77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_2072 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_2072  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 
92 aa  186  7e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2122  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  56.79 
 
 
90 aa  95.1  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.222018  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0025  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  52.44 
 
 
86 aa  94  6e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000336302  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0050  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  55.13 
 
 
81 aa  93.6  8e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2822  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  52.44 
 
 
82 aa  93.2  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.125301  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0036  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  48.78 
 
 
97 aa  86.3  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000429611  hitchhiker  0.00000825112 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0989  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.3 
 
 
68 aa  55.1  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0480  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44.62 
 
 
65 aa  54.3  0.0000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1481  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.79 
 
 
73 aa  52.8  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.859312  normal  0.859235 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1469  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44.83 
 
 
65 aa  52.4  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.483259  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1401  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  39.71 
 
 
71 aa  52  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0984  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.91 
 
 
68 aa  50.8  0.000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00969866  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1719  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase, delta subunit  40.91 
 
 
68 aa  50.8  0.000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1544  ferredoxin  40 
 
 
73 aa  50.1  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1811  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase, delta subunit  37.5 
 
 
94 aa  48.9  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0962  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.91 
 
 
68 aa  49.3  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1174  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  42.42 
 
 
67 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.46083e-34 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1403  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.3 
 
 
92 aa  49.7  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0826775  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06770  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase (ferredoxin), delta subunit  42.11 
 
 
70 aa  48.5  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3087  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.39 
 
 
67 aa  48.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000309533  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0302  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.92 
 
 
90 aa  47.8  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.458199 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1475  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.1 
 
 
67 aa  47.8  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0057  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.44 
 
 
83 aa  47.4  0.00007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0044  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.19 
 
 
77 aa  47  0.00008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0087  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.54 
 
 
114 aa  47  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.803989  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0602  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.24 
 
 
108 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000173752 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1450  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  36.92 
 
 
636 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.101445  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0105  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.29 
 
 
73 aa  46.2  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0171848  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1165  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.18 
 
 
112 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550114  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2804  NADH dehydrogenase (quinone)  42.11 
 
 
636 aa  46.6  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.260588 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1045  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.13 
 
 
77 aa  46.2  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1067  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.13 
 
 
77 aa  46.2  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1609  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.33 
 
 
80 aa  45.8  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1386  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.68 
 
 
76 aa  45.1  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1586  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.21 
 
 
65 aa  45.1  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1474  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.1 
 
 
77 aa  45.1  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2054  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.43 
 
 
79 aa  44.3  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1862  keto/oxoacid ferredoxin oxidoreductase subunit  40.35 
 
 
67 aa  44.3  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00222971  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0821  response regulator receiver modulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.21 
 
 
1139 aa  44.3  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.187038 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0110  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.31 
 
 
76 aa  44.3  0.0006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0716238  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0092  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.24 
 
 
80 aa  44.3  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.84715  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0951  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  42.37 
 
 
96 aa  43.9  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.155581  normal  0.969616 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1371  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.21 
 
 
92 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3578  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.31 
 
 
90 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.182494  normal  0.90179 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0398  hypothetical protein  36.92 
 
 
403 aa  43.9  0.0008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.503263  normal  0.749229 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0941  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.79 
 
 
76 aa  43.9  0.0008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07910  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase, delta subunit  34.33 
 
 
70 aa  43.9  0.0008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00191452  normal  0.324928 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1893  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.11 
 
 
90 aa  43.5  0.0009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0637418 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0138  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.62 
 
 
74 aa  43.5  0.0009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.425374  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2720  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.27 
 
 
79 aa  43.5  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1318  NADH dehydrogenase (quinone)  40 
 
 
626 aa  43.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0043  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase, delta subunit  42.37 
 
 
81 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1368  NADH dehydrogenase (quinone)  40 
 
 
626 aa  43.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2310  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.31 
 
 
70 aa  43.5  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000175687  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1706  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.33 
 
 
68 aa  42.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1377  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40 
 
 
793 aa  42.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.118947  normal  0.859258 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0018  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.82 
 
 
93 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0689181  normal  0.439492 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0591  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.38 
 
 
390 aa  42.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.463263  normal  0.063336 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1188  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.88 
 
 
214 aa  42.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2240  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.6 
 
 
67 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000457496  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1678  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase, delta subunit  34.38 
 
 
76 aa  41.6  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0135618  normal  0.0584624 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1306  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase, delta subunit  34.29 
 
 
70 aa  42  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000902079  normal  0.0568667 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1835  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  29.41 
 
 
388 aa  41.6  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0835856  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0069  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.24 
 
 
397 aa  42  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.416863  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0238  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit F  37.1 
 
 
387 aa  42  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.66964 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1224  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.76 
 
 
118 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.910611 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0197  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.07 
 
 
491 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0114933 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1437  aldo/keto reductase  36.67 
 
 
316 aa  41.2  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1233  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase  36.36 
 
 
315 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4012  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase  36.36 
 
 
315 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0559  NADH dehydrogenase (quinone)  37.1 
 
 
624 aa  40.8  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.382532  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0189  NADH dehydrogenase subunit I  32.53 
 
 
200 aa  40.8  0.006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1727  aldo/keto reductase family oxidoreductase  36.67 
 
 
316 aa  40.8  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.349394 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1095  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.07 
 
 
67 aa  40.8  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.121461  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3167  ferredoxin-type protein napF  36.76 
 
 
170 aa  40.4  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1185  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.7 
 
 
202 aa  40.4  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.150574  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0588  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.84 
 
 
76 aa  40  0.01  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>