More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1733 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1733  hypothetical protein  100 
 
 
557 aa  1108    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00187554  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0233  2-octaprenylphenol hydroxylase  45.54 
 
 
554 aa  466  9.999999999999999e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0240  ABC-1 domain protein  48.46 
 
 
544 aa  462  1e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2586  ABC-1 domain protein  42.77 
 
 
562 aa  438  1e-121  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0295  ABC-1 domain protein  37.28 
 
 
558 aa  422  1e-117  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1612  ABC-1 domain protein  38.71 
 
 
557 aa  424  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.504596  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2561  ABC-1 domain protein  40.39 
 
 
558 aa  419  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4898  ABC1 family protein  35.96 
 
 
558 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1172  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  38.46 
 
 
558 aa  415  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1207  ABC transporter  37.94 
 
 
556 aa  415  1e-114  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.694462  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3247  ABC-1 domain protein  38.5 
 
 
558 aa  405  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000474003  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0760  2-octaprenylphenol hydroxylase  38 
 
 
561 aa  398  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1088  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  37.59 
 
 
561 aa  387  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0289446  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1388  hypothetical protein  35.37 
 
 
561 aa  387  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000298772  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3359  ABC-1 domain protein  37.16 
 
 
560 aa  381  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.779537 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0902  ABC-1 domain protein  37.1 
 
 
560 aa  380  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1648  2-octaprenylphenol hydroxylase  34.72 
 
 
559 aa  370  1e-101  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1110  ABC-1 domain protein  37.21 
 
 
599 aa  365  2e-99  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3377  ABC-1 domain protein  40.7 
 
 
557 aa  363  3e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.118171 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0578  hypothetical protein  42.69 
 
 
560 aa  361  2e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2342  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  36.67 
 
 
563 aa  360  3e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000602733  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2664  2-octaprenylphenol hydroxylase  34.66 
 
 
573 aa  357  2.9999999999999997e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.948881  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0631  hypothetical protein  43.16 
 
 
558 aa  357  2.9999999999999997e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.206757 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2071  ABC-1 domain protein  36.83 
 
 
581 aa  355  1e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0987216  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2578  2-octaprenylphenol hydroxylase  33.21 
 
 
559 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152488  normal  0.0679255 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2240  ABC-1 domain protein  40.2 
 
 
557 aa  354  2.9999999999999997e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.319336  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2150  ABC-1 domain protein  40.4 
 
 
557 aa  352  8.999999999999999e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.181383  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3425  hypothetical protein  38.53 
 
 
563 aa  350  3e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.416231  normal  0.872879 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1699  2-octaprenylphenol hydroxylase  39.96 
 
 
557 aa  349  6e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1536  ABC-1 domain protein  41.14 
 
 
556 aa  350  6e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0626  ABC-1 domain protein  37.85 
 
 
585 aa  348  2e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0324  ABC-1 domain protein  37.44 
 
 
581 aa  346  6e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0159  ABC-1 domain protein  37.85 
 
 
561 aa  344  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0155  ABC-1 domain protein  37.85 
 
 
584 aa  343  5.999999999999999e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00185412  normal  0.0113585 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0222  ABC-1 domain protein  36.35 
 
 
571 aa  341  2e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.164391  normal  0.703829 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12230  2-octaprenylphenol hydroxylase  32.5 
 
 
559 aa  340  2.9999999999999998e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0017  2-octaprenylphenol hydroxylase  37.39 
 
 
592 aa  340  5.9999999999999996e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.300768 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2885  ABC-1 domain protein  36.49 
 
 
582 aa  340  5.9999999999999996e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2106  hypothetical protein  39.41 
 
 
559 aa  339  9e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766182 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1871  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  37.31 
 
 
568 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2852  ubiquinone biosynthesis protein  35.64 
 
 
559 aa  338  9.999999999999999e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1005  hypothetical protein  32.85 
 
 
564 aa  337  1.9999999999999998e-91  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0249187 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1474  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  34.78 
 
 
561 aa  337  3.9999999999999995e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.604813 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00151  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  34.42 
 
 
558 aa  331  2e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3381  hypothetical protein  40.8 
 
 
578 aa  332  2e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1337  2-octaprenylphenol hydroxylase  37.21 
 
 
549 aa  331  2e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5555  2-octaprenylphenol hydroxylase  35.47 
 
 
584 aa  328  2.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3964  ABC-1 domain-containing protein  36.99 
 
 
561 aa  326  8.000000000000001e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0647  hypothetical protein  33.21 
 
 
565 aa  325  9e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000186884  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2519  hypothetical protein  34.79 
 
