More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_2017 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_2017  thiamine-monophosphate kinase  100 
 
 		 337 aa  647    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2889  thiamine-monophosphate kinase  43.71 
 
 		 334 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202219  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1157  thiamine-monophosphate kinase  45.37 
 
 		 337 aa  244  9.999999999999999e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0646  thiamine-monophosphate kinase  41.62 
 
 		 334 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  43.54 
 
 		 328 aa  228  8e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  43.15 
 
 		 339 aa  225  1e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1693  thiamine-monophosphate kinase  41.25 
 
 		 340 aa  215  7e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0213115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  43.54 
 
 		 329 aa  210  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  43.92 
 
 		 327 aa  211  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0163  thiamine-monophosphate kinase  41.16 
 
 		 338 aa  210  3e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.959025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0358  thiamine-monophosphate kinase  34.65 
 
 		 355 aa  206  7e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00127511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0258  thiamine-monophosphate kinase  35.13 
 
 		 355 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.451362  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4694  thiamine-monophosphate kinase  38.69 
 
 		 318 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  0.226637 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0014  thiamine-monophosphate kinase  35.19 
 
 		 346 aa  197  3e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0397  thiamine-monophosphate kinase  37.79 
 
 		 336 aa  195  8.000000000000001e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  40.12 
 
 		 323 aa  194  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  39.82 
 
 		 324 aa  194  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0398  thiamine-monophosphate kinase  37.72 
 
 		 350 aa  194  1e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_340  thiamine-monophosphate kinase  38.26 
 
 		 336 aa  194  2e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000967577  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0376  thiamine-monophosphate kinase  36.99 
 
 		 336 aa  191  2e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000100776  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1928  thiamine-monophosphate kinase  37.11 
 
 		 354 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0028  thiamine-monophosphate kinase  40.54 
 
 		 329 aa  187  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2057  thiamine-monophosphate kinase  37.96 
 
 		 358 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2602  thiamine-monophosphate kinase  39.34 
 
 		 333 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0259397  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2612  thiamine-monophosphate kinase  34.28 
 
 		 363 aa  182  6e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2521  thiamine-phosphate kinase (thiamin-monophosphate kinase)  35.67 
 
 		 346 aa  182  1e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1167  thiamine-monophosphate kinase  39.05 
 
 		 319 aa  181  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00022874  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3561  thiamine-monophosphate kinase  35.48 
 
 		 340 aa  179  5.999999999999999e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.25007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1027  thiamine-monophosphate kinase  32.08 
 
 		 344 aa  179  5.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0548176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0791  thiamine-monophosphate kinase  33.53 
 
 		 348 aa  179  7e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5192  thiamine-monophosphate kinase  36.95 
 
 		 339 aa  176  6e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04400  putative thiamine-monophosphate kinase  34.39 
 
 		 352 aa  176  7e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1192  thiamine-monophosphate kinase  38.76 
 
 		 323 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0510899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0332  thiamine-monophosphate kinase  33.9 
 
 		 354 aa  175  9.999999999999999e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1213  thiamine-monophosphate kinase  35.44 
 
 		 369 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00911735  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2805  thiamine-monophosphate kinase  38.98 
 
 		 331 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.707056  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3282  thiamine monophosphate kinase  39.4 
 
 		 326 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1028  thiamine monophosphate kinase  39.1 
 
 		 326 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  41.33 
 
 		 323 aa  171  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3087  thiamine monophosphate kinase  38.28 
 
 		 324 aa  172  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0336  thiamine-monophosphate kinase  33.62 
 
 		 355 aa  171  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2896  thiamine monophosphate kinase  39.22 
 
 		 324 aa  169  4e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1533  thiamine-monophosphate kinase  39.74 
 
 		 320 aa  169  8e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0750268  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01423  thiamine monophosphate kinase  37.58 
 
 		 321 aa  167  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.281467  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3114  thiamine monophosphate kinase  38.92 
 
 		 329 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  40.42 
 
 		 323 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3255  thiamine monophosphate kinase  38.92 
 
 		 329 aa  166  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.05609  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3166  thiamine monophosphate kinase  38.62 
 
 		 329 aa  165  8e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1075  thiamine monophosphate kinase  40.89 
 
 		 327 aa  165  9e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255519  hitchhiker  0.000417977 
 
 
-
 
NC_002950  PG0637  thiamine monophosphate kinase  34.21 
 
 		 346 aa  165  1.0000000000000001e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.216101 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0885  thiamine monophosphate kinase  38.91 
 
 		 323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0488  thiamine monophosphate kinase  37.43 
 
 		 325 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00365  thiamine monophosphate kinase  37.65 
 
