More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1388 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  100 
 
 
236 aa  478  1e-134  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  62.23 
 
 
235 aa  304  1.0000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  60.26 
 
 
236 aa  303  1.0000000000000001e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  61.11 
 
 
235 aa  300  1e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  60.52 
 
 
235 aa  296  1e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  60.09 
 
 
234 aa  297  1e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  60.09 
 
 
234 aa  296  3e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  60.94 
 
 
234 aa  295  6e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  61.11 
 
 
237 aa  294  1e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  60.52 
 
 
237 aa  293  2e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  58.55 
 
 
259 aa  293  2e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  59.23 
 
 
235 aa  290  1e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  60.52 
 
 
237 aa  289  2e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1209  ABC transporter related  59.57 
 
 
256 aa  290  2e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.093328  normal  0.473951 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  59.23 
 
 
239 aa  288  4e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  58.97 
 
 
233 aa  288  4e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  63.09 
 
 
233 aa  288  6e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0936  ABC transporter related  59.23 
 
 
234 aa  288  7e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000438141  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  59.23 
 
 
239 aa  285  2.9999999999999996e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.55 
 
 
234 aa  285  5.999999999999999e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  58.55 
 
 
233 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  58.8 
 
 
235 aa  281  8.000000000000001e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  58.8 
 
 
239 aa  280  1e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  58.37 
 
 
236 aa  280  2e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  59.66 
 
 
249 aa  279  3e-74  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2009  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.65 
 
 
234 aa  276  2e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.378013  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5692  ABC transporter related  54.94 
 
 
234 aa  275  6e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.010773 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2863  ABC transporter-related protein  52.56 
 
 
238 aa  274  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  57.94 
 
 
235 aa  273  2.0000000000000002e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2310  ABC transporter related protein  58.8 
 
 
237 aa  272  3e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  56.84 
 
 
235 aa  272  3e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4257  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  53.85 
 
 
238 aa  271  6e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.309186  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0592  ABC transporter related  53.42 
 
 
238 aa  271  7e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.479264  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1578  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.65 
 
 
236 aa  271  8.000000000000001e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  57.51 
 
 
237 aa  271  9e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2960  ABC transporter related protein  57.94 
 
 
256 aa  270  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587097  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4412  ABC transporter related  53.42 
 
 
238 aa  270  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  55.79 
 
 
234 aa  270  1e-71  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4391  ABC transporter-related protein  53.42 
 
 
238 aa  270  1e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  57.94 
 
 
234 aa  271  1e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  58.3 
 
 
238 aa  270  2e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  57.94 
 
 
236 aa  270  2e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  52.99 
 
 
238 aa  269  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4754  ABC transporter related  52.99 
 
 
238 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.616033  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3793  ABC transporter related  53.85 
 
 
238 aa  269  2.9999999999999997e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4412  ABC transporter related  54.27 
 
 
238 aa  269  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.376021  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0615  ABC transporter related  54.51 
 
 
234 aa  269  2.9999999999999997e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.109789  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2725  ABC transporter related  51.71 
 
 
238 aa  268  4e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.605648  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.99 
 
 
238 aa  268  4e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0882  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.42 
 
 
238 aa  268  5e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.000000000000026853  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1970  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.42 
 
 
234 aa  268  5e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000796203  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1146  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.42 
 
 
238 aa  268  5e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000313887  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3361  ABC transporter related  53.42 
 
 
242 aa  268  5e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.413712 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0986  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.42 
 
 
238 aa  268  5e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350992  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.42 
 
 
238 aa  268  5e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00134652  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0943  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.42 
 
 
238 aa  268  5e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00876691  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0266  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.42 
 
 
238 aa  268  5e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000214299  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3141  ABC transporter related  53.85 
 
 
238 aa  268  5e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0818776  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2709  ABC transporter related  53.42 
 
 
242 aa  268  5e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.810827  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0464  ABC transporter related protein  55.56 
 
 
236 aa  268  7e-71  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  57.08 
 
 
236 aa  268  8e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1726  ABC transporter related  55.56 
 
 
237 aa  267  8e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.972485  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  57.2 
 
 
258 aa  268  8e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1126  putative amino acid ATP-binding ABC transporter protein  55.98 
 
 
237 aa  267  1e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  0.0994747 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0825  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  53.42 
 
 
238 aa  267  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.472761  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1435  ABC transporter-related protein  54.94 
 
 
234 aa  267  1e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0274  ABC transporter related  53.85 
 
 
234 aa  266  2e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.655874  normal  0.777571 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  57.94 
 
 
238 aa  266  2e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  55.56 
 
 
235 aa  266  2e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1530  ABC transporter related  54.94 
 
 
234 aa  266  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0345  ABC transporter related  54.7 
 
 
242 aa  265  2.9999999999999995e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.636106  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1451  ABC transporter related  52.79 
 
 
234 aa  266  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.544969  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0402  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  56.22 
 
 
236 aa  266  2.9999999999999995e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5837  ABC transporter related  52.79 
 
 
234 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000984285 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2437  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.14 
 
 
244 aa  265  4e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.313666  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2428  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  54.94 
 
 
234 aa  265  4e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1539  ABC transporter related  56.22 
 
 
234 aa  265  4e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  57.08 
 
 
245 aa  265  5e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1878  ABC transporter-related protein  52.14 
 
 
242 aa  265  5e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  52.36 
 
 
238 aa  265  5.999999999999999e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1291  ABC transporter related  52.99 
 
 
264 aa  265  5.999999999999999e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2705  ABC transporter related  51.71 
 
 
238 aa  265  5.999999999999999e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663286  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2315  ABC transporter related  51.71 
 
 
238 aa  265  5.999999999999999e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.129419  hitchhiker  0.000435411 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0639  ABC transporter related protein  53.65 
 
 
234 aa  264  7e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.384075  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3205  ABC transporter related  52.99 
 
 
239 aa  264  7e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.689067  normal  0.429117 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2102  ABC transporter related  52.99 
 
 
265 aa  264  8.999999999999999e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1883  ABC transporter related  52.14 
 
 
238 aa  263  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1069  ABC transporter related  54.81 
 
 
240 aa  264  1e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5826  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  52.14 
 
 
238 aa  263  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455686  normal  0.134982 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2519  ABC transporter related  52.14 
 
 
238 aa  263  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.644805  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2125  ABC transporter related  55.65 
 
 
247 aa  263  2e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2494  ABC transporter related  52.14 
 
 
238 aa  263  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1215  ABC transporter related  51.93 
 
 
236 aa  263  2e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2250  ABC transporter related  52.36 
 
 
238 aa  263  2e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  52.14 
 
 
238 aa  262  3e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3251  ABC transporter related  55.36 
 
 
244 aa  262  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.409865  normal  0.293601 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2541  ABC transporter related  52.14 
 
 
238 aa  262  3e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2298  ABC transporter related  55.36 
 
 
234 aa  262  3e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.644067  normal  0.429574 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2953  ABC transporter related  58.97 
 
 
251 aa  262  3e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.680743  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  52.14 
 
 
238 aa  262  3e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0329519 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>