 
582 aa  319  7.999999999999999e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.416254 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0342  ABC1 family protein  36.05 
 
 
551 aa  319  9e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3956  ABC-1 domain protein  36.59 
 
 
552 aa  318  1e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.186201 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1807  hypothetical protein  32.91 
 
 
560 aa  317  3e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4176  hypothetical protein  35.31 
 
 
582 aa  317  4e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.118279  normal  0.965064 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0868  hypothetical protein  37.93 
 
 
582 aa  315  1.9999999999999998e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000924249  normal  0.0678292 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1598  hypothetical protein  35.26 
 
 
591 aa  314  2.9999999999999996e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.429743  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1760  ABC-1 domain-containing protein  33.75 
 
 
547 aa  311  1e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.794373  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1333  ABC-1 domain protein  36.4 
 
 
543 aa  310  4e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2681  hypothetical protein  33.63 
 
 
547 aa  310  5e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.259023 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1464  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  30.56 
 
 
555 aa  309  8e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00546242  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1021  hypothetical protein  35.81 
 
 
556 aa  307  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.396117  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0769  ABC-1 domain protein  35.81 
 
 
543 aa  307  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.477502 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0390  2-octaprenylphenol hydroxylase  33.73 
 
 
559 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1693  ABC-1 domain protein  37.1 
 
 
565 aa  302  1e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12515  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1043  hypothetical protein  32.84 
 
 
559 aa  301  1e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.135473  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5305  ABC-1 domain protein  37.1 
 
 
565 aa  302  1e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1817  hypothetical protein  31.99 
 
 
571 aa  301  3e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.457399  normal  0.0626146 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0994  2-octaprenylphenol hydroxylase  33.51 
 
 
559 aa  299  8e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.380493  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3335  ABC-1 domain protein  32.85 
 
 
549 aa  297  3e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0521538  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2852  hypothetical protein  31.51 
 
 
537 aa  296  9e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2537  hypothetical protein  31.69 
 
 
537 aa  296  9e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2950  ABC-1 domain protein  33.39 
 
 
549 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2767  ABC-1 domain protein  32.74 
 
 
549 aa  295  2e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5113  ABC-1 domain protein  34.9 
 
 
544 aa  294  3e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0400  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  35.71 
 
 
546 aa  293  6e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1973  ABC-1 domain protein  32.78 
 
 
547 aa  292  9e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.921372  normal  0.103811 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1310  ABC-1 domain protein  35.19 
 
 
562 aa  292  9e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1338  ABC-1 domain protein  35.19 
 
 
562 aa  292  9e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000328718 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1941  ABC-1 domain protein  32.86 
 
 
549 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3020  hypothetical protein  34.64 
 
 
544 aa  290  4e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0175  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  34.24 
 
 
551 aa  289  1e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.356136  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3415  hypothetical protein  34.96 
 
 
560 aa  286  5.999999999999999e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00362763 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1129  hypothetical protein  34.32 
 
 
586 aa  283  4.0000000000000003e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.755278  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4248  ABC-1 domain protein  35.13 
 
 
553 aa  284  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00077859  hitchhiker  0.0000000999881 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1067  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  36.81 
 
 
525 aa  282  1e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.487592  normal  0.456322 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4049  hypothetical protein  33.85 
 
 
556 aa  281  2e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.240057  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0856  hypothetical protein  33.2 
 
 
555 aa  280  4e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3884  ABC-1 domain protein  37.47 
 
 
556 aa  279  9e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.607083  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5397  2-octaprenylphenol hydroxylase  35.47 
 
 
501 aa  278  1e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.567178  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15860  predicted unusual protein kinase  33.46 
 
 
550 aa  274  2.0000000000000002e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2702  2-octaprenylphenol hydroxylase  33.83 
 
 
534 aa  275  2.0000000000000002e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136263 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1843  hypothetical protein  32.12 
 
 
549 aa  271  2e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.295975  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02769  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  33.75 
 
 
557 aa  271  2e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368527  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3494  2-octaprenylphenol hydroxylase  34.58 
 
 
530 aa  272  2e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2019  ubiquinone biosynthesis protein AarF  35.19 
 
 
542 aa  270  5.9999999999999995e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3417  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  34.67 
 
 
547 aa  268  2e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4010  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  36.09 
 
 
522 aa  268  2.9999999999999995e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000133652 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1098  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  32.48 
 
 
552 aa  268  2.9999999999999995e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.796665  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0825  ABC-1 domain protein  27.01 
 
 
558 aa  267  4e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1207  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  36.98 
 
 
553 aa  266  5e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.842555  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>