More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1472 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1472  FolC bifunctional protein  100 
 
 
425 aa  827    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0335611  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3345  FolC bifunctional protein  46.37 
 
 
429 aa  363  4e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.63219  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0533  FolC bifunctional protein  49.53 
 
 
440 aa  348  1e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.861672 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2552  FolC bifunctional protein  45.73 
 
 
431 aa  347  3e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0970266  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0295  FolC bifunctional protein  48.92 
 
 
426 aa  326  4.0000000000000003e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4360  FolC bifunctional protein  42.99 
 
 
459 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1885  FolC bifunctional protein  38.32 
 
 
441 aa  299  7e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2174  FolC bifunctional protein  38.08 
 
 
441 aa  299  8e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1671  FolC bifunctional protein  41.86 
 
 
431 aa  296  6e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.239696  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2209  FolC bifunctional protein  38.43 
 
 
429 aa  288  1e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.791737  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1490  FolC bifunctional protein  36.85 
 
 
432 aa  283  5.000000000000001e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1384  FolC bifunctional protein  37.06 
 
 
428 aa  278  1e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0880  FolC bifunctional protein  38 
 
 
431 aa  269  8e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1447  FolC bifunctional protein  36.47 
 
 
424 aa  268  1e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2475  folylpolyglutamate synthetase  42.76 
 
 
424 aa  268  2e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1648  hypothetical protein  38.61 
 
 
416 aa  258  1e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1568  FolC bifunctional protein  33.8 
 
 
432 aa  257  3e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01530  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  37.35 
 
 
466 aa  257  4e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0193239 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3173  FolC bifunctional protein  33.87 
 
 
433 aa  252  8.000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4302  FolC bifunctional protein  33.18 
 
 
433 aa  251  2e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2764  FolC bifunctional protein  36.43 
 
 
424 aa  251  2e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1456  FolC bifunctional protein  34.89 
 
 
438 aa  250  3e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2572  FolC bifunctional protein  34.03 
 
 
431 aa  250  3e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0758  FolC bifunctional protein  34.58 
 
 
443 aa  249  8e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4548  folylpolyglutamate synthase  32.95 
 
 
433 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0467  FolC bifunctional protein  37.65 
 
 
434 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000374021  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4575  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  33.8 
 
 
433 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.095656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4201  folylpolyglutamate synthase  33.41 
 
 
433 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3348  FolC bifunctional protein  39.44 
 
 
424 aa  243  3e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0603  FolC bifunctional protein  38.26 
 
 
435 aa  244  3e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_15  folylpolyglutamate synthetase  38.16 
 
 
437 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0016  folylpolyglutamate synthetase  37.92 
 
 
439 aa  243  5e-63  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0782  FolC bifunctional protein  36.74 
 
 
435 aa  243  7e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4544  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  33.41 
 
 
433 aa  242  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4354  folylpolyglutamate synthase  33.41 
 
 
433 aa  242  9e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4190  folylpolyglutamate synthase  33.41 
 
 
433 aa  242  9e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4689  folylpolyglutamate synthase  33.41 
 
 
433 aa  242  9e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0659  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  32.95 
 
 
433 aa  242  9e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0759  FolC bifunctional protein  36.74 
 
 
437 aa  242  1e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4590  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  33.18 
 
 
433 aa  241  1e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1041  FolC bifunctional protein  35.59 
 
 
451 aa  241  2e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1456  FolC bifunctional protein  41.43 
 
 
461 aa  241  2e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.363059  normal  0.651546 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1159  FolC bifunctional protein  41.88 
 
 
448 aa  238  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728641  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0119  FolC bifunctional protein  36.87 
 
 
447 aa  237  2e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.205687 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0897  FolC bifunctional protein  42.19 
 
 
424 aa  238  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.54283e-31 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1278  folylpolyglutamate synthase  35.01 
 
 
427 aa  238  2e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3099  FolC bifunctional protein  40.82 
 
 
438 aa  236  4e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0015  FolC bifunctional protein  37.8 
 
 
438 aa  236  5.0000000000000005e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.124008  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0325  dihydropteroate synthase  40.22 
 
 
878 aa  235  9e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.899871  normal  0.0161218 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0351  FolC bifunctional protein  41.13 
 
 
414 aa  235  9e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.651098 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1549  FolC bifunctional protein  34.12 
 
 
422 aa  235  1.0000000000000001e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4541  FolC bifunctional protein  35.33 
 
 
453 aa  232  7.000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.195738  normal  0.774158 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0602  dihydropteroate synthase  39.23 
 
