More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_2045 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_2045  GTP-binding protein Era  100 
 
 
308 aa  619  1e-176  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3066  GTP-binding protein Era  59.86 
 
 
300 aa  378  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000674548  decreased coverage  0.0000000895367 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  58.14 
 
 
302 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0138  GTP-binding protein Era  61.43 
 
 
300 aa  361  9e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4275  GTP-binding protein Era  55.78 
 
 
303 aa  339  4e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  55.48 
 
 
301 aa  338  5e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  55.14 
 
 
301 aa  338  8e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  56.76 
 
 
302 aa  337  9.999999999999999e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  54.79 
 
 
301 aa  337  9.999999999999999e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4380  GTP-binding protein Era  55.14 
 
 
301 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000332799  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4199  GTP-binding protein Era  55.14 
 
 
301 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000030589  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  55.14 
 
 
301 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  55.14 
 
 
301 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  55.14 
 
 
301 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4524  GTP-binding protein Era  55.14 
 
 
301 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000023252  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  55.14 
 
 
301 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0819  GTP-binding protein Era  54.79 
 
 
301 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000201776  decreased coverage  1.20434e-22 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  56.66 
 
 
302 aa  335  7e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1625  GTP-binding protein Era  51.03 
 
 
299 aa  328  6e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1659  GTP-binding protein Era  51.03 
 
 
299 aa  328  6e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1067  GTP-binding protein Era  54.08 
 
 
297 aa  325  7e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1134  GTP-binding protein Era  48.97 
 
 
299 aa  320  1.9999999999999998e-86  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.968945  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1561  Era, Era/TrmE family GTP-binding protein  52.23 
 
 
293 aa  316  3e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.400098  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1405  GTP-binding protein Era  53.64 
 
 
303 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00334874  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1499  GTP-binding protein Era  51.69 
 
 
299 aa  312  5.999999999999999e-84  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.030246  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1981  GTP-binding protein Era  53.42 
 
 
298 aa  311  1e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  50.34 
 
 
298 aa  311  1e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0668  GTP-binding protein Era  51.71 
 
 
299 aa  308  1.0000000000000001e-82  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0548419  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0646  GTP-binding protein Era  50.51 
 
 
305 aa  306  2.0000000000000002e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.601606  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0738  GTP-binding protein Era  51.18 
 
 
301 aa  302  4.0000000000000003e-81  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.979215  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0600  GTP-binding protein Era  52.23 
 
 
301 aa  301  7.000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0780  GTPase  49.49 
 
 
303 aa  300  3e-80  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00998411  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12510  GTP-binding protein Era  47.6 
 
 
294 aa  298  6e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0989  GTPase  49.67 
 
 
305 aa  296  2e-79  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00032345  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0397  GTP-binding protein Era  45.79 
 
 
303 aa  296  3e-79  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  50.17 
 
 
303 aa  295  9e-79  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0671  GTP-binding protein Era  50.18 
 
 
301 aa  292  4e-78  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.584741  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1987  GTP-binding protein Era  47.26 
 
 
296 aa  292  4e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  51.54 
 
 
297 aa  292  5e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2272  GTP-binding protein Era  46.92 
 
 
296 aa  291  1e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  50.84 
 
 
298 aa  290  2e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0874  GTP-binding protein Era  51.32 
 
 
307 aa  288  8e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  47.26 
 
 
302 aa  287  2e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1412  GTP-binding protein Era  48.12 
 
 
300 aa  285  5e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000752923  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  50.51 
 
 
297 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2959  GTP-binding protein Era  50.34 
 
 
310 aa  283  3.0000000000000004e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000390486  normal  0.0714001 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0793  GTP-binding protein Era  51.19 
 
 
297 aa  281  1e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.998663  normal  0.0560127 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0296  GTP-binding protein Era  47.4 
 
 
306 aa  280  2e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0160  GTP-binding protein Era  50 
 
 
311 aa  279  4e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.709103  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4517  GTP-binding protein Era  47.73 
 
 
337 aa  277  1e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0808  GTP-binding protein Era  48.98 
 
 
299 aa  276  4e-73  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1611  GTP-binding protein Era  49.33 
 
 
318 aa  275  5e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1254  GTP-binding protein Era  48.14 
 
 
298 aa  275  7e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25479  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2546  GTP-binding protein Era  48.32 
 
