More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1374 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_2391  peptidase U32  46.76 
 
 
848 aa  737    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.740262  normal  0.817298 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1374  peptidase U32  100 
 
 
838 aa  1655    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.466002  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1637  peptidase U32  48.23 
 
 
847 aa  758    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0544  peptidase U32  49.58 
 
 
835 aa  693    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.814985  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1712  peptidase U32  44.41 
 
 
862 aa  618  1e-175  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000390003  normal  0.623925 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1107  peptidase U32  41.58 
 
 
836 aa  587  1e-166  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0104488  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2086  peptidase U32  38.99 
 
 
839 aa  579  1e-164  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1511  peptidase family protein U32  39.15 
 
 
886 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1861  peptidase U32  40.52 
 
 
810 aa  568  1e-160  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0229  peptidase U32  40.45 
 
 
872 aa  548  1e-154  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.277324  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0176  peptidase U32  35.39 
 
 
835 aa  493  9.999999999999999e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02320  collagenase-like protease  37.06 
 
 
828 aa  436  1e-120  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.265597  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2047  peptidase U32  34 
 
 
783 aa  435  1e-120  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2136  U32 family peptidase  32.27 
 
 
783 aa  426  1e-118  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1848  U32 family peptidase  32.15 
 
 
783 aa  425  1e-117  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1572  peptidase U32  36.81 
 
 
832 aa  421  1e-116  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.812702  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2966  peptidase U32  36.05 
 
 
877 aa  416  9.999999999999999e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.484686  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3761  peptidase U32  36.67 
 
 
835 aa  413  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0962396  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1159  hypothetical protein  35.1 
 
 
783 aa  411  1e-113  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.904079  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0587  peptidase U32  36.86 
 
 
840 aa  394  1e-108  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.684095  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0296  peptidase U32  35.13 
 
 
837 aa  392  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1649  peptidase U32  35.46 
 
 
852 aa  387  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0917  peptidase U32  35.07 
 
 
835 aa  380  1e-104  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1622  proteinase  35.93 
 
 
823 aa  376  1e-103  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0350786 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0703  peptidase U32  33.18 
 
 
841 aa  374  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08360  collagenase-like protease  34.83 
 
 
825 aa  375  1e-102  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.593453 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1293  peptidase U32  36.68 
 
 
839 aa  374  1e-102  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.461857  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1732  peptidase U32  34.39 
 
 
873 aa  367  1e-100  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1655  peptidase U32  35.02 
 
 
833 aa  362  1e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.296071  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0426  peptidase U32  32.91 
 
 
767 aa  359  9.999999999999999e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1336  peptidase U32  30.48 
 
 
817 aa  354  4e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0126233  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2268  peptidase U32  29.05 
 
 
826 aa  352  1e-95  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1237  putative peptidase U32 family protein  34.86 
 
 
851 aa  350  4e-95  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1242  putative peptidase U32 family protein  35.03 
 
 
843 aa  351  4e-95  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.648851 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0153  peptidase U32  36.74 
 
 
805 aa  345  2.9999999999999997e-93  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3702  protease  32.11 
 
 
878 aa  333  9e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.204118  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1278  peptidase U32  34.15 
 
 
847 aa  330  5.0000000000000004e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.615717 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10034  predicted protein  31.52 
 
 
826 aa  318  4e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0064  collagenase-like protease  39.61 
 
 
790 aa  293  1e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0370  peptidase U32  33.74 
 
 
818 aa  289  1e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0065  peptidase U32  38.95 
 
 
822 aa  290  1e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1028  peptidase U32  29.35 
 
 
834 aa  282  2e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0040  peptidase U32  33.83 
 
 
790 aa  281  3e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3347  U32 family peptidase  34.34 
 
 
790 aa  280  6e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3618  peptidase U32  38.13 
 
 
790 aa  280  8e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3552  peptidase U32  37.57 
 
 
792 aa  278  2e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2286  peptidase U32  28.51 
 
 
716 aa  276  1.0000000000000001e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1459  peptidase U32  35.99 
 
 
723 aa  276  1.0000000000000001e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0024  peptidase U32  33.02 
 
 
792 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000675639  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0699  peptidase U32  32.41 
 
 
722 aa  271  5e-71  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0995  peptidase U32  29.62 
 