 
813 aa  232  7.000000000000001e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2780  FolC bifunctional protein  38.53 
 
 
437 aa  232  9e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.38262  normal  0.709673 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0971  FolC bifunctional protein  37.89 
 
 
463 aa  229  5e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.764071  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3277  FolC bifunctional protein  37 
 
 
424 aa  229  7e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3755  FolC bifunctional protein  42.69 
 
 
461 aa  228  1e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0263882  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0390  FolC bifunctional protein  39.44 
 
 
422 aa  228  1e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000576883  normal  0.0116756 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0738  folylpolyglutamate synthetase; dihydrofolate synthetase  36.53 
 
 
422 aa  227  4e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00754435  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0742  FolC bifunctional protein  43.21 
 
 
445 aa  226  4e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0127305  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07720  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  38.15 
 
 
427 aa  226  5.0000000000000005e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.278263 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0325  FolC bifunctional protein  34.95 
 
 
438 aa  226  6e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12370  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  38.55 
 
 
470 aa  225  9e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867028  normal  0.34816 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4359  FolC bifunctional protein  37.41 
 
 
427 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.601802  normal  0.624925 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23910  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  37.68 
 
 
466 aa  224  2e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.290984  normal  0.331564 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4713  dihydropteroate synthase  35.73 
 
 
810 aa  224  3e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.464706  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1504  folylpolyglutamate synthase / dihydrofolate synthase  33.49 
 
 
420 aa  223  3e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000264137  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0344  FolC bifunctional protein  32.44 
 
 
435 aa  224  3e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0087  FolC bifunctional protein  36.24 
 
 
454 aa  223  4.9999999999999996e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0279686 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3470  FolC bifunctional protein  40.52 
 
 
460 aa  222  9e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00143451  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3525  FolC bifunctional protein  39.82 
 
 
440 aa  220  3.9999999999999997e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3147  FolC bifunctional protein  37.76 
 
 
817 aa  219  7.999999999999999e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0120997  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12473  folylpolyglutamate synthase protein folC  39.09 
 
 
487 aa  219  8.999999999999998e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.669208 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1166  FolC bifunctional protein  40.24 
 
 
452 aa  219  8.999999999999998e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.343564  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3391  FolC bifunctional protein  38.93 
 
 
450 aa  218  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1110  FolC bifunctional protein  31.82 
 
 
465 aa  218  1e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.94602 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2554  dihydropteroate synthase  37.08 
 
 
840 aa  218  2e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.324611  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1149  FolC bifunctional protein  40.56 
 
 
468 aa  218  2e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.498576  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0510  FolC bifunctional protein  33.18 
 
 
437 aa  217  2.9999999999999998e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14370  Folylpolyglutamate synthase  34.34 
 
 
457 aa  217  4e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137038  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2308  FolC bifunctional protein  41.06 
 
 
442 aa  216  8e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000091683  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1603  FolC bifunctional protein  36.54 
 
 
420 aa  215  9.999999999999999e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.119279  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1208  FolC bifunctional protein  40.1 
 
 
445 aa  214  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.482446 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1160  FolC bifunctional protein  36.43 
 
 
425 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3683  folylpolyglutamate synthetase  36.14 
 
 
416 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3492  FolC bifunctional protein  39.5 
 
 
444 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.371874 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0426  FolC bifunctional protein  36.88 
 
 
422 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.776712  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0544  FolC bifunctional protein  35.27 
 
 
425 aa  213  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1510  FolC bifunctional protein  29.46 
 
 
413 aa  212  1e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1496  FolC bifunctional protein  39.15 
 
 
515 aa  212  1e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.038753  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3284  dihydropteroate synthase  37.27 
 
 
847 aa  211  2e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0333  FolC bifunctional protein  41.53 
 
 
414 aa  208  1e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0256813  normal  0.0230172 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10060  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  42.35 
 
 
517 aa  209  1e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0614785  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2368  folC bifunctional protein  42.01 
 
 
381 aa  208  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.183429  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1166  FolC bifunctional protein  32.84 
 
 
428 aa  207  3e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3497  FolC bifunctional protein  41.11 
 
 
526 aa  207  3e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7286  FolC bifunctional protein  39 
 
 
440 aa  206  6e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0401599  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2054  FolC bifunctional protein  37.9 
 
 
508 aa  206  6e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.832058  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1830  FolC bifunctional protein  39.58 
 
 
432 aa  206  6e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0684286  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2605  FolC bifunctional protein  40.05 
 
 
408 aa  206  7e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>