More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1369 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1646  1A family penicillin-binding protein  51.73 
 
 		 828 aa  751    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.651104  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  58.25 
 
 		 761 aa  814    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  51.38 
 
 		 727 aa  722    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  100 
 
 		 765 aa  1575    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  50.63 
 
 		 727 aa  618  1e-175  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  43.76 
 
 		 905 aa  591  1e-167  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0395  penicillin-binding protein, 1A family  50.33 
 
 		 709 aa  548  1e-154  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.14301  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1109  peptidoglycan glycosyltransferase  40.16 
 
 		 795 aa  531  1e-149  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000046818  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0235  penicillin-binding protein, 1A family  41.12 
 
 		 880 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1812  penicillin-binding protein, 1A family  38.85 
 
 		 941 aa  505  1e-141  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.022556  normal  0.0842954 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  40.95 
 
 		 806 aa  487  1e-136  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2069  penicillin-binding protein, 1A family  37.68 
 
 		 843 aa  472  1.0000000000000001e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.23157 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2648  penicillin-binding protein, 1A family  37.99 
 
 		 814 aa  466  9.999999999999999e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.213317  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0242  1A family penicillin-binding protein  39.58 
 
 		 829 aa  451  1e-125  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0511  penicillin-binding protein, 1A family  40.87 
 
 		 901 aa  433  1e-120  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2107  penicillin-binding protein, 1A family  40.36 
 
 		 912 aa  434  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  40.39 
 
 		 643 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  40.39 
 
 		 643 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  40.1 
 
 		 618 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  39.74 
 
 		 640 aa  420  1e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  38.75 
 
 		 643 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0378  penicillin-binding protein, 1A family  39.34 
 
 		 706 aa  419  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  38.9 
 
 		 640 aa  411  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1760  1A family penicillin-binding protein  36.1 
 
 		 824 aa  412  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590244  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3013  penicillin-binding protein 1A/1B  40.97 
 
 		 832 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.462523 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2312  penicillin-binding protein 1A  40.97 
 
 		 830 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  39.71 
 
 		 648 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2370  penicillin-binding protein 1A  40.86 
 
 		 837 aa  405  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0572853  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2122  penicillin-binding protein 1A  41.67 
 
 		 834 aa  403  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  40.49 
 
 		 661 aa  404  1e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1272  1A family penicillin-binding protein  38.62 
 
 		 865 aa  403  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.932198  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2153  1A family penicillin-binding protein  40.4 
 
 		 839 aa  405  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2364  penicillin-binding protein 1A  41.93 
 
 		 834 aa  404  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2185  penicillin-binding protein 1A  41.5 
 
 		 846 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.704699  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2876  glycosyl transferase family 51  36.25 
 
 		 861 aa  401  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.186058  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2108  penicillin-binding protein 1A  41.6 
 
 		 835 aa  402  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.60098  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2345  penicillin-binding protein 1A  41.5 
 
 		 820 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.538811  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2447  penicillin-binding protein 1A  40.47 
 
 		 837 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0929548  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1378  1A family penicillin-binding protein  36.88 
 
 		 679 aa  394  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000265206  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5637  1A family penicillin-binding protein  37.71 
 
 		 794 aa  395  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.751111  normal  0.833891 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1722  1A family penicillin-binding protein  38.53 
 
 		 836 aa  392  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.278842  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  41.83 
 
 		 728 aa  392  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1510  penicillin-binding protein  36.45 
 
 		 680 aa  390  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00148274  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  37.33 
 
 		 625 aa  387  1e-106  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2011  penicillin-binding protein, 1A family  36.38 
 
 		 676 aa  384  1e-105  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  39.17 
 
 		 734 aa  383  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1547  penicillin-binding protein  36.74 
 
 		 667 aa  380  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000544476 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  40.79 
 
 		 727 aa  380  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  40.92 
 
 		 728 aa  380  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  40.86 
 
 		 714 aa  382  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  37.58 
 
 		 646 aa  380  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  41.12 
 
 		 727 aa  380  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3835  penicillin-binding protein 1F (PBP-1F)  36.77 
 
