More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1570 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1570  Na+/solute symporter  100 
 
 		 693 aa  1395    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1063  Na+/solute symporter  40.74 
 
 		 614 aa  353  7e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0264456  normal  0.304939 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2131  Na+/solute symporter  40.85 
 
 		 492 aa  217  5.9999999999999996e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6322  SSS sodium solute transporter superfamily  40.86 
 
 		 499 aa  207  7e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.950827  normal  0.754029 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3375  Na+/solute symporter  38.34 
 
 		 580 aa  203  8e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0355  Na+/solute symporter  46.9 
 
 		 505 aa  201  3e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2141  Na+/solute symporter  55.06 
 
 		 580 aa  201  6e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.598944  normal  0.213031 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5011  Na+/solute symporter  40.33 
 
 		 546 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000410087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4053  Na+/solute symporter  51.27 
 
 		 578 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4282  Na+/solute symporter  51.27 
 
 		 578 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4128  Na+/solute symporter  51.27 
 
 		 578 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0931478  normal  0.469675 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4562  Na+/solute symporter  55.81 
 
 		 580 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0697  Na+/solute symporter  54.79 
 
 		 580 aa  196  1e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4497  Na+/solute symporter  53.77 
 
 		 546 aa  194  5e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.108837  normal  0.145875 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0069  Na+/solute symporter  51.83 
 
 		 603 aa  194  7e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3170  Na+/solute symporter  39.19 
 
 		 575 aa  190  7e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0609078  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5280  Na+/solute symporter  40.14 
 
 		 573 aa  182  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.135801  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12120  predicted symporter  35.61 
 
 		 591 aa  177  5e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.593677  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4131  Na+/solute symporter  45.66 
 
 		 551 aa  177  8e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2860  putative transmembrane transport protein  36.61 
 
 		 562 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00253612  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1155  Na+/solute symporter  45.06 
 
 		 495 aa  176  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2269  Na+/solute symporter  26.03 
 
 		 683 aa  173  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0596593  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2098  SSS sodium solute transporter superfamily  26.47 
 
 		 687 aa  172  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.275416 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1774  Na+/solute symporter  26.85 
 
 		 687 aa  172  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1391  Na+/solute symporter  50 
 
 		 488 aa  171  4e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000394975 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1373  Na+/solute symporter  36.91 
 
 		 498 aa  170  6e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1087  Na+/solute symporter  26.82 
 
 		 671 aa  167  4e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.215072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2647  SSS sodium solute transporter superfamily  25.11 
 
 		 681 aa  167  4e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.81017  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3111  solute/Na+ symporter  27.76 
 
 		 672 aa  167  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0392033  decreased coverage  0.0000204813 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1951  solute:Na+ symporter permease transmembrane protein  25.98 
 
 		 688 aa  165  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.788395  normal  0.806133 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00890  predicted symporter  43.98 
 
 		 579 aa  164  7e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1418  Na+/solute symporter  27.09 
 
 		 672 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.181341 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1936  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.93 
 
 		 672 aa  163  9e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2015  sodium:solute symporter family protein  25.82 
 
 		 671 aa  162  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168656  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2228  Na+/solute symporter  26.58 
 
 		 671 aa  161  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1637  Na+/solute symporter  25.81 
 
 		 678 aa  160  7e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.75635 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5888  Na+/solute symporter  26.38 
 
 		 671 aa  160  8e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2189  Na+/solute symporter  26.38 
 
 		 671 aa  160  8e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0630  solute/sodium symporter (SSS) family protein  26.15 
 
 		 671 aa  159  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.449761  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1525  putative membrane transport protein  25.82 
 
 		 713 aa  159  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.11543 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1940  sodium:solute symporter family protein  26.15 
 
 		 807 aa  159  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5518  Na+/solute symporter  26.2 
 
 		 671 aa  159  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.703917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2214  Na+/solute symporter  26.2 
 
 		 671 aa  158  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.397969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0532  solute/sodium symporter (SSS) family protein  26.12 
 
 		 671 aa  158  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2052  solute/sodium symporter (SSS) family protein  26.12 
 
 		 671 aa  157  6e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.483179  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1792  sodium:solute symporter family protein  26.12 
 
 		 671 aa  157  6e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.415447  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2228  Na+/solute symporter  25.49 
 
 		 683 aa  157  6e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1079  sodium:solute symporter family protein  26.12 
 
