More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1793 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  100 
 
 		 167 aa  329  1e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  67.11 
 
 		 163 aa  202  2e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  61.44 
 
 		 162 aa  201  5e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  62.25 
 
 		 163 aa  191  4e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  47.68 
 
 		 183 aa  156  1e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  47.26 
 
 		 170 aa  149  2e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  45.39 
 
 		 164 aa  148  4e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  47.86 
 
 		 164 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  47.4 
 
 		 158 aa  144  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  46.62 
 
 		 165 aa  143  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  47.06 
 
 		 148 aa  142  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  50.36 
 
 		 147 aa  142  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  43.59 
 
 		 159 aa  141  4e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  41.06 
 
 		 168 aa  137  7e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  46.43 
 
 		 168 aa  137  8.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  53.17 
 
 		 165 aa  136  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  47.86 
 
 		 165 aa  136  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  47.86 
 
 		 165 aa  136  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  43.97 
 
 		 167 aa  136  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  47.69 
 
 		 158 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3142  putative CheW protein  45.95 
 
 		 160 aa  134  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07620  putative CheW protein  41.45 
 
 		 165 aa  134  8e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000372381  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  46.92 
 
 		 158 aa  133  9e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  47.29 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1886  CheW protein  53.38 
 
 		 159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  45.32 
 
 		 165 aa  132  3e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  42.67 
 
 		 164 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  41.61 
 
 		 165 aa  129  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  41.61 
 
 		 165 aa  129  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  39.24 
 
 		 164 aa  127  7.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  42.28 
 
 		 154 aa  127  8.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  48.51 
 
 		 163 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  38.51 
 
 		 164 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  46.94 
 
 		 189 aa  126  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2285  CheW protein  44.12 
 
 		 141 aa  125  3e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.126917  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3073  CheW protein  46.32 
 
 		 136 aa  125  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325581 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  39.07 
 
 		 164 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  39.1 
 
 		 163 aa  124  4.0000000000000003e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2154  putative CheW protein  44.53 
 
 		 139 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  48.63 
 
 		 164 aa  124  7e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  40.28 
 
 		 161 aa  124  8.000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1773  CheW protein  43.45 
 
 		 161 aa  123  9e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0211  putative CheW protein  39.73 
 
 		 150 aa  122  2e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2175  CheW protein  50 
 
 		 166 aa  122  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.765903  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  42.76 
 
 		 518 aa  122  3e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2218  chemotaxis protein CheW  46.15 
 
 		 158 aa  121  4e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  38.46 
 
 		 161 aa  121  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  42.45 
 
 		 159 aa  120  6e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0990  CheW protein  43.62 
 
 		 173 aa  120  7e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.519788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  38.06 
 
 		 159 aa  120  8e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  38.06 
 
 		 159 aa  120  8e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  44.29 
 
 		 159 aa  120  8e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  38.06 
 
 		 159 aa  120  8e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  38.06 
 
 		 159 aa  120  8e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  40.28 
 
 		 164 aa  120  8e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0209  CheW protein  40 
 
 		 150 aa  120  9e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  36.77 
 
 		 159 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  37.91 
 
 		 163 aa  119  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1135  CheW protein  41.78 
 
 		 145 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  40.28 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2572  CheW protein  37.58 
 
 		 185 aa  118  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  39.26 
 
 		 164 aa  118  3e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  39.44 
 
 		 159 aa  118  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  39.58 
 
 		 164 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2307  CheW protein  42.76 
 
 		 164 aa  118  3.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  39.44 
 
 		 159 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  39.58 
 
 		 164 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  39.58 
 
 		 164 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2476  CheW protein  39.07 
 
 		 185 aa  118  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100144  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  39.58 
 
 		 164 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0878  CheW protein  37.5 
 
 		 192 aa  117  4.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00285186  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  41.84 
 
 		 163 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  38.19 
 
 		 164 aa  117  6e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01858  purine-binding chemotaxis protein  35.03 
 
 		 167 aa  117  7e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1753  CheW protein  35.03 
 
 		 167 aa  117  7e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00384276  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2120  purine-binding chemotaxis protein  35.03 
 
 		 167 aa  117  7e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000459496  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2626  purine-binding chemotaxis protein  35.03 
 
 		 167 aa  117  7e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.476506  hitchhiker  0.000000000506085 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1983  purine-binding chemotaxis protein  35.03 
 
 		 167 aa  117  7e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1745  purine-binding chemotaxis protein  35.03 
 
 		 167 aa  117  7e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  37.58 
 
 		 159 aa  117  7e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1297  purine-binding chemotaxis protein  35.03 
 
 		 167 aa  117  7e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.734506  hitchhiker  0.0000988763 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01847  hypothetical protein  35.03 
 
 		 167 aa  117  7e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0297243  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  41.67 
 
 		 169 aa  117  7.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  39.58 
 
 		 164 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  39.58 
 
 		 164 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  39.58 
 
 		 164 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  39.58 
 
 		 164 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  39.58 
 
 		 164 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2026  CheW protein  39.73 
 
 		 148 aa  116  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0166  CheW protein  36.67 
 
 		 174 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.521886 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1381  CheW protein  36.24 
 
 		 181 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.916051  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2973  CheW protein  38 
 
 		 175 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110924 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3317  CheW protein  39.74 
 
 		 166 aa  115  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2373  chemotaxis protein CheW  37.66 
 
 		 158 aa  115  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.158617  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2817  CheW protein  41.04 
 
 		 141 aa  115  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0744  CheW protein  40 
 
 		 170 aa  115  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0183  CheW protein  36 
 
 		 171 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3144  putative CheW protein  38.19 
 
 		 262 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1407  chemotaxis protein CheW  36.99 
 
 		 163 aa  114  5e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0899451 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1685  chemotaxis protein CheW  36.67 
 
 		 175 aa  114  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285902  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>