More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1715 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 
603 aa  1180    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3076  lytic transglycosylase catalytic  46.63 
 
 
777 aa  153  8.999999999999999e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.627553  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2641  lytic transglycosylase, catalytic  47.74 
 
 
833 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0399  Lytic transglycosylase catalytic  33.15 
 
 
574 aa  143  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2690  lytic transglycosylase catalytic  46.45 
 
 
800 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1707  Lytic transglycosylase catalytic  45.34 
 
 
782 aa  135  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2154  lytic transglycosylase, catalytic  41.03 
 
 
201 aa  124  4e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0579447  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2239  Lytic transglycosylase catalytic  39.38 
 
 
729 aa  124  7e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1888  Lytic transglycosylase catalytic  42.24 
 
 
195 aa  121  3.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2700  lytic transglycosylase, catalytic  37.96 
 
 
715 aa  120  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.232237  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1021  Lytic transglycosylase catalytic  41.4 
 
 
197 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0486  lytic transglycosylase catalytic  41.34 
 
 
748 aa  118  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.608773 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3051  lytic transglycosylase, catalytic  32.68 
 
 
731 aa  117  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2013  secreted protein  42.11 
 
 
187 aa  117  6e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2280  Slt family transglycosylase  40.64 
 
 
688 aa  116  1.0000000000000001e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2419  Lytic transglycosylase catalytic  40.62 
 
 
193 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0123719 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1837  lytic transglycosylase, catalytic  42.77 
 
 
182 aa  116  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.192263  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2073  Lytic transglycosylase catalytic  42.96 
 
 
195 aa  116  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000112057  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2248  Slt family transglycosylase  42.21 
 
 
181 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.469686  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2473  Lytic transglycosylase catalytic  40.76 
 
 
199 aa  114  7.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.84832e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2410  Lytic transglycosylase catalytic  34.21 
 
 
730 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3701  Lytic transglycosylase catalytic  34.21 
 
 
730 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.236251  normal  0.218254 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2602  lytic transglycosylase catalytic protein  36.4 
 
 
709 aa  112  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2131  soluble lytic transglycosylase  42.57 
 
 
690 aa  111  4.0000000000000004e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1407  lytic transglycosylase, catalytic  43.75 
 
 
179 aa  111  5e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.282461  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1439  Lytic transglycosylase catalytic  36.13 
 
 
187 aa  110  5e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1960  secreted protein  40.91 
 
 
181 aa  111  5e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1377  lytic transglycosylase, catalytic  33.47 
 
 
719 aa  110  8.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.010256 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0111  lytic transglycosylase catalytic  40.13 
 
 
690 aa  109  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00506838 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  43.48 
 
 
196 aa  109  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0717  lytic transglycosylase catalytic  33.04 
 
 
616 aa  109  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1378  lytic transglycosylase, catalytic  40.52 
 
 
661 aa  108  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.842597  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3087  lytic transglycosylase catalytic  42.75 
 
 
726 aa  108  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.522258  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2362  SLT domain-containing protein  40.4 
 
 
654 aa  107  6e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1778  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  37.89 
 
 
669 aa  107  6e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000296468  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2691  lytic transglycosylase, catalytic  36.9 
 
 
798 aa  107  6e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.463338  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0509  lytic transglycosylase, catalytic  40.54 
 
 
657 aa  106  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0558632 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1624  Lytic transglycosylase catalytic  39.02 
 
 
709 aa  106  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0525  Lytic transglycosylase catalytic  40.54 
 
 
657 aa  106  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  44.29 
 
 
260 aa  105  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1473  lytic transglycosylase, catalytic  41.45 
 
 
663 aa  105  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.985261  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1953  lytic transglycosylase catalytic  33.96 
 
 
756 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314899  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2529  lytic transglycosylase, catalytic  37.97 
 
 
642 aa  105  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1311  lytic transglycosylase, catalytic  35.14 
 
 
721 aa  105  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00111867  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2854  Lytic transglycosylase catalytic  31.22 
 
 
724 aa  105  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0924  lytic transglycosylase, catalytic  27.44 
 
 
663 aa  105  3e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  44.68 
 
 
282 aa  104  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0177  Lytic transglycosylase catalytic  41.61 
 
 
673 aa  104  5e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0429292  normal  0.082648 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2068  soluble lytic transglycosylase  39.86 
 
 
700 aa  104  5e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3295  putative transglycosylase  37.41 
 
 
678 aa  104  5e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.193265  normal  0.142457 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3860  lytic transglycosylase, catalytic  43.07 
 
