More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1632 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2365  amidophosphoribosyltransferase  67.85 
 
 
474 aa  637    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1632  amidophosphoribosyltransferase  100 
 
 
469 aa  955    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0731  amidophosphoribosyltransferase  67.63 
 
 
478 aa  637    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0309  amidophosphoribosyltransferase  66.67 
 
 
473 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2047  amidophosphoribosyltransferase  63.15 
 
 
465 aa  572  1.0000000000000001e-162  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.330153 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1778  hypothetical protein  59.35 
 
 
475 aa  574  1.0000000000000001e-162  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000929805  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1249  amidophosphoribosyltransferase  58.15 
 
 
488 aa  563  1.0000000000000001e-159  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.917797  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1475  amidophosphoribosyltransferase  58.76 
 
 
472 aa  561  1e-158  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1448  amidophosphoribosyltransferase  57.21 
 
 
474 aa  540  9.999999999999999e-153  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1891  amidophosphoribosyltransferase  55.04 
 
 
477 aa  526  1e-148  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3743  amidophosphoribosyltransferase  58.63 
 
 
466 aa  526  1e-148  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000189021 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1511  amidophosphoribosyltransferase  58.19 
 
 
466 aa  521  1e-147  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.409813  normal  0.0292739 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2329  amidophosphoribosyltransferase  55.04 
 
 
477 aa  524  1e-147  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.64237  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1939  amidophosphoribosyltransferase  55.46 
 
 
466 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1636  amidophosphoribosyltransferase  55.68 
 
 
467 aa  512  1e-144  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2068  amidophosphoribosyltransferase  53.01 
 
 
474 aa  513  1e-144  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.286768  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4571  amidophosphoribosyltransferase  54.8 
 
 
468 aa  514  1e-144  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.470676  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2702  amidophosphoribosyltransferase  55.56 
 
 
475 aa  514  1e-144  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1222  amidophosphoribosyltransferase  53.91 
 
 
472 aa  511  1e-143  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.433131  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1326  amidophosphoribosyltransferase  54.3 
 
 
468 aa  511  1e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2184  amidophosphoribosyltransferase  52.85 
 
 
487 aa  509  1e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4318  amidophosphoribosyltransferase  53.48 
 
 
496 aa  508  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0522  amidophosphoribosyltransferase  52.05 
 
 
465 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1196  amidophosphoribosyltransferase  53.24 
 
 
472 aa  506  9.999999999999999e-143  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1415  amidophosphoribosyltransferase  52.8 
 
 
472 aa  502  1e-141  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4178  amidophosphoribosyltransferase  53.73 
 
 
494 aa  503  1e-141  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8991  amidophosphoribosyltransferase  54.37 
 
 
478 aa  502  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4217  amidophosphoribosyltransferase  53.73 
 
 
494 aa  503  1e-141  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2109  amidophosphoribosyltransferase  52.76 
 
 
475 aa  503  1e-141  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1153  amidophosphoribosyltransferase  54.44 
 
 
474 aa  503  1e-141  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1766  amidophosphoribosyltransferase  55.87 
 
 
488 aa  500  1e-140  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0501857 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2807  amidophosphoribosyltransferase  52.53 
 
 
462 aa  500  1e-140  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1136  amidophosphoribosyltransferase  55.26 
 
 
470 aa  500  1e-140  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3699  amidophosphoribosyltransferase  53.39 
 
 
493 aa  498  1e-140  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.549743  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22120  amidophosphoribosyltransferase  52.59 
 
 
480 aa  497  1e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.357347  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0004  amidophosphoribosyltransferase  53.17 
 
 
493 aa  497  1e-139  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.645305  normal  0.0907172 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0260  amidophosphoribosyltransferase  53.67 
 
 
470 aa  495  1e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3343  amidophosphoribosyltransferase  54.35 
 
 
502 aa  495  1e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3588  amidophosphoribosyltransferase  53.9 
 
 
503 aa  494  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.51846 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0674  amidophosphoribosyltransferase  52.98 
 
 
473 aa  492  9.999999999999999e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0398  amidophosphoribosyltransferase  54.87 
 
 
480 aa  492  9.999999999999999e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0334  amidophosphoribosyltransferase  53.32 
 
 
462 aa  490  1e-137  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.708549  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4621  amidophosphoribosyltransferase  52.19 
 
 
482 aa  491  1e-137  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.059877  normal  0.48412 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0063  amidophosphoribosyltransferase  55.41 
 
 
472 aa  489  1e-137  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0672  amidophosphoribosyltransferase  52.76 
 
 
473 aa  491  1e-137  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2747  amidophosphoribosyltransferase  53.3 
 
 
484 aa  486  1e-136  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3396  amidophosphoribosyltransferase  52.41 
 
 
492 aa  487  1e-136  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0321  amidophosphoribosyltransferase  51.43 
 
 
461 aa  486  1e-136  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0007  amidophosphoribosyltransferase  53.56 
 
 
487 aa  486  1e-136  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30048  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1147  amidophosphoribosyltransferase  50.11 
 
 
478 aa  482  1e-135  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.218005  normal  0.314166 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0396  amidophosphoribosyltransferase  50.33 
 