 
876 aa  262  2e-68  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1337  peptidase U32  31.42 
 
 
736 aa  259  1e-67  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0071  U32 family peptidase  37.14 
 
 
746 aa  258  4e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0943  peptidase U32  37.63 
 
 
411 aa  256  1.0000000000000001e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.600634  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1526  peptidase U32  41.19 
 
 
412 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31073e-27 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0901  peptidase U32  39.5 
 
 
407 aa  255  3e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.451276  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2714  peptidase U32  41.19 
 
 
439 aa  254  7e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2556  U32 family peptidase  42.54 
 
 
404 aa  253  9.000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1338  U32 family protease  33.78 
 
 
621 aa  253  1e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.138533  normal  0.134167 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3693  peptidase U32  40.46 
 
 
404 aa  251  3e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00154214  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1775  peptidase U32  39.77 
 
 
419 aa  251  4e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.768163  normal  0.436207 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0664  peptidase U32  40.97 
 
 
696 aa  251  4e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0317421  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2261  peptidase U32  38.84 
 
 
404 aa  248  2e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105658 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0888  peptidase U32  38.89 
 
 
403 aa  247  6e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0335605  hitchhiker  0.0000000000241821 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1796  peptidase U32  34.32 
 
 
629 aa  247  8e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.191326 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1010  peptidase U32  37.57 
 
 
411 aa  246  9.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1793  peptidase U32  34.07 
 
 
655 aa  246  1.9999999999999999e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1474  peptidase U32  36.59 
 
 
406 aa  246  1.9999999999999999e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00296183  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0821  peptidase U32  32.82 
 
 
644 aa  245  3e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0532  peptidase U32  40.96 
 
 
410 aa  244  3e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1744  peptidase U32  32.31 
 
 
622 aa  242  2e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1685  peptidase U32  36.3 
 
 
403 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1721  peptidase, U32 family  32.34 
 
 
654 aa  241  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.687379  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1738  peptidase, U32 family  32.15 
 
 
654 aa  240  5.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3270  peptidase U32  36.82 
 
 
413 aa  240  6.999999999999999e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000903684  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1532  peptidase U32  34.41 
 
 
403 aa  239  1e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.207316  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1557  peptidase, U32 family  32.15 
 
 
654 aa  239  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1782  peptidase, U32 family  32.27 
 
 
654 aa  239  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1718  peptidase, U32 family  32.15 
 
 
654 aa  239  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.378979  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0882  peptidase U32  33.09 
 
 
652 aa  237  7e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2224  peptidase U32  31.58 
 
 
667 aa  237  8e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.787396 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1519  U32 family peptidase  31.58 
 
 
667 aa  237  8e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1614  U32 family peptidase  31.58 
 
 
667 aa  237  8e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01393  predicted peptidase  31.58 
 
 
653 aa  236  9e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01403  hypothetical protein  31.58 
 
 
653 aa  236  9e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05840  peptidase U32  36.84 
 
 
406 aa  236  1.0000000000000001e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000158903  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2211  peptidase U32  31.39 
 
 
653 aa  236  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.722535  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1739  U32 family peptidase  31.39 
 
 
653 aa  235  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00264856  hitchhiker  0.0000000000000113195 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2040  peptidase, U32 family  31.39 
 
 
667 aa  236  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0020805  hitchhiker  3.90569e-18 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14790  peptidase U32  34.98 
 
 
667 aa  235  3e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0753  protease  34.25 
 
 
635 aa  234  4.0000000000000004e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2024  U32 family peptidase  34.32 
 
 
409 aa  234  4.0000000000000004e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23520  collagenase-like protease  36.61 
 
 
442 aa  234  5e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000439045 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2008  peptidase U32  39.16 
 
 
420 aa  234  7.000000000000001e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0916  peptidase U32  35.8 
 
 
403 aa  233  8.000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.672629  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1741  U32 family peptidase  34.05 
 
 
409 aa  233  9e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0228  peptidase U32  34.81 
 
 
403 aa  233  1e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0725  peptidase, U32 family  34.58 
 
 
428 aa  233  1e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.737074  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1499  peptidase U32  36.08 
 
 
405 aa  232  3e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0742  U32 family peptidase  37.85 
 
 
428 aa  231  5e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.810338  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>