42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1485 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1485  gas vesicle protein GVPa  100 
 
 		 116 aa  236  9e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0249757  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0071  gas vesicle protein GVPa  50 
 
 		 230 aa  96.7  1e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0463018  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3022  gas vesicle protein GVPa  55.13 
 
 		 78 aa  89.7  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2825  gas vesicle protein GVPa  55.74 
 
 		 75 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0339  hypothetical protein  50.75 
 
 		 181 aa  75.1  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.881514  normal  0.486472 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2366  gas vesicle protein GVPa  47.44 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1489  gas vesicle protein GVPa  38.37 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.510909  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0342  gas vesicle protein GVPa  44.74 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.842156  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0335  hypothetical protein  45.83 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.942024 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0070  gas vesicle protein GVPa  46.43 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.471557  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3025  gas vesicle protein GVPa  40 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.749024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2828  gas vesicle protein GVPa  39.66 
 
 		 121 aa  52  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0339  gas vesicle protein GVPa  34.48 
 
 		 152 aa  50.4  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0704  hypothetical protein  48.98 
 
 		 69 aa  50.1  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2369  gas vesicle protein GVPa  34.48 
 
 		 201 aa  48.9  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1803  gas vesicle protein GVPa  44.68 
 
 		 66 aa  46.2  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2381  gas vesicle synthesis-like protein  45.65 
 
 		 139 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.528325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2375  gas vesicle synthesis-like protein  45.65 
 
 		 139 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.721458  normal  0.751022 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2334  gas vesicle synthesis-like protein  45.65 
 
 		 139 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1748  gas vesicle synthesis protein GvpA  38.3 
 
 		 72 aa  43.9  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3255  gas vesicle synthesis protein GvpA  34.62 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0851861 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3573  gas vesicle synthesis protein GvpA  34.62 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.862983  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6855  hypothetical protein  33.73 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3016  gas vesicle protein GVPa  38.46 
 
 		 71 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4706  gas vesicle protein GVPa  41.3 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.783958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0078  gas vesicle synthesis protein GvpA  36.73 
 
 		 71 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00750449  normal  0.0121047 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0079  gas vesicle synthesis protein GvpA  36.73 
 
 		 71 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0130989  normal  0.0117948 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1262  gas vesicle protein GVPa  35.09 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.026389  normal  0.71927 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1253  gas vesicle synthesis protein GvpA  38.3 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.13379 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4702  gas vesicle protein GVPa  40.38 
 
 		 114 aa  41.2  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3114  gas vesicle protein GVPa  36.73 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1819  gas vesicle synthesis protein GvpA  36.73 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00075778  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1821  gas vesicle synthesis protein GvpA  36.73 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00228865  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1820  gas vesicle synthesis protein GvpA  36.73 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000245848  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1818  gas vesicle synthesis protein GvpA  36.73 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025131  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0689  gas vesicle synthesis protein GvpA  36.73 
 
 		 68 aa  40.8  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.021084  normal  0.764349 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0688  gas vesicle synthesis protein GvpA  36.73 
 
 		 68 aa  40.8  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0200953  normal  0.76733 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2325  gas vesicle synthesis protein GvpA  36.73 
 
 		 72 aa  40.4  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740835  unclonable  0.0000203995 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0334  gas vesicle protein GVPa  34.69 
 
 		 95 aa  40.4  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2324  gas vesicle synthesis protein GvpA  36.73 
 
 		 75 aa  40.4  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000000112837  hitchhiker  0.000242369 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2839  gas vesicle synthesis protein GvpA  36.73 
 
 		 72 aa  40.4  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2374  gas vesicle protein GVPa  34.69 
 
 		 96 aa  40  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>