 
459 aa  482  1e-135  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2064  amidophosphoribosyltransferase  52.58 
 
 
475 aa  478  1e-134  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0324  amidophosphoribosyltransferase  51.78 
 
 
471 aa  481  1e-134  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0368  amidophosphoribosyltransferase  51.78 
 
 
471 aa  481  1e-134  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0282  amidophosphoribosyltransferase  51.78 
 
 
471 aa  481  1e-134  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0267  amidophosphoribosyltransferase  51.78 
 
 
471 aa  481  1e-134  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0270  amidophosphoribosyltransferase  51.78 
 
 
471 aa  481  1e-134  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3637  amidophosphoribosyltransferase  52.19 
 
 
499 aa  479  1e-134  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.811729 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1102  amidophosphoribosyltransferase  53.39 
 
 
466 aa  480  1e-134  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0276  amidophosphoribosyltransferase  51.11 
 
 
471 aa  478  1e-134  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0295  amidophosphoribosyltransferase  51.78 
 
 
471 aa  481  1e-134  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.312701  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0327  amidophosphoribosyltransferase  51.78 
 
 
471 aa  481  1e-134  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1722  amidophosphoribosyltransferase  52.58 
 
 
481 aa  478  1e-134  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.56305  normal  0.196104 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0341  amidophosphoribosyltransferase  51.56 
 
 
471 aa  478  1e-134  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4979  amidophosphoribosyltransferase  51.78 
 
 
471 aa  481  1e-134  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1523  amidophosphoribosyltransferase  50.11 
 
 
459 aa  476  1e-133  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0119394  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2307  amidophosphoribosyltransferase  49.67 
 
 
467 aa  478  1e-133  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0228  amidophosphoribosyltransferase  52.32 
 
 
478 aa  478  1e-133  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.629689  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3735  amidophosphoribosyltransferase  51.41 
 
 
558 aa  477  1e-133  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3474  amidophosphoribosyltransferase  51.41 
 
 
563 aa  475  1e-133  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2599  amidophosphoribosyltransferase  52.95 
 
 
499 aa  473  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0391838  normal  0.218764 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0296  amidophosphoribosyltransferase  51.19 
 
 
505 aa  474  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0274  amidophosphoribosyltransferase  50.67 
 
 
471 aa  472  1e-132  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0292  amidophosphoribosyltransferase  50.66 
 
 
459 aa  473  1e-132  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.95663  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0997  amidophosphoribosyltransferase  53.08 
 
 
482 aa  473  1e-132  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.421996  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0824  amidophosphoribosyltransferase  52.21 
 
 
488 aa  474  1e-132  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0228  amidophosphoribosyltransferase  51.54 
 
 
470 aa  473  1e-132  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000396195  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4387  amidophosphoribosyltransferase  52.16 
 
 
500 aa  474  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2072  amidophosphoribosyltransferase  53.28 
 
 
506 aa  472  1e-132  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37880  amidophosphoribosyltransferase  50.98 
 
 
512 aa  469  1.0000000000000001e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.458178 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0439  amidophosphoribosyltransferase  49.34 
 
 
459 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08960  amidophosphoribosyltransferase  52.3 
 
 
496 aa  471  1.0000000000000001e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0468  amidophosphoribosyltransferase  49.45 
 
 
456 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.350158  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0878  glutamine phosphoribosylpyrophosphate amidotransferase  50.77 
 
 
503 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.141495  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0265  amidophosphoribosyltransferase  50.9 
 
 
476 aa  470  1.0000000000000001e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5049  amidophosphoribosyltransferase  51.87 
 
 
534 aa  465  9.999999999999999e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0094  amidophosphoribosyltransferase  52.05 
 
 
544 aa  468  9.999999999999999e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0300  amidophosphoribosyltransferase  51.36 
 
 
498 aa  468  9.999999999999999e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1389  amidophosphoribosyltransferase  50.55 
 
 
479 aa  467  9.999999999999999e-131  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.254172  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4629  amidophosphoribosyltransferase  52.3 
 
 
500 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.691036  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2878  amidophosphoribosyltransferase  49.79 
 
 
517 aa  468  9.999999999999999e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.116336 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1032  amidophosphoribosyltransferase  49.78 
 
 
495 aa  464  1e-129  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06050  amidophosphoribosyltransferase  50.64 
 
 
518 aa  463  1e-129  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.203247  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4758  amidophosphoribosyltransferase  51.43 
 
 
512 aa  465  1e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3089  amidophosphoribosyltransferase  50.54 
 
 
515 aa  461  1e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4206  amidophosphoribosyltransferase  52.8 
 
 
485 aa  463  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.975393  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3932  amidophosphoribosyltransferase  51.65 
 
 
491 aa  462  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.961822  normal  0.0894126 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2997  amidophosphoribosyltransferase  51.2 
 
 
514 aa  461  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.807987  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5114  amidophosphoribosyltransferase  49.68 
 
 
510 aa  461  1e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0638191  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0724  amidophosphoribosyltransferase  50.77 
 
 
500 aa  464  1e-129  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00225283  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>