20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1950 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1950  diverged CheY-domain  100 
 
 
108 aa  220  5e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  1.82046e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2793  diverged CheY-domain protein  40 
 
 
96 aa  80.1  1e-14  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  8.29649e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0636  hypothetical protein  40.66 
 
 
103 aa  76.6  1e-13  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  2.71066e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0574  hypothetical protein  38.89 
 
 
96 aa  72.4  2e-12  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2144  diverged CheY-domain-containing protein  37.5 
 
 
93 aa  68.2  4e-11  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.14206 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0879  hypothetical protein  32.95 
 
 
93 aa  66.6  1e-10  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000121111  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1337  hypothetical protein  32.97 
 
 
93 aa  66.2  2e-10  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.40262e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2586  hypothetical protein  29.09 
 
 
119 aa  58.5  3e-08  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.912654  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0346  hypothetical protein  35.8 
 
 
98 aa  55.8  2e-07  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0228495 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0619  hypothetical protein  26.61 
 
 
119 aa  52.8  1e-06  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  1.20205e-09  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0108  hypothetical protein  35.8 
 
 
105 aa  52.8  2e-06  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2050  hypothetical protein  25.29 
 
 
103 aa  52.4  2e-06  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0825138  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0407  hypothetical protein  33.33 
 
 
105 aa  49.7  1e-05  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0920  fumarate reductase flavoprotein subunit  30.86 
 
 
104 aa  45.1  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  6.98325e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1931  hypothetical protein  30.86 
 
 
103 aa  44.7  0.0004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0969156  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1272  hypothetical protein  30.86 
 
 
104 aa  44.7  0.0004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.19578  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1013  hypothetical protein  28.04 
 
 
110 aa  44.7  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0266  hypothetical protein  30.86 
 
 
104 aa  44.3  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.435874  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1386  hypothetical protein  30.86 
 
 
104 aa  44.3  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00404219  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1575  hypothetical protein  30.86 
 
 
104 aa  44.3  0.0006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.323432  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>