 		 680 aa  381  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.288255  hitchhiker  0.000000000138665 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1561  1A family penicillin-binding protein  36.83 
 
 		 662 aa  377  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1578  penicillin-binding protein  36.74 
 
 		 680 aa  377  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00315585  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1180  1A family penicillin-binding protein  36.19 
 
 		 679 aa  377  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000474619  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1363  penicillin-binding protein  36.58 
 
 		 673 aa  379  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000333103  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1337  penicillin-binding protein 2A  36.75 
 
 		 680 aa  379  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1336  penicillin-binding protein 2A  36.58 
 
 		 680 aa  377  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000691863  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  40.92 
 
 		 751 aa  379  1e-103  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1474  penicillin-binding protein  36.58 
 
 		 673 aa  379  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0083684  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  36.86 
 
 		 648 aa  379  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1616  penicillin-binding protein  36.9 
 
 		 680 aa  378  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866869  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  37.81 
 
 		 654 aa  379  1e-103  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  40.87 
 
 		 714 aa  377  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0823  1A family penicillin-binding protein  36.86 
 
 		 705 aa  376  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0080  1A family penicillin-binding protein  38.19 
 
 		 704 aa  375  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  38.21 
 
 		 776 aa  374  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1671  penicillin-binding protein 1A  37.86 
 
 		 693 aa  375  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000343648  normal  0.536303 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1010  penicillin-binding protein, 1A family  38.44 
 
 		 710 aa  373  1e-102  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1458  penicillin-binding protein  39.03 
 
 		 896 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.126444  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1430  penicillin-binding protein  39.03 
 
 		 897 aa  370  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.14042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1431  penicillin-binding protein  39.03 
 
 		 897 aa  370  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1572  penicillin-binding protein  39.03 
 
 		 897 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  40.92 
 
 		 712 aa  371  1e-101  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  39.57 
 
 		 761 aa  372  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1643  penicillin-binding protein  39.03 
 
 		 897 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00351839 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1716  penicillin-binding protein  39.03 
 
 		 900 aa  369  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.749983  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1678  penicillin-binding protein  38.86 
 
 		 905 aa  368  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1605  penicillin-binding protein  39.23 
 
 		 897 aa  368  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  39.03 
 
 		 741 aa  366  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.244077 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3739  penicillin-binding protein  38.66 
 
 		 647 aa  369  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  35.8 
 
 		 649 aa  368  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0597  penicillin-binding protein, 1A family  33.58 
 
 		 665 aa  367  1e-100  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0316  penicillin-binding protein, 1A family  37.14 
 
 		 750 aa  365  2e-99  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.223118 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3571  penicillin-binding protein, 1A family  38.59 
 
 		 744 aa  364  4e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  39.39 
 
 		 732 aa  363  5.0000000000000005e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1474  1A family penicillin-binding protein  38.13 
 
 		 914 aa  363  7.0000000000000005e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0739  penicillin-binding protein, 1A family  35.63 
 
 		 668 aa  362  2e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  38.05 
 
 		 770 aa  360  4e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  38.94 
 
 		 739 aa  360  7e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0389  penicillin-binding protein, 1A family  38.87 
 
 		 656 aa  359  9.999999999999999e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1269  1A family penicillin-binding protein  38 
 
 		 721 aa  359  9.999999999999999e-98  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000185819  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3502  penicillin-binding protein, 1A family  37.44 
 
 		 701 aa  358  2.9999999999999997e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114695  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  40.43 
 
 		 720 aa  358  2.9999999999999997e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3703  penicillin-binding protein, 1A family  41.22 
 
 		 712 aa  357  5e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.053736 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0988  1A family penicillin-binding protein  35.37 
 
 		 746 aa  356  8.999999999999999e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1342  penicillin-binding protein, 1A family  39.45 
 
 		 824 aa  354  2.9999999999999997e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1421  penicillin-binding protein, 1A family  38.34 
 
 		 801 aa  353  5e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1803  1A family penicillin-binding protein  34.97 
 
 		 708 aa  353  5e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>