More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1467 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1467  DNA repair protein RadC  100 
 
 		 230 aa  464  9.999999999999999e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3340  DNA repair protein RadC  64.6 
 
 		 233 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000661948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2549  DNA repair protein RadC  62.33 
 
 		 227 aa  290  1e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0536  DNA repair protein RadC  61.61 
 
 		 229 aa  250  1e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.604905 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4545  DNA repair protein RadC  54.09 
 
 		 225 aa  247  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4587  DNA repair protein RadC  54.09 
 
 		 225 aa  247  1e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.46911  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1412  DNA repair protein RadC  57.94 
 
 		 227 aa  246  2e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4299  DNA repair protein RadC  53.18 
 
 		 225 aa  246  2e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0662  DNA repair protein RadC  52.73 
 
 		 225 aa  246  3e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92951  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4351  DNA repair protein RadC  53.64 
 
 		 225 aa  246  3e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.579867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4187  DNA repair protein RadC  53.64 
 
 		 225 aa  246  3e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4685  DNA repair protein RadC  53.64 
 
 		 225 aa  246  3e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.92537  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2135  DNA repair protein RadC  50 
 
 		 236 aa  245  3e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000438114  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4198  DNA repair protein RadC  53.64 
 
 		 225 aa  245  4e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000602972  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0899  DNA repair protein RadC  52.73 
 
 		 226 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2550  DNA repair protein RadC  51.8 
 
 		 226 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.727412  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4572  DNA repair protein RadC  51.82 
 
 		 225 aa  242  3e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345161  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1642  DNA repair protein RadC  51.3 
 
 		 235 aa  232  3e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000389911  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4352  DNA repair protein RadC  52.7 
 
 		 227 aa  230  1e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000113857  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1541  DNA repair protein RadC  51.77 
 
 		 232 aa  225  4e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000897994  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14250  DNA repair protein RadC  49.56 
 
 		 228 aa  224  1e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326992  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2564  DNA repair protein RadC  46.02 
 
 		 229 aa  223  3e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1825  DNA repair protein RadC  47.41 
 
 		 233 aa  218  7e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0382  DNA repair protein RadC  44.25 
 
 		 229 aa  213  9.999999999999999e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_511  DNA repair protein RadC  47.09 
 
 		 228 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000324187  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0546  DNA repair protein RadC  47.09 
 
 		 228 aa  209  3e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0514  DNA repair protein RadC  46.61 
 
 		 241 aa  209  4e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.120777  hitchhiker  0.000000000242554 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1530  DNA repair protein RadC  49.33 
 
 		 227 aa  208  4e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0606843  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0572  RadC family DNA repair protein  48.13 
 
 		 222 aa  207  8e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.611512  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0523  DNA repair protein RadC  50.67 
 
 		 230 aa  207  8e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3784  DNA repair protein RadC  49.31 
 
 		 231 aa  206  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4138  DNA repair protein RadC  47.32 
 
 		 228 aa  206  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.592557  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1307  DNA repair protein RadC  45.25 
 
 		 231 aa  204  7e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00169173  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1630  DNA repair protein RadC  47.03 
 
 		 234 aa  204  8e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0065  DNA repair protein RadC  46.88 
 
 		 227 aa  204  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3868  DNA repair protein RadC  48.39 
 
 		 231 aa  203  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.956659 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2303  DNA repair protein RadC  44.8 
 
 		 229 aa  202  3e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.432419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0037  DNA repair protein RadC  50 
 
 		 233 aa  201  6e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2262  DNA repair proteins  49.27 
 
 		 206 aa  201  7e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.195306  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0777  DNA repair protein RadC  45.29 
 
 		 229 aa  201  9e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3582  DNA repair protein RadC  48.44 
 
 		 229 aa  201  9e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0386  DNA repair protein RadC  49.33 
 
 		 229 aa  199  3e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2111  DNA repair protein RadC  45.25 
 
 		 227 aa  199  3e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2399  DNA repair protein RadC  45.25 
 
 		 227 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0767  DNA repair protein RadC  47.35 
 
 		 233 aa  195  6e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0983  DNA repair protein RadC  57.86 
 
 		 231 aa  192  5e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1818  DNA repair protein RadC  45.37 
 
 		 222 aa  187  2e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.852458  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4541  DNA repair protein  50 
 
 		 186 aa  184  8e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1319  DNA repair protein RadC  40.99 
 
 		 228 aa  181  7e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000567698  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1465  DNA repair protein RadC  40.83 
 
 		 222 aa  181  1e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0881  DNA repair protein RadC  40.83 
 
