More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1381 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1381  ribosomal protein L20  100 
 
 		 120 aa  236  8e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000161333  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1615  50S ribosomal protein L20  70.09 
 
 		 118 aa  176  8e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000423443  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2658  50S ribosomal protein L20  72.03 
 
 		 119 aa  176  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000886061  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1313  50S ribosomal protein L20  73.04 
 
 		 117 aa  174  5e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000242462  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2398  ribosomal protein L20  70.94 
 
 		 118 aa  174  5e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0041866  normal  0.275247 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0800  50S ribosomal protein L20  72.03 
 
 		 119 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4404  50S ribosomal protein L20  66.1 
 
 		 118 aa  170  5.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000358516  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3259  50S ribosomal protein L20  66.95 
 
 		 118 aa  169  7.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000143022  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4704  50S ribosomal protein L20  65.25 
 
 		 118 aa  169  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000111354  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4469  50S ribosomal protein L20  65.25 
 
 		 118 aa  169  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000222511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4304  50S ribosomal protein L20  65.25 
 
 		 118 aa  169  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.71931e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4315  50S ribosomal protein L20  65.25 
 
 		 118 aa  169  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000569694  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4817  50S ribosomal protein L20  65.25 
 
 		 118 aa  169  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000468944  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4688  50S ribosomal protein L20  65.25 
 
 		 118 aa  169  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.35886e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4697  50S ribosomal protein L20  65.25 
 
 		 118 aa  169  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443116  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0556  50S ribosomal protein L20  65.25 
 
 		 118 aa  169  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000506915  hitchhiker  1.2511e-24 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1821  LSU ribosomal protein L20P  69.3 
 
 		 117 aa  169  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00014178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4681  50S ribosomal protein L20  65.25 
 
 		 118 aa  169  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000654651  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1223  50S ribosomal protein L20  67.83 
 
 		 117 aa  166  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000332435  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2052  50S ribosomal protein L20  66.39 
 
 		 119 aa  165  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00996082  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2170  ribosomal protein L20  65.55 
 
 		 121 aa  164  2.9999999999999998e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00052538  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0217  50S ribosomal protein L20  67.5 
 
 		 120 aa  160  4.0000000000000004e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000274969  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05610  ribosomal protein L20  63.25 
 
 		 119 aa  159  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312556  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1206  50S ribosomal protein L20  66.1 
 
 		 119 aa  158  3e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000522592  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1092  50S ribosomal protein L20  65.25 
 
 		 118 aa  158  3e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000110509  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15180  LSU ribosomal protein L20P  66.67 
 
 		 117 aa  157  6e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00260509  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1664  50S ribosomal protein L20  66.67 
 
 		 118 aa  157  6e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1756  50S ribosomal protein L20  64.1 
 
 		 121 aa  157  7e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000228708  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2381  ribosomal protein L20  64.96 
 
 		 118 aa  155  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2165  50S ribosomal protein L20  64.96 
 
 		 118 aa  155  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000386102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1934  50S ribosomal protein L20  64.96 
 
 		 118 aa  155  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003713  LSU ribosomal protein L20p  66.67 
 
 		 117 aa  154  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000104464  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02082  50S ribosomal protein L20  66.67 
 
 		 117 aa  154  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0939  50S ribosomal protein L20  66.67 
 
 		 117 aa  154  4e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000748381  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0536  ribosomal protein L20  72.65 
 
 		 118 aa  154  5.0000000000000005e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00112168  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0046  ribosomal protein L20  62.93 
 
 		 117 aa  154  5.0000000000000005e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1736  50S ribosomal protein L20  61.86 
 
 		 118 aa  153  6e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000116439  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2216  ribosomal protein L20  64.96 
 
 		 118 aa  154  6e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000311515  normal  0.131567 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1770  50S ribosomal protein L20  61.86 
 
 		 118 aa  153  6e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000104745  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2123  50S ribosomal protein L20  64.1 
 
 		 119 aa  152  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000359041  normal  0.016896 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2302  50S ribosomal protein L20  64.96 
 
 		 118 aa  152  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2187  50S ribosomal protein L20  64.96 
 
 		 118 aa  152  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000144083  normal  0.0378081 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2015  50S ribosomal protein L20  64.96 
 
 		 118 aa  152  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000132248  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2029  50S ribosomal protein L20  64.1 
 
 		 119 aa  152  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000108915  hitchhiker  0.0000236508 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1708  50S ribosomal protein L20  64.96 
 
 		 118 aa  152  1e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0547661  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2496  50S ribosomal protein L20  66.67 
 
 		 118 aa  152  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00192283  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1958  50S ribosomal protein L20  64.96 
 
 		 118 aa  152  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000262165  normal  0.497021 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2018  50S ribosomal protein L20  64.96 
 
 		 118 aa  152  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000148558  normal  0.0497188 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2151  50S ribosomal protein L20  64.96 
 
 		 118 aa  152  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000337835  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2327  50S ribosomal protein L20  64.96 
 
 		 118 aa  152  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000174207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2219  50S ribosomal protein L20  64.96 
 
