More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1229 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_0096  elongation factor G  43.95 
 
 
696 aa  644  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1152  elongation factor G  55.49 
 
 
682 aa  754  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  5.72853e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1045  translation elongation factor G  45.51 
 
 
696 aa  660  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0832  translation elongation factor G  48.48 
 
 
695 aa  692  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2972  translation elongation factor G  54.23 
 
 
673 aa  751  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0074  elongation factor G  44.09 
 
 
696 aa  647  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2879  elongation factor G  48.76 
 
 
694 aa  645  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.450791  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1831  elongation factor G  46.96 
 
 
694 aa  659  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  2.76436e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1142  elongation factor G  57.27 
 
 
680 aa  753  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.283647  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1367  translation elongation factor G  63.49 
 
 
670 aa  878  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00560984 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0068  elongation factor G  47.53 
 
 
691 aa  651  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480211  normal  0.213325 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2318  elongation factor G  45.53 
 
 
701 aa  645  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.866261  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1933  elongation factor G  46.45 
 
 
697 aa  636  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0407442  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1762  translation elongation factor G  62.26 
 
 
667 aa  853  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.352706  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1229  translation elongation factor G  100 
 
 
673 aa  1358  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0505633  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1794  elongation factor G  51.02 
 
 
695 aa  711  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0010  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  50.36 
 
 
692 aa  711  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1319  elongation factor G  46.83 
 
 
694 aa  653  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0378966  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0828  elongation factor G  52.47 
 
 
679 aa  700  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1985  elongation factor G  45.04 
 
 
697 aa  633  1e-180  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.786263  normal  0.270154 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2815  elongation factor G  44.91 
 
 
697 aa  631  1e-179  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1905  elongation factor G  45.24 
 
 
701 aa  630  1e-179  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.129196 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0656  elongation factor G  44.86 
 
 
694 aa  629  1e-179  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1022  elongation factor G  46.21 
 
 
683 aa  628  1e-178  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  45.69 
 
 
689 aa  622  1e-177  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.11404e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  43.8 
 
 
691 aa  622  1e-177  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  9.20124e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  45.36 
 
 
692 aa  624  1e-177  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1969  elongation factor G  44.28 
 
 
692 aa  625  1e-177  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.704236  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0222  translation elongation factor G  46.32 
 
 
689 aa  615  1e-175  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0488172  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0204  small GTP-binding protein  44.88 
 
 
682 aa  617  1e-175  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0153237  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1527  translation elongation factor G  46.58 
 
 
690 aa  612  1e-174  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  8.16454e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1212  elongation factor G  46.06 
 
 
686 aa  612  1e-174  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1113  translation elongation factor G  47.01 
 
 
696 aa  614  1e-174  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.862086  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_995  translation elongation factor, GTPase  46.18 
 
 
683 aa  614  1e-174  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  45.04 
 
 
689 aa  610  1e-173  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  45.66 
 
 
691 aa  609  1e-173  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  45.28 
 
 
692 aa  605  1e-172  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  9.24117e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0712  translation elongation factor G  45.35 
 
 
697 aa  607  1e-172  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0101  elongation factor G  44.84 
 
 
692 aa  602  1e-171  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  5.83321e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0978  translation elongation factor G  45.72 
 
 
691 aa  602  1e-171  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00678136  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0864  elongation factor G  44.17 
 
 
689 aa  600  1e-170  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  3.06199e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0102  elongation factor G  44.69 
 
 
692 aa  599  1e-170  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  1.76822e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0191  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  42.88 
 
 
691 aa  600  1e-170  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  1.12943e-07  hitchhiker  0.00531332 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2375  elongation factor G  44.49 
 
 
698 aa  600  1e-170  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.092172  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37710  elongation factor G  44.14 
 
 
702 aa  595  1e-169  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0915643 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3223  elongation factor G  44.14 
 
 
730 aa  597  1e-169  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0128  elongation factor G  44.4 
 
 
692 aa  595  1e-169  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000285485  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1857  elongation factor G  43.11 
 
 
699 aa  596  1e-169  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00459949  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0107  elongation factor G  44.4 
 
 
692 aa  595  1e-169  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  6.47757e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0138  elongation factor G  44.25 
 
 
692 aa  596  1e-169  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  5.90247e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0334  elongation factor G  43.11 
 
 
699 aa  597  1e-169  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  6.03691e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3663  translation elongation factor G  44.13 
 
 
690 aa  595  1e-169  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.132269 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0107  elongation factor G  44.4 
 
 
692 aa  595  1e-169  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  3.92838e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0107  elongation factor G  44.4 
 
