More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_2004 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_2004  hypothetical protein  100 
 
 
431 aa  852    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0247  protein of unknown function DUF21  36.56 
 
 
446 aa  290  2e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0252  protein of unknown function DUF21  34.29 
 
 
434 aa  278  2e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000514588  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4410  protein of unknown function DUF21  36.51 
 
 
444 aa  277  3e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.938013  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0148  protein of unknown function DUF21  40.14 
 
 
421 aa  276  5e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.518809 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2159  protein of unknown function DUF21  36.5 
 
 
440 aa  273  6e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.182374  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0064  protein of unknown function DUF21  37.38 
 
 
447 aa  271  2e-71  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02510  CBS domain-containing protein  37.89 
 
 
470 aa  270  2.9999999999999997e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3512  protein of unknown function DUF21  37.84 
 
 
431 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal  0.374436 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2040  hypothetical protein  38.05 
 
 
418 aa  266  4e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.923068  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0915  protein of unknown function DUF21  36.87 
 
 
460 aa  266  5e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0280711  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0470  hypothetical protein  37.91 
 
 
432 aa  264  2e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000200568  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01240  CBS domain-containing protein  38.59 
 
 
443 aa  263  6e-69  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1858  protein of unknown function DUF21  37.68 
 
 
434 aa  261  2e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2633  protein of unknown function DUF21  36.62 
 
 
425 aa  259  5.0000000000000005e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1153  hypothetical protein  34.8 
 
 
447 aa  259  6e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000974304  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2870  hypothetical protein  33.65 
 
 
433 aa  259  7e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.221651  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0389  hypothetical protein  37.71 
 
 
438 aa  257  3e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3237  protein of unknown function DUF21  36.95 
 
 
448 aa  256  4e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.422703  normal  0.0333054 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1072  hypothetical protein  36.64 
 
 
442 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0703  protein of unknown function DUF21  34.09 
 
 
477 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.401824 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0026  protein of unknown function DUF21  36.26 
 
 
438 aa  249  6e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2361  hypothetical protein  33.88 
 
 
432 aa  249  7e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00115702  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1383  transport protein  33.18 
 
 
434 aa  248  2e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283032  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1263  CBS  36.95 
 
 
425 aa  247  3e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4147  protein of unknown function DUF21  33.26 
 
 
463 aa  247  3e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.263369 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4107  protein of unknown function DUF21  33.26 
 
 
463 aa  247  3e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  34.73 
 
 
420 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0947  hypothetical protein  35.24 
 
 
432 aa  244  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2611  protein of unknown function DUF21  34.7 
 
 
445 aa  244  3e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0926  protein of unknown function DUF21  36.96 
 
 
441 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2595  hypothetical protein  35.43 
 
 
476 aa  243  3.9999999999999997e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2925  hypothetical protein  34.94 
 
 
465 aa  243  6e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.221134  normal  0.412302 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5899  hypothetical protein  36.06 
 
 
430 aa  242  7.999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.476132 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7969  protein of unknown function DUF21  36.78 
 
 
555 aa  241  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1262  hypothetical protein  34.79 
 
 
533 aa  240  4e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1409  hemolysin-like protein  35.19 
 
 
447 aa  239  5e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3544  protein of unknown function DUF21  33.02 
 
 
446 aa  239  8e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3678  protein of unknown function DUF21  33.33 
 
 
443 aa  239  8e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.35091 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2432  protein of unknown function DUF21  33.33 
 
 
443 aa  239  8e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0669  hypothetical protein  36.78 
 
 
439 aa  238  2e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0810091 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1763  hypothetical protein  34.43 
 
 
446 aa  237  3e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0826  protein of unknown function DUF21  38.27 
 
 
436 aa  237  3e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2296  protein of unknown function DUF21  33.17 
 
 
433 aa  236  7e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.23749  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0830  protein of unknown function DUF21  38.31 
 
 
436 aa  235  9e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0185208  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4066  protein of unknown function DUF21  33.57 
 
 
438 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.659836  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2102  hypothetical protein  35.51 
 
 
486 aa  233  5e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0719505  normal  0.288843 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1285  hypothetical protein  36.69 
 
 
446 aa  233  6e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1425  hypothetical protein  33.1 
 
 
424 aa  232  8.000000000000001e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196446  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3259  CBS domain protein  32.79 
 