 		 118 aa  152  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000521277  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2046  50S ribosomal protein L20  64.96 
 
 		 118 aa  152  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000387614  hitchhiker  0.00333012 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2468  50S ribosomal protein L20  64.1 
 
 		 118 aa  151  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0164678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3222  50S ribosomal protein L20  64.1 
 
 		 118 aa  151  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.888026 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3478  50S ribosomal protein L20  64.1 
 
 		 118 aa  151  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0800064  hitchhiker  0.00881726 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1970  50S ribosomal protein L20  64.1 
 
 		 118 aa  151  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0648376  hitchhiker  0.00701004 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1802  50S ribosomal protein L20  64.35 
 
 		 117 aa  152  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0021941  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2144  50S ribosomal protein L20  62.18 
 
 		 119 aa  152  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000000208623  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1856  50S ribosomal protein L20  62.18 
 
 		 119 aa  152  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000191565  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2025  50S ribosomal protein L20  64.1 
 
 		 119 aa  152  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.240457  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1768  50S ribosomal protein L20  63.25 
 
 		 119 aa  152  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000021709  normal  0.0190948 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2488  50S ribosomal protein L20  64.1 
 
 		 119 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000082554  hitchhiker  0.0000796215 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2260  50S ribosomal protein L20  64.1 
 
 		 119 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000555159  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1414  50S ribosomal protein L20  63.25 
 
 		 117 aa  150  5.9999999999999996e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000403686  normal  0.489901 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2507  50S ribosomal protein L20  62.39 
 
 		 118 aa  149  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1979  50S ribosomal protein L20  62.39 
 
 		 118 aa  148  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0347964  normal  0.0774628 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28680  50S ribosomal protein L20  62.39 
 
 		 118 aa  149  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000531022 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25670  LSU ribosomal protein L20P  61.34 
 
 		 125 aa  148  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.826175  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0696  50S ribosomal protein L20  62.61 
 
 		 115 aa  147  4e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129228  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1242  50S ribosomal protein L20  59.32 
 
 		 118 aa  147  5e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000191981  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1518  50S ribosomal protein L20  62.39 
 
 		 117 aa  147  6e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0150794  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5471  ribosomal protein L20  60.5 
 
 		 129 aa  147  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2317  50S ribosomal protein L20  63.25 
 
 		 118 aa  147  6e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000405852  normal  0.195139 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20450  50S ribosomal protein L20  61.54 
 
 		 118 aa  147  7e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.834025  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1872  50S ribosomal protein L20  61.54 
 
 		 117 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000476313  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2305  50S ribosomal protein L20  62.39 
 
 		 117 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00881657  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1997  50S ribosomal protein L20  61.54 
 
 		 118 aa  145  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00229305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0347  50S ribosomal protein L20  60.17 
 
 		 118 aa  145  2.0000000000000003e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2594  ribosomal protein L20  60.68 
 
 		 118 aa  145  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649926  hitchhiker  0.00570674 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2611  50S ribosomal protein L20  60.68 
 
 		 119 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0328909  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2240  50S ribosomal protein L20  60.68 
 
 		 119 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00478573  hitchhiker  0.00537539 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2300  50S ribosomal protein L20  61.54 
 
 		 118 aa  145  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00000821818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0574  50S ribosomal protein L20  61.74 
 
 		 119 aa  145  2.0000000000000003e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1235  ribosomal protein L20  60.68 
 
 		 117 aa  145  2.0000000000000003e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000439682  normal  0.0943757 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1840  50S ribosomal protein L20  61.02 
 
 		 118 aa  145  2.0000000000000003e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1342  ribosomal protein L20  63.72 
 
 		 117 aa  145  3e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00397655  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1748  50S ribosomal protein L20  60.68 
 
 		 118 aa  144  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0111676 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0494  50S ribosomal protein L20  62.28 
 
 		 117 aa  144  4.0000000000000006e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2058  50S ribosomal protein L20  62.39 
 
 		 117 aa  144  5e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.524551  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3167  ribosomal protein L20  63.16 
 
 		 129 aa  144  5e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.406841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1676  ribosomal protein L20  60.17 
 
 		 122 aa  143  9e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.021642  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3054  50S ribosomal protein L20  61.34 
 
 		 121 aa  143  9e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2851  50S ribosomal protein L20  58.97 
 
 		 119 aa  143  9e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0110251 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0366  50S ribosomal protein L20P  58.12 
 
 		 117 aa  143  9e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000702723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2994  50S ribosomal protein L20  62.39 
 
 		 129 aa  142  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170325  normal  0.0515669 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1421  50S ribosomal protein L20  61.02 
 
 		 118 aa  143  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000852478  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2105  50S ribosomal protein L20  57.14 
 
 		 119 aa  142  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136209  normal  0.230589 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0469  50S ribosomal protein L20  58.12 
 
 		 120 aa  142  1e-33  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.667366  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2979  50S ribosomal protein L20  62.39 
 
 		 129 aa  142  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3023  50S ribosomal protein L20  62.39 
 
 		 129 aa  142  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.612405 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>