 
692 aa  596  1e-169  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  1.43993e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0103  elongation factor G  44.4 
 
 
692 aa  595  1e-169  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.10071e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0101  elongation factor G  44.25 
 
 
692 aa  595  1e-168  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151971  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0119  elongation factor G  44.25 
 
 
692 aa  593  1e-168  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.92544e-59 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2327  elongation factor G  45.07 
 
 
697 aa  593  1e-168  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  8.53268e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0391  elongation factor G  43.07 
 
 
694 aa  592  1e-168  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2327  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  43.96 
 
 
697 aa  594  1e-168  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000709342  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5198  elongation factor G  44.25 
 
 
692 aa  593  1e-168  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  1.09677e-07  unclonable  1.50309e-24 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0623  elongation factor G  43.78 
 
 
692 aa  594  1e-168  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0450617  hitchhiker  1.23332e-20 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0716  translation elongation factor G  44.52 
 
 
701 aa  592  1e-168  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000130254  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2729  elongation factor G  44.23 
 
 
697 aa  595  1e-168  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.255792  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4540  translation elongation factor G  44.52 
 
 
701 aa  593  1e-168  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.889814 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0366  elongation factor G  43.07 
 
 
694 aa  593  1e-168  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0324  elongation factor G  43.04 
 
 
699 aa  589  1e-167  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.554345  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0494  elongation factor G  43.04 
 
 
699 aa  589  1e-167  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00353597  hitchhiker  1.39334e-08 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1931  elongation factor G  43.65 
 
 
697 aa  589  1e-167  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  44.36 
 
 
692 aa  590  1e-167  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1909  elongation factor G  44.72 
 
 
697 aa  591  1e-167  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.105206 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0453  elongation factor G  42.94 
 
 
691 aa  589  1e-167  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1948  elongation factor G  43.8 
 
 
697 aa  590  1e-167  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0357  translation elongation factor G  43.23 
 
 
692 aa  590  1e-167  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  1.42734e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0475  elongation factor G  44.35 
 
 
691 aa  590  1e-167  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2016  elongation factor G  43.8 
 
 
697 aa  592  1e-167  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0189  translation elongation factor G  44.54 
 
 
691 aa  591  1e-167  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0283  translation elongation factor G  42.86 
 
 
691 aa  585  1e-166  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  2.88442e-06  decreased coverage  2.4327e-05 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1442  elongation factor G  42.79 
 
 
691 aa  587  1e-166  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0542  elongation factor G  42.79 
 
 
691 aa  586  1e-166  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2537  small GTP-binding protein  42.65 
 
 
697 aa  587  1e-166  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0128296  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1861  elongation factor G  43.15 
 
 
709 aa  588  1e-166  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  1.11702e-07  hitchhiker  0.00673824 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0294  elongation factor G  43.21 
 
 
693 aa  587  1e-166  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0513  elongation factor G  42.79 
 
 
691 aa  586  1e-166  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0730313  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09730  translation elongation factor G  42.67 
 
 
688 aa  588  1e-166  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0661  translation elongation factor G  43.99 
 
 
692 aa  585  1e-166  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0156588  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0276  elongation factor G  43.02 
 
 
697 aa  584  1e-165  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  1.25345e-06  unclonable  1.75981e-07 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0188  elongation factor G  42.21 
 
 
693 aa  583  1e-165  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  5.9659e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2185  elongation factor G  42.86 
 
 
708 aa  585  1e-165  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00027976  normal  0.0114318 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0189  elongation factor G  42.42 
 
 
692 aa  581  1e-164  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000566595  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0839  translation elongation factor G  43.88 
 
 
706 aa  581  1e-164  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2068  translation elongation factor G  43.15 
 
 
689 aa  578  1e-164  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  4.50896e-07  normal  0.835571 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3331  elongation factor G  43.02 
 
 
692 aa  578  1e-164  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70074e-16 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0317  elongation factor G  43.27 
 
 
693 aa  581  1e-164  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  2.423e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0289  small GTP-binding protein  42.94 
 
 
703 aa  578  1e-164  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  5.74662e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1660  translation elongation factor G  43.32 
 
 
691 aa  580  1e-164  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00040628  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1769  elongation factor G  43 
 
 
692 aa  579  1e-164  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00415674  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0086  translation elongation factor G  43.39 
 
 
701 aa  580  1e-164  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0459554 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1895  elongation factor G  42.42 
 
 
708 aa  578  1e-164  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  3.65208e-08  normal  0.667418 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0212  elongation factor G  44.79 
 
 
692 aa  579  1e-164  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00232583  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>