More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1451 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1451  50S ribosomal protein L27  100 
 
 
87 aa  172  1e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  1.09711e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4336  50S ribosomal protein L27  75.9 
 
 
98 aa  133  7e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.56783e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3314  50S ribosomal protein L27  72.73 
 
 
88 aa  132  2e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  2.01837e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0180  ribosomal protein L27  73.26 
 
 
87 aa  131  4e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00344183  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1611  50S ribosomal protein L27  70.11 
 
 
97 aa  128  2e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  8.33239e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2115  50S ribosomal protein L27  73.49 
 
 
95 aa  129  2e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  3.81623e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2534  50S ribosomal protein L27  74.39 
 
 
89 aa  128  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00269432  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0162  50S ribosomal protein L27  72.62 
 
 
92 aa  126  9e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000470304  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0424  50S ribosomal protein L27  73.81 
 
 
92 aa  124  5e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.85685  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2095  50S ribosomal protein L27  69.88 
 
 
100 aa  123  8e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000243754  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2383  50S ribosomal protein L27  69.88 
 
 
100 aa  123  8e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  2.71812e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14110  ribosomal protein L27  68.97 
 
 
92 aa  122  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.54683e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1322  50S ribosomal protein L27  72.62 
 
 
93 aa  123  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202247  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0559  50S ribosomal protein L27  71.6 
 
 
90 aa  120  5e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0910  50S ribosomal protein L27  70.59 
 
 
96 aa  120  5e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2540  50S ribosomal protein L27  69.41 
 
 
96 aa  119  1e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  1.33026e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0647  50S ribosomal protein L27  69.41 
 
 
89 aa  119  1e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.908873 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2549  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 
95 aa  119  1e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000275731  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1735  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 
94 aa  118  2e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  1.5343e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1702  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 
94 aa  118  2e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  3.26176e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1515  50S ribosomal protein L27  72.29 
 
 
93 aa  118  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0090282  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3157  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 
96 aa  117  7e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00125079  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4575  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 
96 aa  115  1e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000185796  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1209  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 
94 aa  116  1e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  6.6933e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1220  50S ribosomal protein L27  71.43 
 
 
88 aa  116  1e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1120  50S ribosomal protein L27  65.52 
 
 
99 aa  116  1e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  1.94791e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4560  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 
96 aa  115  1e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4534  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 
96 aa  115  1e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  9.897e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2772  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 
87 aa  115  2e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.436114  normal  0.118024 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3345  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 
87 aa  115  2e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4522  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 
96 aa  114  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.230769 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4176  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 
96 aa  114  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.52453e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4674  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 
96 aa  114  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  9.03634e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4288  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 
96 aa  114  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000779074  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4340  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 
96 aa  114  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  8.39795e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4187  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 
96 aa  114  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0200239  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0674  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 
96 aa  114  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  6.11432e-08  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1815  ribosomal protein L27  66.28 
 
 
102 aa  114  5e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0746  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 
103 aa  114  5e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  1.22269e-09  hitchhiker  0.000403944 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3242  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 
95 aa  114  5e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2218  50S ribosomal protein L27  70.59 
 
 
85 aa  113  9e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  8.00329e-07  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0163  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 
85 aa  112  1e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  3.90958e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1537  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 
85 aa  112  2e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1816  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 
85 aa  112  2e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0146  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 
85 aa  111  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3196  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 
85 aa  111  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  8.40306e-15  unclonable  7.87501e-24 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3471  50S ribosomal protein L27  68.6 
 
 
87 aa  111  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00282639  normal  0.386116 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0456  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 
96 aa  111  3e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.031206  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1368  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 
94 aa  111  3e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  2.72527e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0530  50S ribosomal protein L27  64.37 
 
 
98 aa  111  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  1.63692e-08  normal  0.125881 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3235  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 
85 aa  111  4e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000158281  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3589  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 
84 aa  111  4e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  1.97888e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2060  ribosomal protein L27  69.77 
 
 
87 aa  110  5e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3448  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 
87 aa  110  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0232252  hitchhiker  0.00744788 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1112  ribosomal protein L27  69.05 
 
 
86 aa  110  7e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.55245  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0414  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 
93 aa  110  7e-24  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0656018  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0305  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 
85 aa  110  8e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  3.93871e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2582  50S ribosomal protein L27  69.14 
 
 
84 aa  109  1e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.60272e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0508  50S ribosomal protein L27  65.52 
 
 
87 aa  109  1e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.868007  normal  0.531544 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0856  50S ribosomal protein L27  65.12 
 
 
86 aa  109  1e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.701213  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3549  50S ribosomal protein L27  70.93 
 
 
88 aa  108  2e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12468  50S ribosomal protein L27  69.77 
 
 
86 aa  108  2e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.141175  normal  0.856367 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1548  ribosomal protein L27  68.24 
 
 
85 aa  108  2e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104993  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3554  50S ribosomal protein L27  70.93 
 
 
88 aa  108  2e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl439  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 
95 aa  108  2e-23  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  5.83794e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3622  50S ribosomal protein L27  70.93 
 
 
88 aa  108  2e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3465  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 
94 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.360708 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3379  ribosomal protein L27  68.6 
 
 
86 aa  108  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0454  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 
89 aa  108  3e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0503  ribosomal protein L27  65.48 
 
 
85 aa  107  4e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1009  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 
85 aa  107  4e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  9.11893e-12  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2651  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 
86 aa  107  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0231869  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0269  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 
85 aa  107  6e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.876975  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0348  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 
84 aa  107  7e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  4.53633e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1725  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 
85 aa  107  7e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1524  50S ribosomal protein L27  70.59 
 
 
86 aa  107  7e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.846788  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0099  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 
84 aa  106  8e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3480  50S ribosomal protein L27  71.08 
 
 
84 aa  107  8e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.219876  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0130  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 
84 aa  106  8e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0090  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 
84 aa  106  8e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0327893  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0310  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 
89 aa  106  9e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0865  50S ribosomal protein L27  65.52 
 
 
87 aa  105  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.437144  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1632  50S ribosomal protein L27  65.52 
 
 
87 aa  105  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.848306  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0019  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 
86 aa  106  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2459  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 
85 aa  105  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.177847 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2237  ribosomal protein L27  59.3 
 
 
91 aa  105  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140821  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0184  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 
84 aa  105  2e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7270  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 
85 aa  105  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410235  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1415  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 
85 aa  105  2e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0996  50S ribosomal protein L27  62.35 
 
 
85 aa  105  3e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2143  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 
90 aa  105  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.672881 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0928  ribosomal protein L27  64.47 
 
 
97 aa  105  3e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  4.70923e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2801  50S ribosomal protein L27  64.37 
 
 
87 aa  104  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000884705  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11410  LSU ribosomal protein L27P  66.67 
 
 
85 aa  104  4e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.624774  hitchhiker  0.0010423 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1188  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 
87 aa  104  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1504  ribosomal protein L27  68.54 
 
 
94 aa  103  6e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00591698  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0461  50S ribosomal protein L27  65.12 
 
 
86 aa  103  6e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00297252 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0284  50S ribosomal protein L27  65.12 
 
 
86 aa  103  6e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.349085  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3640  50S ribosomal protein L27  62.65 
 
 
88 aa  103  7e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.320466  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2181  50S ribosomal protein L27  63.64 
 
 
88 aa  103  7e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.128983  normal  0.935252 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>