 		 325 aa  162  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.532124  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3192  thiamine-monophosphate kinase  37.65 
 
 		 325 aa  162  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0448  thiamine monophosphate kinase  37.43 
 
 		 325 aa  162  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0338  thiamine monophosphate kinase  37.65 
 
 		 325 aa  162  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0499  thiamine monophosphate kinase  37.65 
 
 		 325 aa  162  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3216  thiamine monophosphate kinase  37.43 
 
 		 325 aa  162  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00369  hypothetical protein  37.65 
 
 		 325 aa  162  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.381421  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1576  thiamine-monophosphate kinase  34.35 
 
 		 320 aa  160  2e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000735175  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1278  thiamine-phosphate kinase  36.69 
 
 		 319 aa  161  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  unclonable  0.0000000000863796 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0812  thiamine-monophosphate kinase  38.06 
 
 		 346 aa  160  2e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0604  thiamine monophosphate kinase  35.22 
 
 		 325 aa  161  2e-38  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0648083  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0581  thiamine-monophosphate kinase  34.35 
 
 		 320 aa  160  2e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.384161  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0453  thiamine monophosphate kinase  37.65 
 
 		 325 aa  161  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1387  thiamine-monophosphate kinase  37.54 
 
 		 319 aa  159  4e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0324994  unclonable  0.0000000216996 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0479  thiamine monophosphate kinase  37.54 
 
 		 325 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  38.21 
 
 		 333 aa  159  5e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2317  thiamine monophosphate kinase  37.5 
 
 		 332 aa  159  7e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0194  thiamine monophosphate kinase  36.13 
 
 		 332 aa  159  7e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.62059 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4465  thiamine-monophosphate kinase  42.4 
 
 		 325 aa  159  8e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.269077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1040  thiamine-monophosphate kinase  37.29 
 
 		 318 aa  158  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000743717  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  36.86 
 
 		 318 aa  157  2e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2773  thiamine-monophosphate kinase  37.35 
 
 		 323 aa  158  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00271748  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1564  thiamine-monophosphate kinase  40.85 
 
 		 315 aa  156  4e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.929436  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1216  thiamine-monophosphate kinase  37.06 
 
 		 323 aa  156  4e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000120227  normal  0.180356 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3153  thiamine-monophosphate kinase  36.76 
 
 		 323 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000108532  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0832  thiamine-monophosphate kinase  33.44 
 
 		 335 aa  156  5.0000000000000005e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000411831  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3155  thiamine-monophosphate kinase  36.76 
 
 		 323 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000840757  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2283  thiamine-monophosphate kinase  35.64 
 
 		 372 aa  156  6e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153463 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0466  thiamine monophosphate kinase  37.13 
 
 		 326 aa  155  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3298  thiamine-monophosphate kinase  36.76 
 
 		 323 aa  155  7e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000889615  decreased coverage  0.000117497 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0521  thiamine monophosphate kinase  37.13 
 
 		 326 aa  155  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0460  thiamine monophosphate kinase  37.13 
 
 		 326 aa  155  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8005  Thiamine-phosphate kinase  38.81 
 
 		 318 aa  155  9e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0458  thiamine monophosphate kinase  37.13 
 
 		 326 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.703911  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0794  thiamine-monophosphate kinase  33.43 
 
 		 318 aa  154  2e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1316  thiamine-monophosphate kinase  38.36 
 
 		 336 aa  154  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1167  thiamine-monophosphate kinase  37.24 
 
 		 318 aa  154  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0557102  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1101  thiamine-monophosphate kinase  37.24 
 
 		 318 aa  154  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00155289  normal  0.489485 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1101  thiamine-monophosphate kinase  37.24 
 
 		 318 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00285593  normal  0.797182 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0765  thiamine-monophosphate kinase  34.63 
 
 		 318 aa  153  4e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0895  thiamine-monophosphate kinase  41 
 
 		 324 aa  153  4e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0369638  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0493  thiamine monophosphate kinase  39.72 
 
 		 329 aa  153  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.371786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2128  thiamine-monophosphate kinase  35.79 
 
 		 331 aa  152  8.999999999999999e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000222353  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2394  thiamine-monophosphate kinase  34.96 
 
 		 344 aa  152  1e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3464  thiamin-monophosphate kinase  37.83 
 
 		 318 aa  150  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0585  thiamine monophosphate kinase  35.84 
 
 		 320 aa  150  4e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1903  thiamine monophosphate kinase  37.28 
 
 		 324 aa  147  3e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3257  thiamine monophosphate kinase  34.98 
 
 		 344 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117282  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>