62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1552 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1552  YibE/F family protein  100 
 
 
392 aa  772  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  1.66872e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2717  YibE/F family protein  53.35 
 
 
393 aa  375  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00980244  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2866  YibE/F family protein  45.86 
 
 
451 aa  327  3e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.405695  hitchhiker  3.97965e-13 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1717  YibE/F family protein  38.79 
 
 
373 aa  243  5e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000872311  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2256  hypothetical protein  37.08 
 
 
393 aa  225  1e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000922663  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1617  YbiE/YbiF family membrane protein  33.52 
 
 
382 aa  211  2e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0997624  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1156  YibE/F family protein  34.2 
 
 
385 aa  205  1e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4236  YibE/F family protein  34.28 
 
 
409 aa  196  4e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01199  hypothetical protein  30.85 
 
 
396 aa  189  7e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2695  hypothetical protein  34.1 
 
 
434 aa  187  4e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18650  predicted multitransmembrane protein  35.85 
 
 
404 aa  174  2e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.221349  normal  0.497385 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0923  YibE/F family protein  30.52 
 
 
381 aa  168  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0732684  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0513  YibE/F family protein  34.3 
 
 
386 aa  167  4e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0869  hypothetical protein  34.67 
 
 
370 aa  164  2e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0893767  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0625  YibE/F family protein  30.87 
 
 
416 aa  163  5e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0617008  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1217  multitransmembrane protein-like  32.82 
 
 
395 aa  154  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0616  YibE/F family protein  33.43 
 
 
436 aa  145  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2291  YibE/F family protein  32.09 
 
 
396 aa  145  2e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15190  predicted multitransmembrane protein  32.16 
 
 
397 aa  144  3e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0772315 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1706  YibE/F family protein  32.46 
 
 
513 aa  139  7e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1474  YibE/F family protein  36.54 
 
 
345 aa  134  2e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.649458  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36270  predicted multitransmembrane protein  34.57 
 
 
484 aa  130  3e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0460  YibE/F family protein  32.4 
 
 
563 aa  130  4e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0532  YibE/F family protein  31.99 
 
 
449 aa  127  2e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.155623  normal  0.0605973 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0444  YibE/F family protein  32.06 
 
 
448 aa  128  2e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.701723  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2203  YibE/F family protein  31.27 
 
 
599 aa  126  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1777  YibE/F family protein  31.84 
 
 
422 aa  125  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0836045  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1371  YibE/F family protein  28.18 
 
 
484 aa  125  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.98866e-12 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2084  YibE/F family protein  31.37 
 
 
446 aa  125  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0158953  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0106  hypothetical protein  27.16 
 
 
370 aa  123  6e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0151  YibE/F family protein  31.64 
 
 
438 aa  123  7e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0309546 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3598  YibE/F family protein  31.67 
 
 
428 aa  122  9e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0292  YibE/F family protein  34.4 
 
 
404 aa  121  2e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.502683  normal  0.0969675 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5754  YibE/F family protein  30.96 
 
 
404 aa  120  6e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0504  hypothetical protein  26.16 
 
 
370 aa  118  1e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.36708  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0491  hypothetical protein  26.16 
 
 
370 aa  118  1e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.696499  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4407  YibE/F family protein  31.68 
 
 
447 aa  119  1e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.689016  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1335  YibE/F family protein  28.57 
 
 
499 aa  117  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2506  YibE/F family protein  30.1 
 
 
406 aa  115  1e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.416194  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4623  YibE/F family protein  31.61 
 
 
427 aa  113  5e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0949625  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0164  YibE/F family protein  35.96 
 
 
416 aa  101  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00530836 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0450  YibE/F family protein  30.82 
 
 
424 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0441383 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0440  YibE/F-like protein  30.82 
 
 
424 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.270973  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0105  hypothetical protein  27.91 
 
 
261 aa  99.8  7e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0427  YibE/F family protein  30.21 
 
 
410 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.550828  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0458  YibE/F family protein  26.01 
 
 
371 aa  98.6  2e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  6.50445e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1586  YibE/F family protein  32.54 
 
 
480 aa  96.7  7e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.728201  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0617  YibE/F family protein  29.08 
 
 
411 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225708  normal  0.665044 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0503  hypothetical protein  26.73 
 
 
260 aa  93.2  8e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.84165  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0490  hypothetical protein  26.73 
 
 
260 aa  93.2  8e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.45051  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3310  YibE/F family protein  30.07 
 
 
386 aa  92.4  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0281  YibE/F family protein  29.84 
 
 
413 aa  92  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.715715  normal  0.837418 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0110  multitransmembrane protein  21.47 
 
 
360 aa  82.8  9e-15  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  1.56468e-13 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0533  multitransmembrane protein  25.89 
 
 
258 aa  75.1  2e-12  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2300  YibE/F family protein  29.61 
 
 
376 aa  72  2e-11  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  6.81983e-08  normal  0.658547 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0532  multitransmembrane protein  26.57 
 
 
361 aa  70.5  6e-11  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0111  multitransmembrane protein  25 
 
 
253 aa  67.4  5e-10  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  4.23826e-15 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0364  multitransmembrane protein  21 
 
 
365 aa  62  2e-08  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0459  YibE/F family protein  24.28 
 
 
257 aa  60.8  4e-08  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  1.10124e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0365  multitransmembrane protein  22.49 
 
 
258 aa  58.2  3e-07  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0867  hypothetical protein  24.09 
 
 
253 aa  55.5  1e-06  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0890076  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0866  hypothetical protein  23.7 
 
 
372 aa  52.4  1e-05  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>