65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1499 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1499  gas vesicle protein GVPa  100 
 
 		 76 aa  143  7.0000000000000006e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1498  gas vesicle protein GVPa  98.53 
 
 		 75 aa  129  2.0000000000000002e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.921273  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0078  gas vesicle synthesis protein GvpA  74.6 
 
 		 71 aa  96.7  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00750449  normal  0.0121047 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0079  gas vesicle synthesis protein GvpA  73.02 
 
 		 71 aa  96.3  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0130989  normal  0.0117948 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1821  gas vesicle synthesis protein GvpA  74.6 
 
 		 68 aa  96.3  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00228865  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1820  gas vesicle synthesis protein GvpA  74.6 
 
 		 68 aa  96.3  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000245848  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1819  gas vesicle synthesis protein GvpA  74.6 
 
 		 68 aa  96.3  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00075778  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1818  gas vesicle synthesis protein GvpA  74.6 
 
 		 68 aa  96.3  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025131  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0686  gas vesicle synthesis protein GvpA  73.02 
 
 		 68 aa  94.7  3e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0189096  normal  0.509379 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0688  gas vesicle synthesis protein GvpA  73.02 
 
 		 68 aa  95.1  3e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0200953  normal  0.76733 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0689  gas vesicle synthesis protein GvpA  73.02 
 
 		 68 aa  95.1  3e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.021084  normal  0.764349 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2325  gas vesicle synthesis protein GvpA  70.42 
 
 		 72 aa  94  7e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740835  unclonable  0.0000203995 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1253  gas vesicle synthesis protein GvpA  75.81 
 
 		 72 aa  93.2  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.13379 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3016  gas vesicle protein GVPa  73.02 
 
 		 71 aa  92.8  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2324  gas vesicle synthesis protein GvpA  69.84 
 
 		 75 aa  91.3  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000000112837  hitchhiker  0.000242369 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1748  gas vesicle synthesis protein GvpA  72.58 
 
 		 72 aa  91.3  4e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2839  gas vesicle synthesis protein GvpA  65.22 
 
 		 72 aa  91.3  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3114  gas vesicle protein GVPa  63.77 
 
 		 94 aa  88.6  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2374  gas vesicle protein GVPa  62.32 
 
 		 96 aa  86.3  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0334  gas vesicle protein GVPa  64.41 
 
 		 95 aa  86.7  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0327  gas vesicle synthesis protein GvpA  69.49 
 
 		 76 aa  86.3  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.516569 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0326  gas vesicle synthesis protein GvpA  69.49 
 
 		 76 aa  86.3  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0328  gas vesicle synthesis protein GvpA  69.49 
 
 		 76 aa  86.3  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.518273 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3255  gas vesicle synthesis protein GvpA  65.08 
 
 		 70 aa  85.5  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0851861 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3573  gas vesicle synthesis protein GvpA  65.08 
 
 		 70 aa  85.5  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.862983  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2404  gas vesicle protein GVPa  66.67 
 
 		 98 aa  84.7  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0060  gas vesicle synthesis protein GvpA  66.67 
 
 		 76 aa  82.8  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.537884  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0061  gas vesicle synthesis protein GvpA  63.33 
 
 		 74 aa  82  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0062  gas vesicle synthesis protein GvpA  63.33 
 
 		 74 aa  82  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0063  gas vesicle synthesis protein GvpA  63.33 
 
 		 74 aa  82  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4706  gas vesicle protein GVPa  65.45 
 
 		 138 aa  72.4  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.783958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2381  gas vesicle synthesis-like protein  54.39 
 
 		 139 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.528325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2375  gas vesicle synthesis-like protein  54.39 
 
 		 139 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.721458  normal  0.751022 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2334  gas vesicle synthesis-like protein  54.39 
 
 		 139 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4008  gas vesicle synthesis-like protein  53.73 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1006  gas vesicle synthesis-like protein  46.67 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6855  hypothetical protein  60.38 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479937  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3382  gas vesicle protein GVPa  56.14 
 
 		 133 aa  64.7  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0355765  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2356  gas vesicle protein GVPa  53.7 
 
 		 137 aa  63.5  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0939575 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2323  gas vesicle protein GVPa  56.25 
 
 		 54 aa  59.7  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.0000151045  hitchhiker  0.000256299 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1489  gas vesicle protein GVPa  39.66 
 
 		 126 aa  50.4  0.000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.510909  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3025  gas vesicle protein GVPa  44.83 
 
 		 123 aa  50.4  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.749024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0335  hypothetical protein  43.14 
 
 		 138 aa  47.8  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.942024 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0070  gas vesicle protein GVPa  47.92 
 
 		 126 aa  47  0.00009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.471557  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2828  gas vesicle protein GVPa  49.02 
 
 		 121 aa  46.2  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3580  gas vesicle protein GVPa  48.08 
 
 		 104 aa  45.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2825  gas vesicle protein GVPa  41.67 
 
 		 75 aa  45.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2405  gas vesicle protein GVPa  47.27 
 
 		 119 aa  44.3  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3264  gas vesicle protein GVPa  46.15 
 
 		 104 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.800769  normal  0.701046 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0339  gas vesicle protein GVPa  38.6 
 
 		 152 aa  43.9  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0071  gas vesicle protein GVPa  38.78 
 
 		 230 aa  43.5  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0463018  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0339  hypothetical protein  39.22 
 
 		 181 aa  42.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.881514  normal  0.486472 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2369  gas vesicle protein GVPa  44.68 
 
 		 201 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1262  gas vesicle protein GVPa  38.46 
 
 		 101 aa  42  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.026389  normal  0.71927 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4702  gas vesicle protein GVPa  47.73 
 
 		 114 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3022  gas vesicle protein GVPa  37.25 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0685  hypothetical protein  65.52 
 
 		 60 aa  41.2  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.056491  normal  0.511838 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2322  gas vesicle protein GVPa  50 
 
 		 62 aa  41.2  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.0000661358  hitchhiker  0.000258705 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1813  gas vesicle protein GVPa  41.18 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1260  gas vesicle protein GVPa  41.86 
 
 		 74 aa  40.8  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.128453  normal  0.705808 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2379  gas vesicle protein GVPa  45.45 
 
 		 126 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2338  gas vesicle protein GVPa  45.45 
 
 		 126 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2385  gas vesicle protein GVPa  45.45 
 
 		 126 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.14946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0704  hypothetical protein  45.45 
 
 		 69 aa  40.4  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0694  putative gas vesicle synthesis protein  40 
 
 		 97 aa  40.4  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.783723 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>