More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1414 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1414  alanine racemase domain-containing protein  100 
 
 		 234 aa  468  1.0000000000000001e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000108104  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0712  alanine racemase domain-containing protein  51.33 
 
 		 226 aa  248  5e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0403  PLP dependent enzymes class III-like protein  53.6 
 
 		 228 aa  230  1e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09220  conserved hypothetical protein TIGR00044  50.43 
 
 		 230 aa  222  4e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00199115  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  52.19 
 
 		 230 aa  216  2e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  52.19 
 
 		 230 aa  212  2.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  51.32 
 
 		 231 aa  210  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1015  alanine racemase domain protein  53.21 
 
 		 247 aa  211  1e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  51.33 
 
 		 237 aa  210  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  54.73 
 
 		 231 aa  207  9e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0953  hypothetical protein  47.06 
 
 		 225 aa  206  4e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000358691  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0460  alanine racemase domain protein  51.75 
 
 		 228 aa  204  9e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  40.89 
 
 		 235 aa  204  1e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1082  alanine racemase domain protein  45.98 
 
 		 225 aa  203  2e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000765684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0792  hypothetical protein  46.67 
 
 		 234 aa  201  8e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000822407  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  49.34 
 
 		 228 aa  195  5.000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0858  hypothetical protein  48.71 
 
 		 236 aa  191  6e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0454343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2362  alanine racemase domain-containing protein  39.84 
 
 		 253 aa  191  1e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000227174  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1892  alanine racemase domain-containing protein  45.77 
 
 		 202 aa  190  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000005505  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1344  alanine racemase domain protein  42.53 
 
 		 233 aa  189  4e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000474178  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  44.1 
 
 		 231 aa  186  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  44.73 
 
 		 244 aa  185  6e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1189  alanine racemase domain-containing protein  41.81 
 
 		 235 aa  184  9e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000138535  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  45.22 
 
 		 234 aa  182  5.0000000000000004e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6110  alanine racemase domain protein  42.73 
 
 		 244 aa  181  9.000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2263  alanine racemase domain protein  48.61 
 
 		 212 aa  181  1e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3657  alanine racemase domain-containing protein  39.66 
 
 		 235 aa  179  2e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0664896  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  45.13 
 
 		 231 aa  179  2e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4212  alanine racemase domain-containing protein  42.98 
 
 		 269 aa  179  4e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0294103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  42.86 
 
 		 227 aa  179  4e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2315  hypothetical protein  39.21 
 
 		 275 aa  178  7e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000951598  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0478  hypothetical protein  43.86 
 
 		 229 aa  176  4e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1555  alanine racemase domain protein  38.57 
 
 		 224 aa  176  4e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1141  hypothetical protein  46.4 
 
 		 271 aa  174  8e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0906  alanine racemase domain protein  40.61 
 
 		 241 aa  174  9.999999999999999e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.248468  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0816  alanine racemase domain protein  40.53 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000900984  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1315  alanine racemase domain protein  37.5 
 
 		 233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000152977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0153  alanine racemase domain-containing protein  41.44 
 
 		 235 aa  172  2.9999999999999996e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00359094  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2208  alanine racemase domain protein  43.95 
 
 		 272 aa  171  6.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.834769 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4047  alanine racemase domain protein  41.41 
 
 		 233 aa  171  9e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0138922  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4142  alanine racemase domain-containing protein  40.53 
 
 		 243 aa  171  9e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1272  alanine racemase domain protein  43.35 
 
 		 218 aa  169  3e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4138  alanine racemase domain-containing protein  44.44 
 
 		 276 aa  169  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2503  hypothetical protein  49.75 
 
 		 227 aa  168  5e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1034  alanine racemase domain protein  40.91 
 
 		 226 aa  168  5e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000216914  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2383  alanine racemase domain protein  43.67 
 
 		 257 aa  167  9e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1062  hypothetical protein  43.43 
 
 		 216 aa  167  1e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1449  alanine racemase domain protein  49.75 
 
 		 223 aa  167  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1116  alanine racemase domain protein  44 
 
 		 219 aa  167  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0312206  normal  0.913907 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1238  alanine racemase domain protein  38.29 
 
