68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1679 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1679  hypothetical protein  100 
 
 
143 aa  289  9e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000033772  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0186  hypothetical protein  38.94 
 
 
149 aa  89.4  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.894445 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0224  protein of unknown function DUF86  37.6 
 
 
130 aa  85.1  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3166  hypothetical protein  35.9 
 
 
133 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0245  protein of unknown function DUF86  32.58 
 
 
141 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3258  hypothetical protein  37.31 
 
 
139 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0115451  hitchhiker  2.57897e-16 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0762  hypothetical protein  35.66 
 
 
137 aa  72.8  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.120748 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2194  protein of unknown function DUF86  33.87 
 
 
143 aa  72.8  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000224954  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4417  hypothetical protein  34.35 
 
 
137 aa  71.6  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.126362 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2947  hypothetical protein  35.56 
 
 
140 aa  72  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0659  hypothetical protein  34.07 
 
 
140 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000879573  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1589  hypothetical protein  33.64 
 
 
145 aa  70.1  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0270  hypothetical protein  34.15 
 
 
147 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2977  protein of unknown function DUF86  32.81 
 
 
140 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1667  protein of unknown function DUF86  28.36 
 
 
139 aa  67.8  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5680  hypothetical protein  39.53 
 
 
137 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0684551  hitchhiker  0.00143143 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1311  hypothetical protein  32.09 
 
 
141 aa  67.4  0.00000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2423  hypothetical protein  40 
 
 
135 aa  67  0.00000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2568  protein of unknown function DUF86  30 
 
 
140 aa  64.3  0.0000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2243  hypothetical protein  29.63 
 
 
146 aa  64.3  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.125397  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0393  hypothetical protein  29.01 
 
 
142 aa  63.5  0.0000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.109457  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2344  protein of unknown function DUF86  39.08 
 
 
140 aa  63.2  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1671  protein of unknown function DUF86  29.6 
 
 
139 aa  63.2  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0134  hypothetical protein  33.6 
 
 
142 aa  62  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1074  hypothetical protein  39.05 
 
 
143 aa  62.4  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.673636  normal  0.243145 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0894  hypothetical protein  36.67 
 
 
139 aa  61.6  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2733  protein of unknown function DUF86  32.12 
 
 
138 aa  61.2  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.226128  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0128  protein of unknown function DUF86  29.79 
 
 
140 aa  60.5  0.000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00082454  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0768  hypothetical protein  31.25 
 
 
139 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0767  hypothetical protein  31.25 
 
 
139 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1588  protein of unknown function DUF86  30 
 
 
138 aa  58.9  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.181939  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3016  hypothetical protein  31.45 
 
 
131 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0210  hypothetical protein  35.87 
 
 
144 aa  58.2  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.281123  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1317  hypothetical protein  27.34 
 
 
138 aa  57.8  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2562  protein of unknown function DUF86  28.03 
 
 
138 aa  57.4  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2953  hypothetical protein  28.87 
 
 
146 aa  57  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1275  hypothetical protein  30.4 
 
 
140 aa  57  0.00000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000365533 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1396  protein of unknown function DUF86  30.47 
 
 
144 aa  56.6  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026346  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1470  protein of unknown function DUF86  30.65 
 
 
139 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.35466  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2352  hypothetical protein  27.64 
 
 
138 aa  55.8  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000399526  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0546  protein of unknown function DUF86  31.58 
 
 
151 aa  55.8  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000598911  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3653  hypothetical protein  33.33 
 
 
137 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.352214  normal  0.739112 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1251  protein of unknown function DUF86  30.43 
 
 
141 aa  55.5  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.414648 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4529  hypothetical protein  29.75 
 
 
132 aa  55.5  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.249791  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1815  hypothetical protein  29.6 
 
 
137 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000107502  normal  0.591641 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1971  protein of unknown function DUF86  29.01 
 
 
136 aa  54.3  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.190961 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1862  hypothetical protein  30.77 
 
 
139 aa  52.8  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2333  hypothetical protein  32.97 
 
 
136 aa  53.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1224  protein of unknown function DUF86  30.71 
 
 
142 aa  53.5  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0426  protein of unknown function DUF86  28.8 
 
 
283 aa  52  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0770  hypothetical protein  37.93 
 
 
143 aa  51.6  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.465688 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0363  hypothetical protein  28.24 
 
 
139 aa  51.2  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2164  hypothetical protein  27.03 
 
 
142 aa  50.8  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4098  hypothetical protein  31.01 
 
 
135 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.272071  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1736  hypothetical protein  34.23 
 
 
271 aa  48.5  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.76389  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0179  hypothetical protein  37.35 
 
 
128 aa  47.8  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00352921  normal  0.908992 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1792  hypothetical protein  32.94 
 
 
295 aa  47  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.210053 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2316  hypothetical protein  33.01 
 
 
105 aa  45.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0239991  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1769  hypothetical protein  26.24 
 
 
292 aa  43.5  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.026632  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0514  hypothetical protein  25.38 
 
 
144 aa  43.5  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1762  hypothetical protein  31.11 
 
 
276 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.254099  normal  0.270022 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2629  protein of unknown function DUF86  40.98 
 
 
85 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.436875  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1945  hypothetical protein  24.62 
 
 
131 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.755475  normal  0.160304 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1440  hypothetical protein  32.22 
 
 
252 aa  41.6  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0319  hypothetical protein  30.21 
 
 
142 aa  41.2  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2901  protein of unknown function DUF86  22.5 
 
 
145 aa  40.8  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0429  hypothetical protein  30.91 
 
 
141 aa  40.8  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0671683  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1106  hypothetical protein  27.27 
 
 
144 aa  40.4  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00999093  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>