 		 228 aa  181  1e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.701712  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3170  DNA repair protein RadC  49.43 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0086  DNA repair protein RadC  42.86 
 
 		 224 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0935  DNA repair protein RadC  44.3 
 
 		 222 aa  178  4.999999999999999e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266168  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1513  DNA repair protein RadC  41.67 
 
 		 222 aa  178  5.999999999999999e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2479  DNA repair protein RadC  43.35 
 
 		 245 aa  177  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0100  DNA repair protein RadC  42.72 
 
 		 223 aa  176  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.234069  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0735  DNA repair protein RadC  42.54 
 
 		 223 aa  176  4e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0222  DNA repair protein RadC  42.41 
 
 		 224 aa  175  5e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3564  DNA repair protein RadC  43.93 
 
 		 224 aa  175  5e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.469153  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02940  DNA repair protein RadC  43.24 
 
 		 224 aa  175  6e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1761  DNA repair protein RadC  43.75 
 
 		 223 aa  175  7e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2376  DNA repair protein RadC  38.86 
 
 		 232 aa  174  9e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000665213  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0917  DNA repair protein RadC  42.22 
 
 		 225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.372898  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2155  DNA repair protein RadC  41.7 
 
 		 223 aa  172  5e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.365065  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0215  DNA repair protein RadC  43.46 
 
 		 213 aa  172  5e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0236  DNA repair protein RadC  42.41 
 
 		 224 aa  171  6.999999999999999e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0315  DNA repair protein RadC  42.25 
 
 		 224 aa  170  1e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.220116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2301  DNA repair protein RadC  42.41 
 
 		 224 aa  170  2e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4376  DNA repair protein RadC  41.74 
 
 		 224 aa  170  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0839768 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70230  DNA repair protein RadC  41.74 
 
 		 224 aa  169  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0831  DNA repair protein RadC  40.64 
 
 		 223 aa  168  5e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.950681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5539  DNA repair protein RadC  41.28 
 
 		 224 aa  167  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2664  DNA repair protein RadC  41.96 
 
 		 224 aa  167  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.649783  hitchhiker  0.0000127675 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6095  DNA repair protein RadC  41.28 
 
 		 224 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.872274  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1494  DNA repair protein  40.93 
 
 		 233 aa  166  2e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000647961  decreased coverage  0.0000976606 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3678  DEAD/DEAH box helicase-like  39.19 
 
 		 224 aa  166  2.9999999999999998e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00158019  normal  0.0453807 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1101  DNA repair protein RadC  36.61 
 
 		 226 aa  165  5.9999999999999996e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2291  DNA repair protein RadC  40.74 
 
 		 242 aa  164  6.9999999999999995e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0121519 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0192  DNA repair protein RadC  40.54 
 
 		 224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000306509  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1235  DNA repair protein RadC  40.27 
 
 		 222 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2972  DNA repair protein RadC  42.34 
 
 		 224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0458817  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1153  DNA repair protein  39.82 
 
 		 233 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2667  DNA repair protein RadC  40.17 
 
 		 243 aa  163  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.581751 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0176  DNA repair protein RadC  39.35 
 
 		 225 aa  162  3e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.260187  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0624  DNA repair protein RadC  38.12 
 
 		 224 aa  162  3e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000507049 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0358  DNA repair protein RadC  41.07 
 
 		 224 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0732931  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0528  DNA repair protein RadC  41.07 
 
 		 224 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.204187  unclonable  0.0000000000301239 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0598  DNA repair protein RadC  43.04 
 
 		 223 aa  161  7e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00653  DNA repair protein RadC  40.09 
 
 		 224 aa  160  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0061  DNA repair protein RadC  45.75 
 
 		 223 aa  160  1e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1778  DNA repair protein RadC  37.66 
 
 		 243 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.69629 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1220  DNA repair protein RadC  40.55 
 
 		 215 aa  160  2e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0046  DNA repair protein RadC  38.12 
 
 		 224 aa  160  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.178856  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0101  DNA repair protein RadC  40.91 
 
 		 243 aa  159  3e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001821  DNA repair protein RadC  39.64 
 
 		 224 aa  159  4e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000198963  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2322  DNA repair protein RadC  39.91 
 
 		 224 aa  159  5e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0102136 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1231  DNA repair protein RadC  39.91 
 
 		 246 aa  158  5e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.375575 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1225  truncated DNA repair protein RadC  44.69 
 
 		 184 aa  158  6e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.247593  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3142  DNA repair protein RadC  47.06 
 
 		 226 aa  158  7e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00442306  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>