More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1425 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1425  sporulation sigma factor SigG  100 
 
 
255 aa  518  1e-146  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00153435  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0687  sporulation sigma factor SigG  82.03 
 
 
257 aa  444  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0853  sporulation sigma factor SigG  81.25 
 
 
272 aa  440  1e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0182418  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1067  sporulation sigma factor SigG  82.42 
 
 
257 aa  442  1e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000166979  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4053  sporulation sigma factor SigG  80 
 
 
257 aa  432  1e-120  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000132793  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1552  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigG  76.95 
 
 
256 aa  419  1e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178805  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2000  sporulation sigma factor SigG  78.12 
 
 
256 aa  419  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000480045  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1291  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigG  76.77 
 
 
259 aa  417  1e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2014  sporulation sigma factor SigG  76.17 
 
 
257 aa  412  1e-114  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0448  sporulation sigma factor SigG  76.56 
 
 
257 aa  413  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000243038  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09160  sporulation sigma factor SigG  76.56 
 
 
260 aa  409  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000197734  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1732  sporulation sigma factor SigG  75.78 
 
 
257 aa  409  1e-113  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0249664  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2061  sporulation sigma factor SigG  74.61 
 
 
257 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147139  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1901  sporulation sigma factor SigG  75.2 
 
 
259 aa  402  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1311  sporulation sigma factor SigG  75.69 
 
 
269 aa  401  1e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000268367  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1031  sporulation sigma factor SigG  75.59 
 
 
259 aa  402  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000174079  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3948  sporulation sigma factor SigG  73.23 
 
 
289 aa  395  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000196829  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3754  sporulation sigma factor SigG  73.23 
 
 
289 aa  395  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000419985  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3645  sporulation sigma factor SigG  73.23 
 
 
289 aa  395  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.74076e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3662  sporulation sigma factor SigG  73.23 
 
 
289 aa  395  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000167357  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4004  sporulation sigma factor SigG  73.23 
 
 
259 aa  394  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000100542  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3917  sporulation sigma factor SigG  73.23 
 
 
259 aa  394  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000372162 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2552  sporulation sigma factor SigG  73.62 
 
 
259 aa  396  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000004552  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4042  sporulation sigma factor SigG  73.23 
 
 
259 aa  394  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000307551  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3955  sporulation sigma factor SigG  73.23 
 
 
259 aa  394  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000614575  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1237  sporulation sigma factor SigG  73.23 
 
 
259 aa  395  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299824  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3730  sporulation sigma factor SigG  72.83 
 
 
292 aa  393  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000187869  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0836  sporulation sigma factor SigG  75.64 
 
 
234 aa  372  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.904059  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0788  sporulation sigma factor SigG  63.92 
 
 
255 aa  353  2e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.667987  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2468  sporulation sigma factor SigG  64.43 
 
 
260 aa  340  1e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000740675  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2870  sporulation sigma factor SigG  54.51 
 
 
273 aa  300  2e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000515832  hitchhiker  0.0000000000171975 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1105  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  53.44 
 
 
260 aa  281  8.000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2066  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigF  47.62 
 
 
259 aa  267  1e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000506599  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1224  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  54.51 
 
 
257 aa  265  5.999999999999999e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0121865  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1496  sigma 28 (flagella/sporulation)  48.99 
 
 
270 aa  262  4e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3903  sporulation sigma factor SigF  50.81 
 
 
252 aa  261  4.999999999999999e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.715722  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4142  sporulation sigma factor SigF  50.41 
 
 
252 aa  259  2e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000821538  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3983  sporulation sigma factor SigF  50.41 
 
 
252 aa  259  2e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00304797  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3813  sporulation sigma factor SigF  50.41 
 
 
252 aa  259  2e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3829  sporulation sigma factor SigF  50.41 
 
 
252 aa  259  2e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000549151  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4294  sporulation sigma factor SigF  50.41 
 
 
252 aa  259  2e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.728684  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4205  sporulation sigma factor SigF  50.41 
 
 
252 aa  259  2e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000245022  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4094  sporulation sigma factor SigF  50.41 
 
 
252 aa  259  2e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5514999999999997e-21 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1056  sporulation sigma factor SigF  50.41 
 
 
252 aa  259  2e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.656155  normal  0.0661655 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4182  sporulation sigma factor SigF  50.41 
 
 
252 aa  259  2e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0460854  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3442  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigF  47.2 
 
 
261 aa  260  2e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2771  sporulation sigma factor SigF  50 
 
 
252 aa  258  8e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000547183  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0374  sporulation sigma factor SigF  50.86 
 
 
252 aa  248  5e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2250  sporulation sigma factor SigF  49.79 
 
 
250 aa  243  3e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1744  sporulation sigma factor SigF  48.52 
 
 
256 aa  234  1.0000000000000001e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0478  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  47.32 
 
 
238 aa  218  7e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0863  RNA polymerase, sigma 28 subunit, Sig B/F/G subfamily  46.78 
 