 		 235 aa  166  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.878338  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1802  alanine racemase domain protein  43.42 
 
 		 229 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3251  alanine racemase domain-containing protein  43.33 
 
 		 244 aa  166  4e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  hitchhiker  0.000198069 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1026  alanine racemase domain-containing protein  42.99 
 
 		 229 aa  165  5e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1094  alanine racemase domain-containing protein  42.99 
 
 		 229 aa  165  5e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.952967  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2661  hypothetical protein  38.86 
 
 		 220 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  43.04 
 
 		 232 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1356  alanine racemase domain-containing protein  37.33 
 
 		 231 aa  162  3e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1702  alanine racemase domain-containing protein  48.85 
 
 		 214 aa  163  3e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.348168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0085  alanine racemase domain protein  45.23 
 
 		 235 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0758  hypothetical protein  42.86 
 
 		 220 aa  161  8.000000000000001e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.28716  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1904  alanine racemase domain protein  40.62 
 
 		 224 aa  161  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2011  alanine racemase domain protein  40.09 
 
 		 220 aa  160  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3914  conserved hypothetical protein TIGR00044  37.61 
 
 		 224 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000064891 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3751  hypothetical protein  37.61 
 
 		 224 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0252212  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3642  hypothetical protein  37.61 
 
 		 224 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000487745  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4039  hypothetical protein  37.61 
 
 		 224 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00228319  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09518  hypothetical protein  40.78 
 
 		 219 aa  160  2e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1487  hypothetical protein  47.49 
 
 		 240 aa  160  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.164906  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1822  hypothetical protein  38.26 
 
 		 219 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000058196  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1789  alanine racemase domain protein  41.67 
 
 		 246 aa  159  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259627  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3659  hypothetical protein  37.61 
 
 		 224 aa  159  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000235799  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2306  hypothetical protein  43.36 
 
 		 271 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3449  alanine racemase domain-containing protein  37.56 
 
 		 219 aa  159  3e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0703  alanine racemase domain-containing protein  40 
 
 		 229 aa  159  3e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1865  alanine racemase domain protein  45.92 
 
 		 242 aa  159  4e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1350  hypothetical protein  41.74 
 
 		 229 aa  159  4e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2737  alanine racemase domain protein  43.95 
 
 		 259 aa  158  5e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1779  alanine racemase domain protein  39.57 
 
 		 229 aa  158  6e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2910  alanine racemase domain-containing protein  44.59 
 
 		 242 aa  158  7e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000373899  normal  0.226909 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0717  alanine racemase domain protein  41.3 
 
 		 232 aa  158  8e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.799329 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2739  alanine racemase domain protein  46.27 
 
 		 231 aa  157  9e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4019  alanine racemase domain protein  42.54 
 
 		 270 aa  157  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.69419  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3839  alanine racemase domain protein  41.74 
 
 		 280 aa  157  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2071  alanine racemase domain protein  40 
 
 		 229 aa  157  1e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  42.98 
 
 		 229 aa  156  3e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1365  alanine racemase domain-containing protein  48.28 
 
 		 213 aa  156  3e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0384344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0685  alanine racemase domain-containing protein  41.87 
 
 		 220 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.268017  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1659  alanine racemase domain protein  39.91 
 
 		 229 aa  155  6e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1539  alanine racemase domain-containing protein  38.5 
 
 		 228 aa  154  9e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.237332  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2549  alanine racemase domain-containing protein  37.72 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0648095  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_664  alanine racemase domain protein  41.38 
 
 		 220 aa  154  1e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0827888  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3952  conserved hypothetical protein TIGR00044  36.73 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000844629  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0939  alanine racemase domain protein  38.96 
 
 		 229 aa  154  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3590  hypothetical protein  45.53 
 
 		 248 aa  154  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4001  conserved hypothetical protein TIGR00044  37.17 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000153868  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3134  alanine racemase domain protein  42.54 
 
 		 262 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1240  hypothetical protein  37.17 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000730166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2108  hypothetical protein  37.83 
 
 		 219 aa  153  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000109011  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3945  hypothetical protein  36.28 
 
 		 224 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00244748  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2801  hypothetical protein  42.48 
 
 		 229 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>