More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1282 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  100 
 
 
295 aa  590  1e-167  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  51.86 
 
 
295 aa  331  9e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  53.04 
 
 
296 aa  321  9e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  51.35 
 
 
296 aa  320  2e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  53.9 
 
 
295 aa  316  3e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  50 
 
 
299 aa  308  9e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  56.57 
 
 
302 aa  307  1e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  47.46 
 
 
297 aa  298  8e-80  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  49.66 
 
 
298 aa  295  4e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  46.62 
 
 
296 aa  291  6e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  3.17777e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  46.62 
 
 
296 aa  290  2e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  46.62 
 
 
296 aa  290  2e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  46.62 
 
 
296 aa  290  2e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  46.62 
 
 
296 aa  290  2e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  47.81 
 
 
296 aa  290  2e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  46.28 
 
 
296 aa  289  3e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  46.28 
 
 
296 aa  290  3e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  46.28 
 
 
296 aa  290  3e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  46.28 
 
 
296 aa  290  3e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  46.28 
 
 
296 aa  289  3e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  44.41 
 
 
296 aa  287  1e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  51.36 
 
 
295 aa  287  1e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  45.95 
 
 
296 aa  285  4e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  46.18 
 
 
302 aa  283  3e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  46.18 
 
 
302 aa  282  4e-75  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  45.85 
 
 
302 aa  282  5e-75  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1751  tyrosine recombinase XerD  43.05 
 
 
294 aa  278  5e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1674  tyrosine recombinase XerD  48.08 
 
 
297 aa  276  3e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0517708  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  45.12 
 
 
302 aa  276  3e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  8.94527e-13 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  49.15 
 
 
294 aa  275  5e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  49.13 
 
 
309 aa  275  7e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  44.07 
 
 
295 aa  274  1e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0748  tyrosine recombinase XerD  47.12 
 
 
303 aa  272  6e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.50433  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0678  tyrosine recombinase XerD  49.15 
 
 
294 aa  270  3e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0265142 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  43.73 
 
 
295 aa  268  6e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  43.73 
 
 
295 aa  268  6e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1521  tyrosine recombinase XerD  47.73 
 
 
346 aa  268  6e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.531713  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  46.6 
 
 
295 aa  267  2e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3892  site-specific tyrosine recombinase XerD  48.1 
 
 
299 aa  266  3e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.413643  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0927  tyrosine recombinase XerD  46.9 
 
 
304 aa  265  6e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  47.44 
 
 
320 aa  265  6e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1520  tyrosine recombinase XerD  46.77 
 
 
362 aa  264  1e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.83292e-06 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  42.81 
 
 
302 aa  263  3e-69  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1769  tyrosine recombinase XerD  44.83 
 
 
304 aa  263  3e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.151783  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2332  tyrosine recombinase XerD  46.6 
 
 
292 aa  262  4e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0645  site-specific tyrosine recombinase XerD  48.1 
 
 
299 aa  261  9e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.241995  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1457  tyrosine recombinase XerD  46.78 
 
 
292 aa  261  1e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0432704  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3312  site-specific tyrosine recombinase XerD  47.49 
 
 
298 aa  260  2e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1687  tyrosine recombinase XerD subunit  50.85 
 
 
314 aa  260  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1659  tyrosine recombinase XerD subunit  47.06 
 
 
296 aa  259  3e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.538818 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39510  site-specific tyrosine recombinase XerD  46.92 
 
 
298 aa  259  3e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2169  tyrosine recombinase XerD  50.51 
 
 
298 aa  259  4e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3275  site-specific tyrosine recombinase XerD  48.44 
 
 
298 aa  259  5e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3200  site-specific tyrosine recombinase XerD  48.44 
 
 
298 aa  258  7e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3380  site-specific tyrosine recombinase XerD  48.44 
 
 
298 aa  258  7e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3278  site-specific tyrosine recombinase XerD  48.44 
 
 
298 aa  258  7e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3212  site-specific tyrosine recombinase XerD  48.44 
 
