More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1308 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1308  major facilitator transporter  100 
 
 
404 aa  779    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000644714  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1678  major facilitator transporter  56.64 
 
 
474 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2358  major facilitator superfamily MFS_1  53.94 
 
 
439 aa  382  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21760  major facilitator superfamily MFS_1  46.23 
 
 
400 aa  335  5.999999999999999e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0116  major facilitator transporter  47.25 
 
 
406 aa  336  5.999999999999999e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1860  major facilitator superfamily MFS_1  47.17 
 
 
407 aa  317  3e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.209124 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1990  putative multidrug resistance protein  41.46 
 
 
409 aa  288  1e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.492861  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3339  putative multidrug resistance protein  41.46 
 
 
409 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000037408 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1802  permease; multidrug resistance protein  38.88 
 
 
432 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1819  multidrug resistance protein  40.92 
 
 
432 aa  281  2e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.310045  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2085  putative multidrug resistance protein  41.19 
 
 
432 aa  281  2e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000147189  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2023  putative multidrug resistance protein  40.92 
 
 
432 aa  281  2e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.52874e-46 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1851  major facilitator transporter  41.19 
 
 
409 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.29974  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1730  major facilitator superfamily MFS_1  45.58 
 
 
415 aa  256  4e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1602  major facilitator superfamily MFS_1  44.26 
 
 
397 aa  225  1e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.822516  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1767  major facilitator superfamily MFS_1  34.51 
 
 
399 aa  196  8.000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.18145 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2610  major facilitator superfamily MFS_1  33.61 
 
 
407 aa  167  4e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1846  transporter protein  38.59 
 
 
229 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.958956  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1847  transporter protein  41.5 
 
 
188 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2355  major facilitator superfamily MFS_1  26.06 
 
 
385 aa  106  6e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2117  major facilitator superfamily MFS_1  28.04 
 
 
391 aa  103  5e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000191868  normal  0.363164 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0686  major facilitator superfamily MFS_1  26.2 
 
 
411 aa  99  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.626773  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3924  major facilitator superfamily MFS_1  28.41 
 
 
400 aa  98.2  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1647  major facilitator superfamily protein  27.3 
 
 
386 aa  95.5  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.761188  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2219  major facilitator transporter  24.59 
 
 
384 aa  92.4  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0273  major facilitator transporter  24 
 
 
405 aa  92  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.473201  normal  0.019317 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1447  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 
399 aa  92  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.320461  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0592  major facilitator superfamily MFS_1  27.57 
 
 
383 aa  91.3  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179102 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1268  major facilitator superfamily transporter  25.29 
 
 
388 aa  90.5  5e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.925266  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0898  major facilitator family transporter  25.27 
 
 
393 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  28.77 
 
 
387 aa  88.2  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0658  major facilitator transporter  24.73 
 
 
392 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0322  major facilitator transporter  27.6 
 
 
390 aa  85.9  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0650  major facilitator family transporter  24.38 
 
 
393 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.407315  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0651  major facilitator family transporter  24.45 
 
 
393 aa  84  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.80626  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0819  major facilitator family transporter  24.45 
 
 
393 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.23042e-52 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3394  GGDEF  25.43 
 
 
421 aa  80.9  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.50121 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0813  major facilitator family transporter  25 
 
 
393 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0707  major facilitator family transporter  23.75 
 
 
393 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0743  major facilitator family transporter  23.75 
 
 
393 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.23331  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4530  major facilitator family transporter  23.08 
 
 
393 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.516795  normal  0.212177 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0801  major facilitator family transporter  24.59 
 
 
394 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2983  major facilitator superfamily MFS_1  23.2 
 
 
404 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4231  major facilitator superfamily MFS_1  26.59 
 
 
415 aa  79  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1662  major facilitator superfamily MFS_1  25.43 
 
 
381 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.127475 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1931  major facilitator transporter  25.45 
 
 
395 aa  77.8  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0709998  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2489  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.39 
 
 
657 aa  77.4  0.0000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2598  major facilitator superfamily MFS_1  29.65 
 
 
420 aa  75.9  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  0.200679 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1778  major facilitator transporter  32.34 
 
