More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1694 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1694  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
340 aa  702    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.128471  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0564  glycosyl transferase family protein  54.63 
 
 
330 aa  347  2e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0250  glycosyl transferase family 2  42.51 
 
 
344 aa  231  1e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000000444925  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0584  glycosyl transferase family protein  41.95 
 
 
347 aa  216  5e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0121583  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0338  glycosyl transferase family 2  38.32 
 
 
288 aa  208  9e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.378739 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2933  family 2 glycosyl transferase  38.98 
 
 
284 aa  204  1e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.593138  normal  0.360179 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1643  glycosyl transferase family 2  36.9 
 
 
324 aa  202  6e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0313  rhamnosyl transferase related protein  39.87 
 
 
342 aa  201  9.999999999999999e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0691397 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0238  glycosyltransferase  36.36 
 
 
342 aa  200  3e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00200202  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1310  glycosyl transferase family protein  36.2 
 
 
342 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2356  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
346 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.934543  normal  0.35695 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2583  glycosyl transferase family 2  35.05 
 
 
330 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  36.96 
 
 
298 aa  176  4e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  35.33 
 
 
302 aa  176  5e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1725  putative rhamnosyltransferase  32.54 
 
 
311 aa  159  9e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0378366  normal  0.370128 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  33.83 
 
 
300 aa  154  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  35.69 
 
 
303 aa  154  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  36.33 
 
 
305 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
314 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  32.59 
 
 
722 aa  147  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2705  glycosyl transferase family 2  31.44 
 
 
334 aa  140  3e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00520476 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  31.29 
 
 
279 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2281  glycosyl transferase family 2  29.55 
 
 
282 aa  125  9e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.733627  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2138  glycosyl transferase family 2  31.41 
 
 
311 aa  125  1e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3217  glycosyl transferase family 2  29.01 
 
 
455 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3033  glycosyl transferase family protein  29.63 
 
 
308 aa  119  4.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.244321  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2441  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
290 aa  117  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  28.99 
 
 
320 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  31.27 
 
 
283 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2305  glycosyl transferase family 2  28.81 
 
 
291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.064621 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3852  glycosyl transferase family 2  27.98 
 
 
321 aa  113  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2745  glycosyl transferase family protein  31.14 
 
 
1267 aa  112  8.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.636531  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  26.58 
 
 
305 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2102  glycosyl transferase family protein  27.94 
 
 
489 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  28.44 
 
 
337 aa  110  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2677  glycosyl transferase family protein  30.37 
 
 
1267 aa  107  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3709  glycosyl transferase family 2  26.73 
 
 
307 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530664  normal  0.0910127 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1748  glycosyl transferase family protein  25.82 
 
 
300 aa  103  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1753  glycosyl transferase family protein  29.24 
 
 
297 aa  103  5e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.625707 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  26.73 
 
 
298 aa  101  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  29.85 
 
 
1523 aa  99  9e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2030  glycosyl transferase family 2  26.83 
 
 
303 aa  99  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.952561  hitchhiker  0.000668775 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0169  glycosyl transferase  27.88 
 
 
291 aa  98.6  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  27.34 
 
 
299 aa  98.6  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2074  glycosyl transferase family 2  28.15 
 
 
286 aa  97.8  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1949  glycosyl transferase family protein  27.7 
 
 
308 aa  97.4  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.535237 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0123  glycosyl transferase family protein  26.43 
 
 
346 aa  96.7  6e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000010329 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2759  glycosyl transferase family 2  29.33 
 
 
337 aa  94.7  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2875  glycosyl transferase family 2  28.83 
 
 
324 aa  94  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1328  glycosyl transferase family protein  29.04 
 
 
332 aa  93.2  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  27.3 
 
 
311 aa  92.8  7e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2967  glycosyl transferase family 2  28.83 
 
 
324 aa  92.8  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  26.07 
 
 
836 aa  91.7  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  28.52 
 
 
1523 aa  91.3  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  26.38 
 
 
318 aa  91.7  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  33.7 
 
 
299 aa  90.1  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0837  glycosyl transferase family protein  25.86 
 
 
330 aa  90.1  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0513  glycosyl transferase family protein  31.41 
 
 
355 aa  89.7  6e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.149546  normal  0.0426124 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  30.22 
 
 
1340 aa  89.4  8e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  22.6 
 
 
294 aa  89.4  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  27.61 
 
 
360 aa  88.6  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2648  glycosyl transferase family protein  31.16 
 
 
304 aa  88.6  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.747467  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  27.76 
 
 
340 aa  87.8  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
841 aa  87.4  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  29.12 
 
 
317 aa  87.8  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  25.75 
 
 
306 aa  87  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5292  glycosyl transferase family 2  28.03 
 
 
327 aa  87  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  27.21 
 
 
313 aa  85.9  8e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4143  glycosyl transferase family 2  24.73 
 
 
345 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000205364 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1795  glycosyl transferase family protein  31.52 
 
 
306 aa  84.3  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  25.82 
 
 
838 aa  84.3  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  27.72 
 
 
616 aa  84.3  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3779  glycosyl transferase family protein  25.9 
 
 
318 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  26.6 
 
 
841 aa  82.8  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2401  glycosyl transferase family protein  24.81 
 
 
340 aa  82  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4940  glycosyl transferase family protein  25.18 
 
 
336 aa  81.6  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3118  glycosyl transferase family protein  28.42 
 
 
334 aa  81.3  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1565  glycosyl transferase family 2  28.25 
 
 
970 aa  81.6  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000603283  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  26.62 
 
 
311 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3185  glycosyl transferase family protein  22.3 
 
 
297 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0518  family 2 glycosyl transferase  22.85 
 
 
754 aa  80.1  0.00000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00714685  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  27.66 
 
 
401 aa  79.7  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3336  glycosyl transferase family protein  29.23 
 
 
1268 aa  79.7  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0139  glycosyl transferase family protein  24.49 
 
 
319 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412068  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  25.09 
 
 
341 aa  78.6  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0353  glycosyl transferase family 2  26.54 
 
 
317 aa  79  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1579  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
318 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0619  glycosyl transferase, group 2 family protein  25 
 
 
311 aa  78.2  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773869  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07585  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.57 
 
 
379 aa  77.8  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.547919  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  27.74 
 
 
312 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0907  glycosyl transferase family protein  27.47 
 
 
415 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00249013  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1063  glycosyl transferase family 2  29.25 
 
 
305 aa  77.4  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.862808  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0773  glycosyl transferase family protein  24.74 
 
 
369 aa  77  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4741  glycosyl transferase family protein  23.81 
 
 
308 aa  77  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0841  glycosyl transferase family 2  25.67 
 
 
337 aa  77  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  26.16 
 
 
679 aa  77  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  24.57 
 
 
310 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0546  glycosyl transferase  27.48 
 
 
348 aa  76.6  0.0000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483878  normal  0.249879 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2016  glycosyl transferase family protein  23.81 
 
 
322 aa  76.6  0.0000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.12313  normal  0.993196 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4234  glycosyl transferase family protein  25.64 
 
 
310 aa  76.3  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0220827  hitchhiker  0.000823038 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>