 
314 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3560  GTP-binding protein Era  48.32 
 
 
314 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  48.81 
 
 
299 aa  271  1e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0080  GTP-binding protein Era  48.14 
 
 
301 aa  270  2e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000412844  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13620  GTP-binding protein Era  46.96 
 
 
300 aa  268  1e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.475105  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1205  GTP-binding protein Era  45.89 
 
 
297 aa  266  2e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.124977  normal  0.282602 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0080  GTP-binding protein Era  47.46 
 
 
300 aa  267  2e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000115632  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1640  GTP-binding protein Era  46.62 
 
 
307 aa  266  2.9999999999999995e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0258714  hitchhiker  0.00261121 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2127  GTP-binding protein Era  47.1 
 
 
296 aa  266  4e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148937  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19471  GTP-binding protein Era  50 
 
 
343 aa  264  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13500  GTP-binding protein Era  45.85 
 
 
314 aa  264  2e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0682409 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0908  GTP-binding protein Era  46.42 
 
 
303 aa  264  2e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0482  GTP-binding protein Era  47.64 
 
 
295 aa  263  3e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11760  GTP-binding protein Era  45.87 
 
 
310 aa  263  3e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.28121  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1966  GTP-binding protein Era  45.72 
 
 
319 aa  262  6e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000219392 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4483  GTP-binding protein Era  49.33 
 
 
318 aa  261  8.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1752  GTP-binding protein Era  44.55 
 
 
312 aa  261  1e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.295037  normal  0.389985 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1271  GTP-binding protein Era  47.49 
 
 
307 aa  261  1e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.17253 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2203  GTP-binding protein Era  46.05 
 
 
306 aa  260  2e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.415521  hitchhiker  0.00609862 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3384  GTP-binding protein Era  46.33 
 
 
308 aa  261  2e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.731226  normal  0.619767 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12970  GTP-binding protein Era  44.9 
 
 
301 aa  260  2e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.327957  normal  0.141984 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14661  GTP-binding protein Era  45.45 
 
 
303 aa  260  2e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3463  GTP-binding protein Era  46.82 
 
 
299 aa  260  2e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.720109  normal  0.032958 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1726  GTP-binding protein Era  47.1 
 
 
296 aa  260  2e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0134  GTP-binding protein Era  44.37 
 
 
299 aa  259  3e-68  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3243  GTP-binding protein Era  47.02 
 
 
311 aa  259  4e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0404456  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3828  GTP-binding protein Era  47.42 
 
 
300 aa  259  4e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0285855 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3452  GTP-binding protein Era  46.49 
 
 
299 aa  259  4e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00911502  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1162  GTP-binding protein Era  46.64 
 
 
303 aa  259  4e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111162  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3515  GTP-binding protein Era  46.49 
 
 
299 aa  259  4e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.888371 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2116  GTP-binding protein Era  46.23 
 
 
310 aa  259  5.0000000000000005e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1685  GTP-binding protein Era  47.3 
 
 
295 aa  259  5.0000000000000005e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2181  GTP-binding protein Era  50.17 
 
 
451 aa  259  5.0000000000000005e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14801  GTP-binding protein Era  45.45 
 
 
303 aa  259  6e-68  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2229  GTP-binding protein Era  44.03 
 
 
318 aa  258  8e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00352178  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0356  GTP-binding protein Era  49.66 
 
 
315 aa  258  9e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.792486 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2710  GTP-binding protein Era  45.7 
 
 
304 aa  258  9e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.521075  normal  0.585399 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2303  GTP-binding protein Era  45.79 
 
 
306 aa  258  9e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17220  GTP-binding protein Era  45.31 
 
 
313 aa  258  1e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00402768  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3449  GTP-binding protein Era  47.08 
 
 
299 aa  257  2e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0196733 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1377  GTP-binding protein Era  44.78 
 
 
303 aa  256  3e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0974001  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1543  GTP-binding protein Era  44.22 
 
 
314 aa  256  3e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3828  GTP-binding protein Era  45.03 
 
 
305 aa  256  4e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  45.99 
 
 
324 aa  256  5e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3155  GTP-binding protein Era  43 
 
 
302 aa  255  7e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0422741  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1291  GTP-binding protein Era  51.19 
 
 
449 aa  255  7e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.537318 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3148  GTP-binding protein Era  43.3 
 
 
300 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0159525  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>