 
474 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000929318  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0326  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.7 
 
 
539 aa  75.5  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2340  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.96 
 
 
472 aa  74.7  0.000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0628  major facilitator transporter  25.96 
 
 
394 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0055005  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1499  major facilitator transporter  25.85 
 
 
416 aa  72.8  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1901  major facilitator superfamily MFS_1  26.97 
 
 
405 aa  72.8  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.209847  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2747  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.59 
 
 
500 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29931  multidrug ABC transporter  26.3 
 
 
435 aa  70.5  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.910726 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  23.42 
 
 
416 aa  70.5  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1102  major facilitator superfamily MFS_1  31.79 
 
 
512 aa  70.5  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000316091 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2576  major facilitator superfamily MFS_1  25.14 
 
 
420 aa  70.1  0.00000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.309715  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1079  major facilitator superfamily multi-drug efflux pump  32.08 
 
 
458 aa  68.9  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0013428  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1382  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.08 
 
 
458 aa  69.3  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.229793  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2504  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.54 
 
 
501 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.300835 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  28.88 
 
 
392 aa  68.6  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2318  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.67 
 
 
405 aa  68.9  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.360093  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0032  tetracycline resistance protein, class A  27.92 
 
 
399 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4478  major facilitator transporter  26.53 
 
 
428 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000434229  decreased coverage  0.000716178 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0698  major facilitator transporter  25.35 
 
 
447 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0881  major facilitator family transporter  25.63 
 
 
400 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19471e-35 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0153  tetracycline resistance protein, class A  27.92 
 
 
424 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1857  major facilitator transporter  33.33 
 
 
566 aa  67.4  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.906774  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3011  Arabinose efflux permease-like protein  30.77 
 
 
561 aa  67  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.537649  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4092  major facilitator superfamily MFS_1  25.15 
 
 
396 aa  67.4  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.156772 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0042  tetracycline repressor protein TetA, class A  27.49 
 
 
424 aa  67  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3301  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.21 
 
 
512 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.970656 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2928  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.99 
 
 
534 aa  66.6  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0013  major facilitator superfamily MFS_1  26.61 
 
 
388 aa  66.6  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  28.34 
 
 
389 aa  66.6  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.91 
 
 
522 aa  66.2  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30030  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.98 
 
 
487 aa  66.2  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00171806  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0684  quinolone resistence protein  25.35 
 
 
506 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00565548  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0054  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.97 
 
 
539 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0787  major facilitator family transporter  25.63 
 
 
399 aa  65.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000257301  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1574  major facilitator transporter  29.37 
 
 
565 aa  65.9  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000345614  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1766  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25 
 
 
479 aa  65.1  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.239731  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1686  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.42 
 
 
620 aa  65.1  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.892029  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1176  major facilitator superfamily MFS_1  29.8 
 
 
450 aa  65.5  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0522954 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1514  major facilitator superfamily MFS_1  27.34 
 
 
393 aa  65.1  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2370  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.77 
 
 
520 aa  65.1  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236919  normal  0.7616 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2440  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.07 
 
 
479 aa  65.5  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30430  arabinose efflux permease family protein  26.73 
 
 
446 aa  65.1  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.205391  normal  0.244696 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2488  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.07 
 
 
479 aa  65.5  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0697  quinolone resistence protein NorA  25.07 
 
 
506 aa  64.3  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000944811  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1145  major facilitator transporter  24.63 
 
 
436 aa  64.7  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.667647  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2909  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.79 
 
 
635 aa  64.7  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000610887  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002192  putative MFS transporter  25.8 
 
 
385 aa  64.3  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0137434  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0747  major facilitator transporter  30.99 
 
 
400 aa  64.3  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0658  major facilitator superfamily drug efflux transporter  31.58 
 
 
534 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.36986 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1960  major facilitator transporter  30.87 
 
 
525 aa  64.3  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0420  major facilitator superfamily MFS_1  30.41 
 
 
460 aa  64.3  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1863  major facilitator superfamily permease  29.3 
 
 
465 aa  63.9  0.000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0147099  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>