  97.1  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.401651  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1671  BioY protein  45.91 
 
 
207 aa  95.5  5e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000998664 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4523  BioY protein  41.89 
 
 
206 aa  93.2  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2725  BioY protein  41.44 
 
 
195 aa  93.2  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318668  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05160  BioY protein  37.11 
 
 
184 aa  92.8  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0539  BioY protein  40.4 
 
 
203 aa  86.3  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.203446  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3745  BioY protein  34.25 
 
 
190 aa  86.7  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000421582  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0283  BioY protein  40.74 
 
 
179 aa  86.7  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0144  BioY protein  38.18 
 
 
189 aa  85.9  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.964994 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3185  BioY protein  37.91 
 
 
178 aa  84  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1961  BioY protein  33.69 
 
 
187 aa  83.6  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0476  BioY protein  44.44 
 
 
182 aa  81.6  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.014299 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0129  BioY protein  34.71 
 
 
169 aa  80.9  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0127  BioY protein  34.71 
 
 
169 aa  80.9  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12372  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0996  BioY protein  40.34 
 
 
191 aa  80.1  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2901  BioY protein  56.58 
 
 
208 aa  79.3  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000326686  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2735  BioY protein  36.54 
 
 
195 aa  79.3  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1647  BioY protein  37.97 
 
 
169 aa  77.8  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4329  BioY protein  37.75 
 
 
212 aa  77.8  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794239  normal  0.373185 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1651  BioY family protein  34.44 
 
 
203 aa  76.6  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000463296  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3107  Na+/H+ antiporter  36.41 
 
 
192 aa  76.6  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1159  BioY protein  32.86 
 
 
231 aa  77  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.934928  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0581  BioY protein  34.29 
 
 
187 aa  76.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.981929  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3005  BioY protein  39.88 
 
 
200 aa  75.9  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.312874  normal  0.884214 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1123  BioY protein  37.99 
 
 
197 aa  75.5  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.432616  normal  0.483731 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1749  BioY protein  39.84 
 
 
182 aa  74.7  0.0000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.969315  normal  0.0325978 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0061  BioY protein  31.52 
 
 
182 aa  74.3  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000303529  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1681  BioY protein  42.47 
 
 
225 aa  72.8  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1200  BioY family protein  35.76 
 
 
216 aa  72.8  0.000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000053254 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1014  BioY protein  37.16 
 
 
169 aa  73.2  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.842683  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8405  BioY family protein  43.93 
 
 
189 aa  72.4  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1597  hypothetical protein  36.05 
 
 
177 aa  72  0.000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839094  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1719  BioY family protein  40.11 
 
 
191 aa  71.6  0.000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1662  BioY family protein  40.11 
 
 
191 aa  71.6  0.000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3685  BioY protein  33.75 
 
 
189 aa  71.6  0.000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2544  BioY protein  33.14 
 
 
192 aa  71.2  0.000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269732  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3677  BioY protein  36.13 
 
 
182 aa  71.2  0.000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000940294  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4131  BioY protein  35.36 
 
 
189 aa  70.9  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2330  BioY protein  35.98 
 
 
196 aa  70.9  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3020  BioY protein  32.62 
 
 
201 aa  70.9  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1630  hypothetical protein  39.52 
 
 
199 aa  70.9  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0622  BioY protein  32.57 
 
 
187 aa  70.1  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560526  normal  0.0354097 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3231  BioY protein  36.49 
 
 
184 aa  69.3  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000266759  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0575  BioY protein  36.42 
 
 
185 aa  69.3  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4638  BioY protein  42.68 
 
 
203 aa  69.7  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3648  bioY family protein  32.43 
 
 
191 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07160  hypothetical protein  39.26 
 
 
205 aa  68.6  0.00000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.635094  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2954  BioY family protein  41.33 
 
 
180 aa  68.2  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.716157  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0185  bioY family protein  30.81 
 
 
197 aa  68.2  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1198  BioY protein  37.42 
 
 
191 aa  68.2  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1588  BioY protein  29.24 
 
 
167 aa  68.2  0.00000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000111141  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0398  BioY family protein  33.55 
 
 
179 aa  67.4  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000949175  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2113  BioY protein  34.07 
 
 
224 aa  67.4  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0646325  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3097  BioY protein  35.8 
 
 
187 aa  67.4  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0504  BioY protein  32.57 
 
 
210 aa  67.4  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4787  bioY family protein  30.81 
 
 
197 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000360294  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4627  biotin synthesis BioY protein  30.81 
 
 
197 aa  67  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.33055e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4649  biotin synthesis BioY protein  30.81 
 
 
197 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000112597  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5150  bioY family protein  30.81 
 
 
197 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.85197  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5049  bioY family protein  30.27 
 
 
197 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.925565  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5028  bioY family protein  30.81 
 
 
197 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2320  BioY protein  34.71 
 
 
180 aa  67  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3528  BioY protein  39.25 
 
 
198 aa  67  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1788  BioY protein  33.95 
 
 
169 aa  67  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.385852  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1864  BioY family protein  29.09 
 
 
182 aa  66.2  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0886  BioY protein  32.54 
 
 
235 aa  66.2  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.452064  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1529  BioY protein  36.77 
 
 
188 aa  66.2  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0610  BioY protein  41.67 
 
 
174 aa  65.9  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000775885  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2134  putative BioY protein  35.08 
 
 
197 aa  66.2  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3315  BioY protein  32.43 
 
 
191 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000166456  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5056  bioY family protein  30.81 
 
 
197 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.745684  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3011  BioY protein  43.26 
 
 
187 aa  65.9  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131178  normal  0.563491 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1580  bioY family protein  31.08 
 
 
191 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000070307  normal  0.0383655 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3688  BioY protein  36.72 
 
 
190 aa  65.9  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.983357  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5061  bioY family protein  30.81 
 
 
197 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1318  BioY protein  36.84 
 
 
189 aa  64.7  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00324631 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4739  BioY protein  38.1 
 
 
197 aa  64.7  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000101818  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1206  bioY family protein  46.34 
 
 
175 aa  63.9  0.000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1004  biotin synthesis BioY protein  31.9 
 
 
187 aa  63.5  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2875  BioY protein  32.43 
 
 
202 aa  63.2  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000912957  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21370  hypothetical protein  37.5 
 
 
205 aa  63.5  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.283174  normal  0.337859 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1496  hypothetical protein  29.63 
 
 
165 aa  63.5  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.41192 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2445  BioY protein  38.27 
 
 
198 aa  62.8  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000283482  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3737  bioY family protein  33.78 
 
 
191 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.776545  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02210  hypothetical protein  35.98 
 
 
194 aa  62  0.000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3331  bioY family protein  33.78 
 
 
191 aa  62  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000423922  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3640  bioY family protein  33.78 
 
 
191 aa  62  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>