 
245 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2284  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigF  46.75 
 
 
249 aa  207  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1559  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  44.98 
 
 
246 aa  203  3e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1680  RNA polymerase, sigma 28 subunit, Sig B/F/G subfamily  45.95 
 
 
232 aa  202  4e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2305  sporulation sigma factor SigF  45.74 
 
 
251 aa  202  6e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2020  sporulation sigma factor SigF  45.74 
 
 
251 aa  202  6e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0120  RNA polymerase, sigma 28 subunit  45.45 
 
 
246 aa  199  3e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07020  sporulation sigma factor SigF  44.44 
 
 
257 aa  187  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0615  sigma 28 (flagella/sporulation)  38.53 
 
 
243 aa  179  4e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1661  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG family  38.06 
 
 
253 aa  173  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.691015  normal  0.251698 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1813  RNA polymerase, sigma 28 subunit, Sig B/F/G subfamily  40.09 
 
 
258 aa  163  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0724574  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0455  RNA polymerase, sigma 28 subunit, Sig B/F/G subfamily  40.56 
 
 
284 aa  160  2e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.333404  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0559  RNA polymerase sigma factor  39.02 
 
 
267 aa  156  3e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3691  RNA polymerase, sigma 28 subunit, Sig B/F/G subfamily  40.32 
 
 
276 aa  156  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3692  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG subfamily  39.02 
 
 
267 aa  151  8.999999999999999e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.364276 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2905  Sig B/F/G subfamily RNA polymerase sigma-28  41.33 
 
 
259 aa  150  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.326727  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0564  RNA polymerase, sigma 28 subunit  42.39 
 
 
287 aa  150  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.244424  normal  0.87971 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0974  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  40.85 
 
 
376 aa  149  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.279124 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8303  putative RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG subfamily  39.92 
 
 
266 aa  149  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.477375  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7708  RNA polymerase, sigma 28 subunit, Sig B/F/G subfamily  40.36 
 
 
353 aa  147  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3755  sigma 28 subunit  39.09 
 
 
338 aa  146  3e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1358  RNA polymerase, sigma 28 subunit  38.71 
 
 
258 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317901  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1715  sigma-70 region 2 domain-containing protein  40.64 
 
 
270 aa  142  4e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01790  RNA polymerase sigma factor, sigma-70 family  34.92 
 
 
267 aa  139  3e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.638502 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2112  RNA polymerase, sigma 28 subunit, Sig B/F/G subfamily  38.22 
 
 
360 aa  134  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13315  RNA polymerase sigma factor SigF  35.48 
 
 
261 aa  133  3e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1281  RNA polymerase sigma factor SigF  33.6 
 
 
263 aa  132  5e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.167478  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1298  RNA polymerase sigma factor SigF  33.6 
 
 
263 aa  132  5e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0930015  normal  0.0420903 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1310  RNA polymerase sigma factor SigF  33.6 
 
 
263 aa  132  5e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3872  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  36.73 
 
 
270 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.103123 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1677  RNA polymerase sigma factor SigB  34.48 
 
 
256 aa  130  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5429  RNA polymerase, sigma 28 subunit, Sig B/F/G subfamily  36.28 
 
 
276 aa  129  4.0000000000000003e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0400  RNA polymerase, sigma 28 subunit, Sig B/F/G subfamily  33.05 
 
 
249 aa  129  6e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0319697  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0713  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  34.4 
 
 
417 aa  128  8.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0492  RNA polymerase sigma factor RpoD  34.66 
 
 
360 aa  128  9.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.187427  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0624  RNA polymerase sigma factor RpoD  34.4 
 
 
361 aa  127  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00076534  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3793  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG family  35.43 
 
 
326 aa  128  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.125919  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4789  RNA polymerase sigma factor SigF  32.94 
 
 
262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0939042  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1421  sigma 28 (flagella/sporulation)  34.94 
 
 
326 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000137657  normal  0.258497 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1660  RNA polymerase sigma factor SigF  35.56 
 
 
262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3813  sigma-70 region 2 domain-containing protein  34.71 
 
 
257 aa  126  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0641622  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4292  RNA polymerase sigma-70 factor, sigma-B/F/G subfamily  34.73 
 
 
276 aa  127  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2900  RNA polymerase, sigma 28 subunit  32.91 
 
 
252 aa  126  3e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00742668  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27140  RNA polymerase sigma factor, sigma-70 family  34.01 
 
 
266 aa  126  4.0000000000000003e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.967922  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0437  RNA polymerase, sigma 28 subunit, Sig B/F/G subfamily  34.08 
 
 
256 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2294  anti-sigma-factor antagonist  35.59 
 
 
374 aa  125  7e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.942803  normal  0.0240973 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3871  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  33.04 
 
 
342 aa  125  7e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0733317 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0157  RNA polymerase sigma factor RpoD  33.6 
 
 
375 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4930  RNA polymerase sigma factor SigF  35.68 
 
 
258 aa  125  9e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113891 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>