 		 671 aa  157  6e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105225  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0786  solute/sodium symporter (SSS) family protein  26.12 
 
 		 671 aa  157  6e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2107  Na+/solute symporter  26.35 
 
 		 671 aa  157  7e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.911895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2831  Na+/solute symporter  25.21 
 
 		 703 aa  148  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3039  Na+/solute symporter  24.64 
 
 		 703 aa  145  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2096  Na+/solute symporter  30.19 
 
 		 590 aa  139  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.566252  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2396  Na+/solute symporter  23.46 
 
 		 726 aa  133  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.79359 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3139  Na+ symporter  28.5 
 
 		 637 aa  131  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0827  SSS sodium solute transporter superfamily  31.29 
 
 		 513 aa  126  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2052  Na+/solute symporter  23.99 
 
 		 702 aa  125  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.698797  normal  0.324787 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1718  SSS sodium solute transporter superfamily  30.7 
 
 		 511 aa  125  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3760  SSS sodium solute transporter superfamily  34.15 
 
 		 541 aa  125  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2764  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  34.26 
 
 		 518 aa  124  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.286695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3836  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  35.66 
 
 		 539 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.808948 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3843  SSS sodium solute transporter superfamily  34.45 
 
 		 541 aa  125  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1118  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  37.44 
 
 		 552 aa  124  6e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.191913  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0428  Na+/solute symporter  33.46 
 
 		 559 aa  123  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00400759  decreased coverage  0.0000917486 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4127  SSS sodium solute transporter superfamily  34.63 
 
 		 561 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3703  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  35.49 
 
 		 541 aa  121  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0004  acetate permease  30.86 
 
 		 548 aa  122  3e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.415194  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4785  SSS sodium solute transporter superfamily  31.6 
 
 		 563 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.782319  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5210  SSS sodium solute transporter superfamily  31.6 
 
 		 563 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0635  acetate permease  31.72 
 
 		 559 aa  121  4.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.953483  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2352  sodium/solute symporter family protein  31.33 
 
 		 584 aa  120  7.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03939  acetate permease  31.48 
 
 		 549 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.68156  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5596  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.7 
 
 		 560 aa  120  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03899  hypothetical protein  31.48 
 
 		 549 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.790578  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4010  acetate permease  31.39 
 
 		 557 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.642464 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4529  acetate permease  31.48 
 
 		 549 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4311  acetate permease  31.48 
 
 		 549 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5572  acetate permease  31.48 
 
 		 549 aa  119  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1746  Na+/solute symporter  37.56 
 
 		 572 aa  118  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000905196 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2838  Na+/solute symporter  38.07 
 
 		 572 aa  118  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000149628 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3960  acetate permease  31.48 
 
 		 549 aa  119  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.221467 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1397  SSS sodium solute transporter superfamily  31.25 
 
 		 665 aa  119  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000364072  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4622  acetate permease  31.48 
 
 		 549 aa  119  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4533  acetate permease  31.48 
 
 		 549 aa  118  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.612121  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1696  Na+/solute symporter  38.07 
 
 		 572 aa  118  3.9999999999999997e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2638  Na+/solute symporter  37.56 
 
 		 578 aa  118  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1454  acetate permease  29.29 
 
 		 554 aa  118  3.9999999999999997e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.253764  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2673  Na+/solute symporter  37.56 
 
 		 578 aa  118  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1711  Na+/solute symporter  37.56 
 
 		 578 aa  118  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.18634  hitchhiker  0.000000238348 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4668  acetate permease  31.48 
 
 		 549 aa  118  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.962936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2752  Na+/solute symporter  37.56 
 
 		 578 aa  118  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0107032 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4526  acetate permease  31.48 
 
 		 549 aa  118  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4617  acetate permease  31.48 
 
 		 549 aa  118  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.825598  normal  0.309264 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2371  Na+/solute symporter  38.07 
 
 		 572 aa  118  5e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000181178 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2866  acetate permease  31.92 
 
 		 666 aa  117  5e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0150163 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1850  SSS sodium solute transporter superfamily  30.87 
 
 		 513 aa  117  5e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4619  acetate permease  31.48 
 
 		 549 aa  118  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2050  Na+/solute symporter  37.43 
 
 		 593 aa  117  6e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.500291 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1490  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  33.94 
 
 		 516 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0960795  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1480  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  33.94 
 
 		 516 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>