154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1772 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1772  N-acetylneuraminate synthase  100 
 
 
350 aa  719    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0774  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  73.91 
 
 
354 aa  546  1e-154  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.453022  normal  0.512992 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2229  N-acetylneuraminate synthase  57.14 
 
 
350 aa  420  1e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2097  neuB protein  54.28 
 
 
352 aa  385  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.268336  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3208  pseudaminic acid synthase  52.29 
 
 
351 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2327  N-acetylneuraminate synthase  54.52 
 
 
350 aa  372  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.463819 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1724  pseudaminic acid synthase  52.62 
 
 
349 aa  368  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000954999 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1523  N-acetylneuraminate synthase  53.76 
 
 
350 aa  367  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242955  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2213  pseudaminic acid synthase  53.01 
 
 
345 aa  364  1e-99  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0210  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  52.45 
 
 
349 aa  363  2e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.803069  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01550  N-acetylneuraminate synthase  53.78 
 
 
349 aa  363  2e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0492033 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1329  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  51.61 
 
 
358 aa  363  3e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0587  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  52.62 
 
 
349 aa  360  2e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.518416  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3027  pseudaminic acid synthase  50 
 
 
349 aa  360  2e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3098  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  52.91 
 
 
347 aa  358  8e-98  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.298576  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0647  antifreeze-like protein  52.02 
 
 
350 aa  356  3.9999999999999996e-97  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.318568  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1196  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  53.47 
 
 
350 aa  356  3.9999999999999996e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2625  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  51.62 
 
 
349 aa  355  5e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1248  N-acetylneuraminate synthase  50.15 
 
 
348 aa  352  4e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.862744  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3008  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  53.6 
 
 
350 aa  352  5e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1969  N-acetylneuraminate synthase  53.04 
 
 
364 aa  351  8.999999999999999e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0891356  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1304  N-acetylneuraminate synthase  49.71 
 
 
350 aa  351  1e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.583965  normal  0.823534 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2425  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  49.85 
 
 
345 aa  350  2e-95  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.149839  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1289  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  52.08 
 
 
350 aa  350  3e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1556  sialic acid synthase  52.1 
 
 
340 aa  348  9e-95  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3942  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  47.84 
 
 
349 aa  348  1e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0693356 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13043  sialic acid synthase  49.24 
 
 
338 aa  346  4e-94  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.276449  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3113  N-acetylneuraminic acid synthase-like protein  50.3 
 
 
359 aa  344  1e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2758  N-acetylneuraminate synthase  50.87 
 
 
348 aa  342  5.999999999999999e-93  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3707  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  53.76 
 
 
350 aa  342  8e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170147  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4269  pseudaminic acid synthase  50.88 
 
 
351 aa  339  4e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3076  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  50 
 
 
355 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1204  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  52.62 
 
 
346 aa  335  1e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3556  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  51.51 
 
 
358 aa  334  1e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.434108 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4303  N-acetylneuraminate synthase  52.91 
 
 
361 aa  330  3e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0660  N-acetylneuraminate synthase  46.2 
 
 
349 aa  327  2.0000000000000001e-88  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.297547  normal  0.963703 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0565  spore coat polysaccharide biosynthesis protein SpsE  52.91 
 
 
342 aa  322  5e-87  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3564  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  50.45 
 
 
343 aa  317  2e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1391  N-acetylneuraminate synthase  45.9 
 
 
337 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1512  N-acetylneuraminic acid synthetase  47.24 
 
 
343 aa  312  6.999999999999999e-84  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02907  NeuB:Antifreeze-like protein  45.19 
 
 
347 aa  308  1.0000000000000001e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.269494  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0169  N-acetylneuraminic acid synthetase  44.57 
 
 
344 aa  308  1.0000000000000001e-82  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0138828  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1334  N-acetylneuraminic acid synthetase  46.63 
 
 
343 aa  284  2.0000000000000002e-75  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0397  N-acetylneuraminic acid synthetase  45.71 
 
 
343 aa  282  6.000000000000001e-75  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.397069  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0643  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  45.16 
 
 
342 aa  266  5.999999999999999e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0756  N-acetylneuraminate synthase  42.64 
 
 
337 aa  264  2e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0420  N-acetylneuraminate synthase  40.54 
 
 
349 aa  258  1e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0818  N-acetylneuraminic acid condensing enzyme  38.99 
 
 
340 aa  245  6.999999999999999e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0789  N-acetylneuraminic acid condensing enzyme  38.99 
 