 
329 aa  104  5e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1484  soluble lytic murein transglycosylase, putative  31.94 
 
 
747 aa  103  7e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.180895  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1906  lytic transglycosylase  41.51 
 
 
750 aa  103  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1595  lytic transglycosylase, catalytic  38.46 
 
 
190 aa  103  7e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0376  Lytic transglycosylase catalytic  35.02 
 
 
730 aa  103  8e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.15183 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  46.62 
 
 
260 aa  103  8e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2046  lytic transglycosylase, catalytic  31.76 
 
 
735 aa  103  8e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.490447  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4203  lytic transglycosylase, catalytic  39.19 
 
 
660 aa  103  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2348  Lytic transglycosylase catalytic  41.07 
 
 
763 aa  103  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0502018  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4220  Lytic transglycosylase catalytic  38.16 
 
 
735 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.11012 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2260  Lytic transglycosylase catalytic  41.1 
 
 
763 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1765  soluble lytic murein transglycosylase  31.93 
 
 
739 aa  102  2e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  45.71 
 
 
261 aa  102  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  44.37 
 
 
258 aa  102  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1262  lytic transglycosylase catalytic  39.19 
 
 
659 aa  102  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1135  lytic transglycosylase, catalytic  42.55 
 
 
677 aa  102  3e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.643084  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0716  soluble lytic murein transglycosylase precursor  29.97 
 
 
649 aa  101  3e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0046  Lytic transglycosylase catalytic  42.86 
 
 
244 aa  102  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2499  lytic transglycosylase  35.78 
 
 
661 aa  102  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  43.17 
 
 
196 aa  101  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1874  lytic transglycosylase, catalytic  27.25 
 
 
706 aa  101  4e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.331721  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1603  lytic transglycosylase  40.99 
 
 
830 aa  101  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.807223  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0150  putative lytic transglycosylase catalytic  34.08 
 
 
649 aa  100  6e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.862262  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2621  lytic transglycosylase catalytic  35.47 
 
 
650 aa  100  7e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.327163  normal  0.230885 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1070  Lytic transglycosylase catalytic  31.38 
 
 
716 aa  100  7e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2022  lytic transglycosylase, catalytic  39.13 
 
 
166 aa  100  8e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3413  Lytic transglycosylase catalytic  34.91 
 
 
661 aa  100  9e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439727  normal  0.575026 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0633  lytic transglycosylase catalytic  29.84 
 
 
649 aa  100  1e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.716649  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1895  soluble lytic murein transglycosylase, putative  35.48 
 
 
638 aa  100  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88018  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  41.91 
 
 
207 aa  100  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2058  Lytic transglycosylase catalytic  40.25 
 
 
750 aa  100  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.623161  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1973  Lytic transglycosylase catalytic  40.25 
 
 
750 aa  100  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  45.65 
 
 
217 aa  99  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2105  Lytic transglycosylase catalytic  39.73 
 
 
212 aa  99.4  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670803  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0652  lytic transglycosylase, catalytic  42 
 
 
707 aa  99.4  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0884  lytic transglycosylase, catalytic  34.84 
 
 
188 aa  99.4  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.10912  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2092  lytic transglycosylase, catalytic  33.12 
 
 
720 aa  99.4  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0230  soluble lytic murein transglycosylase  42.06 
 
 
648 aa  99.4  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0219  lytic transglycosylase, catalytic  38.31 
 
 
653 aa  98.6  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2905  lytic transglycosylase, catalytic  42.34 
 
 
237 aa  98.6  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.739036  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1065  Lytic transglycosylase catalytic  37.66 
 
 
698 aa  97.8  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  43.17 
 
 
226 aa  97.8  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1979  lytic transglycosylase, catalytic  37.82 
 
 
649 aa  97.8  5e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.99613 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  41.01 
 
 
251 aa  97.8  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0527  lytic transglycosylase, catalytic  38.51 
 
 
693 aa  97.4  6e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.379018 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14150  soluble lytic murein transglycosylase  31.56 
 
 
643 aa  97.4  6e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1088  lytic transglycosylase, catalytic  38.46 
 
 
653 aa  97.4  7e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2404  Lytic transglycosylase catalytic  44.68 
 
 
216 aa  97.1  8e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4098  lytic transglycosylase, catalytic  38.96 
 
 
590 aa  97.1  9e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0992  Lytic transglycosylase catalytic  41.22 
 
 
676 aa  97.1  9e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>