 
435 aa  231  1e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1233  hypothetical protein  33.33 
 
 
424 aa  231  2e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3277  protein of unknown function DUF21  34.75 
 
 
437 aa  231  3e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000233033  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4935  hypothetical protein  34.63 
 
 
443 aa  231  3e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1487  protein of unknown function DUF21  36.39 
 
 
421 aa  230  4e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.121973  normal  0.308123 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2206  hypothetical protein  33.02 
 
 
437 aa  229  6e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.287876  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1207  hypothetical protein  32.86 
 
 
424 aa  229  6e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.213322  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0798  protein of unknown function DUF21  33.81 
 
 
429 aa  229  6e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0525  hypothetical protein  31.93 
 
 
441 aa  229  7e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.806161  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3597  protein of unknown function DUF21  32.06 
 
 
447 aa  229  8e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000988374 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1875  hemolysin-like protein  31.55 
 
 
435 aa  229  1e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0753435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1866  hemolysin-like protein  31.55 
 
 
435 aa  229  1e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.621127  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2160  CBS domain protein  31.55 
 
 
435 aa  229  1e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00238227  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2092  CBS domain protein  31.55 
 
 
435 aa  229  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1913  CBS domain-containing protein  31.32 
 
 
435 aa  227  3e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.378516  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2059  CBS domain-containing protein  31.32 
 
 
435 aa  227  3e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3392  CBS domain-containing protein  33.8 
 
 
442 aa  227  4e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1891  hypothetical protein  33.65 
 
 
425 aa  227  4e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.471251 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2966  protein of unknown function DUF21  34.21 
 
 
439 aa  226  4e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0819  protein of unknown function DUF21  29.82 
 
 
441 aa  226  4e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2138  hypothetical protein  32.71 
 
 
440 aa  226  4e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0531  protein of unknown function DUF21  35.55 
 
 
421 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0811523  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3370  CBS domain protein  33.8 
 
 
442 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2050  CBS domain protein  31.41 
 
 
435 aa  226  6e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3066  hypothetical protein  33.8 
 
 
442 aa  226  6e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.928407  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4622  protein of unknown function DUF21  32.45 
 
 
430 aa  226  6e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1126  protein of unknown function DUF21  33.02 
 
 
428 aa  226  8e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.93664  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3396  CBS domain protein  33.8 
 
 
442 aa  225  9e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4712  hypothetical protein  34.11 
 
 
452 aa  225  1e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.184255  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2233  protein of unknown function DUF21  33.57 
 
 
437 aa  225  1e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0762  hypothetical protein  33.87 
 
 
456 aa  225  1e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0171545  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1855  CBS domain protein  33.56 
 
 
442 aa  225  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0014  CBS domain protein  33.64 
 
 
431 aa  224  2e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000513416 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3011  hypothetical protein  32.68 
 
 
429 aa  224  2e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0853  CBS domain-containing protein  34.35 
 
 
444 aa  224  3e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215802  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3172  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
442 aa  223  3e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.903732  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3156  hypothetical protein  33.33 
 
 
442 aa  224  3e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3391  CBS domain protein  33.33 
 
 
442 aa  224  3e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3095  hypothetical protein  33.1 
 
 
440 aa  224  3e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0877278  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3422  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
435 aa  223  4e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0676  CBS domain-containing protein  31.38 
 
 
432 aa  223  7e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4692  magnesium and cobalt efflux protein CorC  31.38 
 
 
425 aa  223  7e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.200662  hitchhiker  0.0000000000000291685 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1910  hypothetical protein  31.43 
 
 
435 aa  223  7e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1143  hypothetical protein  31.57 
 
 
432 aa  223  7e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000186322  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0646  magnesium and cobalt efflux protein CorC  31.38 
 
 
432 aa  222  8e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0238417  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0967  protein of unknown function DUF21  34.69 
 
 
439 aa  222  9e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.854838 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1705  pyruvate-ferredoxin oxidoreductase  31.4 
 
 
446 aa  222  9e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2321  hypothetical protein  33.57 
 
 
446 aa  222  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.638143  normal  0.0384275 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1250  CBS domain-containing protein  34.52 
 
 
432 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.144301  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1099  hypothetical protein  33.41 
 
 
425 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1116  hypothetical protein  33.41 
 
 
425 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>