 
340 aa  239  4e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0527  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  41.27 
 
 
335 aa  239  4e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.783884  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2641  N-acetylneuraminate synthase  39.56 
 
 
330 aa  239  5.999999999999999e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0506  N-acetylneuraminate synthase  40 
 
 
348 aa  238  1e-61  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0131  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  39 
 
 
351 aa  238  1e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000538819 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3405  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  40.06 
 
 
358 aa  236  4e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1586  N-acetylneuraminate synthase  38.35 
 
 
347 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3980  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  40.29 
 
 
350 aa  232  6e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1235  flagellin modification protein PtmC, putative N-acetylneuraminic acid synthetase  38.39 
 
 
334 aa  231  1e-59  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000147783  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1516  N-acetylneuraminic acid synthetase  37.15 
 
 
334 aa  231  2e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.350916  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0631  N-acetylneuraminate synthase  38.98 
 
 
359 aa  228  1e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12451  sialic acid synthase  39.75 
 
 
337 aa  228  1e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0694401  hitchhiker  0.00593947 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0385  N-acetylneuraminic acid synthetase  36.53 
 
 
334 aa  224  2e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2303  general stress protein 14 (GSP14)  37.35 
 
 
333 aa  223  3e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0367  N-acetylneuraminate synthase  40.34 
 
 
360 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1970  polysaccharide biosynthesis protein, putative  38.3 
 
 
350 aa  218  1e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.237085  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001800  N-acetylneuraminate synthase  38.07 
 
 
357 aa  218  1e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16950  N-acetylneuraminate synthase  37.35 
 
 
331 aa  218  1e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4086  N-acetylneuraminate synthase  39.83 
 
 
363 aa  218  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0412  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  36.86 
 
 
338 aa  216  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.336797 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0049  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  38.35 
 
 
357 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1161  N-acetyl neuramic acid synthetase NeuB  35.2 
 
 
341 aa  213  2.9999999999999995e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3011  putative sialic acid synthase NeuB  37.61 
 
 
346 aa  213  2.9999999999999995e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.62069  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0562  N-acetylneuraminate synthase  38.99 
 
 
333 aa  213  2.9999999999999995e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0169  N-acetylneuraminic acid synthase  36.93 
 
 
357 aa  213  3.9999999999999995e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.922982  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0254  N-acetylneuraminic acid synthase  36.93 
 
 
357 aa  213  3.9999999999999995e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1580  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  39.36 
 
 
749 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1576  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  41.23 
 
 
350 aa  212  7e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3100  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  36.26 
 
 
357 aa  211  2e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1458  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  36.65 
 
 
334 aa  209  6e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0595  N-acetylneuraminate synthase  35.91 
 
 
333 aa  209  8e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1534  N-acetylneuraminate synthase  36.31 
 
 
332 aa  208  9e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1845  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  36.71 
 
 
344 aa  208  1e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0019  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  39.27 
 
 
350 aa  207  3e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1582  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  37.11 
 
 
359 aa  205  9e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.807685  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3232  polysialic acid capsule biosynthesis sialic acid synthase NeuB  35.58 
 
 
346 aa  205  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00670  sialic acid synthase  36.89 
 
 
333 aa  204  2e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1832  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  36.34 
 
 
394 aa  202  9e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2331  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  37.5 
 
 
332 aa  199  6e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1456  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  37.5 
 
 
354 aa  198  1.0000000000000001e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2590  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  36.53 
 
 
338 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139935 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2369  N-acetylneuraminate synthase  36.13 
 
 
348 aa  197  3e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0796873  normal  0.0101527 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0010  n-acetylneuraminate synthase  41.33 
 
 
303 aa  196  7e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.124512  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2977  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  36.59 
 
 
334 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3121  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  36.59 
 
 
334 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14081  sialic acid synthase  33.03 
 
 
341 aa  193  4e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4942  N-acetylneuraminate synthase  37.61 
 
 
748 aa  192  6e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3726  N-acetylneuraminic acid synthase domain  34.52 
 
 
338 aa  191  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3318  Sialic acid synthase-like protein  41.11 
 
 
672 aa  190  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.785348  normal  0.206825 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1072  sialic acid synthase  39.86 
 
 
293 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3256  N-acetylneuraminate synthase  33.72 
 
 
351 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2407  N-acetylneuraminate synthase  36.28 
 
 
500 aa  190  4e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.378262  normal  0.284066 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>