 
298 aa  258  7e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.476349 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  41.98 
 
 
296 aa  258  8e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3314  site-specific tyrosine recombinase XerD  47.75 
 
 
298 aa  257  1e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3220  site-specific tyrosine recombinase XerD  47.75 
 
 
298 aa  257  1e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0047  integrase family protein  47.32 
 
 
314 aa  258  1e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0863  phage integrase family protein  47.32 
 
 
313 aa  257  1e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3027  site-specific tyrosine recombinase XerD  47.75 
 
 
298 aa  257  1e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4185  site-specific tyrosine recombinase XerD  47.75 
 
 
298 aa  257  1e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02726  site-specific tyrosine recombinase XerD  47.75 
 
 
298 aa  257  1e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.292633  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0798  tyrosine recombinase XerD  47.75 
 
 
298 aa  257  1e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.966972  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02689  hypothetical protein  47.75 
 
 
298 aa  257  1e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.364794  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0805  tyrosine recombinase XerD  45.86 
 
 
300 aa  257  2e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1971  tyrosine recombinase XerD subunit  45.83 
 
 
309 aa  256  2e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  8.60406e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  46.6 
 
 
295 aa  257  2e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0861  site-specific tyrosine recombinase XerD  47.06 
 
 
299 aa  256  3e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1819  integrase/recombinase XerD  45.92 
 
 
295 aa  256  3e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.530175  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03409  tyrosine recombinase  43.21 
 
 
308 aa  256  3e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3053  site-specific tyrosine recombinase XerD  47.57 
 
 
298 aa  256  4e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1786  tyrosine recombinase XerD  43.06 
 
 
291 aa  255  5e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0596225  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4583  tyrosine recombinase XerD  45.64 
 
 
317 aa  255  5e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.422443 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2452  tyrosine recombinase XerD  46.64 
 
 
306 aa  254  9e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.728507 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0815  site-specific tyrosine recombinase XerD  47.4 
 
 
298 aa  254  9e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.624778  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3847  site-specific tyrosine recombinase XerD  46.37 
 
 
299 aa  254  1e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.349121 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0879  site-specific tyrosine recombinase XerD  46.37 
 
 
299 aa  254  1e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.201006  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3396  site-specific tyrosine recombinase XerD  46.53 
 
 
298 aa  254  1e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3714  tyrosine recombinase XerD  46.18 
 
 
301 aa  254  1e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0920  site-specific tyrosine recombinase XerD  46.37 
 
 
299 aa  254  1e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3426  tyrosine recombinase XerD  46.71 
 
 
299 aa  253  2e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  48.15 
 
 
311 aa  253  2e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0950  integrase/recombinase XerD  45.05 
 
 
300 aa  253  2e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2127  tyrosine recombinase XerD  47.92 
 
 
308 aa  253  2e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3300  tyrosine recombinase XerD  45.33 
 
 
299 aa  253  2e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14190  tyrosine recombinase XerD  48.84 
 
 
321 aa  253  3e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.127512  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1381  site-specific tyrosine recombinase XerD  45.83 
 
 
298 aa  252  4e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00360913  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  47.8 
 
 
304 aa  253  4e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1878  tyrosine recombinase XerD  45.58 
 
 
292 aa  253  4e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0747  tyrosine recombinase XerD  46.1 
 
 
303 aa  252  5e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  6.35712e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3191  tyrosine recombinase XerD subunit  46.71 
 
 
300 aa  252  5e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0770  tyrosine recombinase XerD  46.69 
 
 
303 aa  252  6e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0646575 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2986  site-specific tyrosine recombinase XerD  44.95 
 
 
318 aa  252  6e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1432  tyrosine recombinase XerD  46.69 
 
 
321 aa  252  6e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0895087  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2942  site-specific tyrosine recombinase XerD  44.95 
 
 
318 aa  252  6e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0478  tyrosine recombinase XerD  42.52 
 
 
319 aa  251  7e-66  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2957  site-specific tyrosine recombinase XerD  44.95 
 
 
318 aa  251  8e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  0.636956 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>