150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1225 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1225  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  100 
 
 
148 aa  299  8.000000000000001e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00856956  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0862  anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  56.39 
 
 
142 aa  156  9e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2065  anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  49.64 
 
 
146 aa  151  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000202652  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1497  anti-sigma F factor  54.14 
 
 
148 aa  140  4e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0614  anti-sigma F factor  45.95 
 
 
148 aa  140  5e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1104  anti-sigma F factor  47.97 
 
 
148 aa  140  7e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.860331  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2021  anti-sigma F factor  51.11 
 
 
140 aa  137  4.999999999999999e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2306  anti-sigma F factor  51.11 
 
 
140 aa  137  7e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1558  anti-sigma F factor  47.52 
 
 
143 aa  133  7.000000000000001e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3441  anti-sigma F factor  47.37 
 
 
145 aa  130  6e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0477  anti-sigma F factor  49.64 
 
 
157 aa  122  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.899963  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0119  anti-sigma F factor  48.55 
 
 
149 aa  120  8e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2285  anti-sigma F factor  46.04 
 
 
141 aa  116  9e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07010  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  45.19 
 
 
143 aa  114  3.9999999999999997e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2251  anti-sigma F factor  43.28 
 
 
146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2772  anti-sigma F factor  42.54 
 
 
146 aa  110  6e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0313076  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1745  anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  43.66 
 
 
153 aa  107  4.0000000000000004e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1055  anti-sigma F factor  42.54 
 
 
146 aa  107  5e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0411626 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4183  anti-sigma F factor  42.54 
 
 
146 aa  107  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0790038  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4143  anti-sigma F factor  42.54 
 
 
146 aa  107  6e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00316995  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3984  anti-sigma F factor  42.54 
 
 
146 aa  107  6e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132565  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3814  anti-sigma F factor  42.54 
 
 
146 aa  107  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3830  anti-sigma F factor  42.54 
 
 
146 aa  107  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0386677  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4295  anti-sigma F factor  42.54 
 
 
146 aa  107  6e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65439  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3904  anti-sigma F factor  42.54 
 
 
146 aa  107  6e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4095  anti-sigma F factor  42.54 
 
 
146 aa  107  6e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.69426e-22 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4206  anti-sigma F factor  42.54 
 
 
146 aa  107  6e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000134887  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0373  anti-sigma F factor  41.04 
 
 
146 aa  105  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1662  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.68 
 
 
146 aa  103  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.503488  normal  0.167313 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1681  anti-sigma F factor  42.59 
 
 
154 aa  79.3  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3487  serine-protein kinase RsbW  33.57 
 
 
162 aa  65.9  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0927  serine-protein kinase RsbW  36.72 
 
 
160 aa  60.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0991  serine-protein kinase RsbW  36.72 
 
 
160 aa  60.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1067  serine-protein kinase RsbW  36.72 
 
 
160 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.13388e-38 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3034  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.69 
 
 
155 aa  59.7  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000275353 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0912  serine-protein kinase RsbW  35.94 
 
 
160 aa  59.3  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000281084  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0895  serine-protein kinase RsbW  35.94 
 
 
160 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2399  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.4 
 
 
142 aa  59.3  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.477606 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4100  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.84 
 
 
154 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39959  normal  0.110814 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0030  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 
144 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.786698 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3289  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.5 
 
 
147 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0615968  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1158  serine-protein kinase RsbW  35.94 
 
 
160 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4212  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 
144 aa  57  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.797188  normal  0.229717 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1085  serine-protein kinase RsbW  34.38 
 
 
160 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1473  putative anti-sigma regulatory factor (serine/threonine protein kinase)  34.62 
 
 
135 aa  57  0.00000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00187817  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3290  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.39 
 
 
160 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.018648  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1313  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  27.14 
 
 
135 aa  55.1  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4972  ATP-binding region, ATPase-like  32.76 
 
 
152 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5233  histidine kinase  35.34 
 
 
638 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2452  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.25 
 
 
147 aa  53.9  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0476  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.05 
 
 
134 aa  53.5  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0902  serine-protein kinase RsbW  33.59 
 
 
160 aa  53.5  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.954937  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4563  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.82 
 
 
286 aa  52.4  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1291  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  27.86 
 
 
139 aa  52.4  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4271  serine-protein kinase RsbW  32.81 
 
 
160 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0304057  hitchhiker  0.00223112 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1032  serine-protein kinase RsbW  32.81 
 
 
160 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2412  histidine kinase  32.37 
 
 
603 aa  52  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3766  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  26.96 
 
 
136 aa  51.2  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.069662 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0477  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.3 
 
 
330 aa  51.2  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5777  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  27.5 
 
 
155 aa  50.4  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2795  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.23 
 
 
139 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3337  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.71 
 
 
158 aa  50.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0911  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.75 
 
 
290 aa  50.1  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0731  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.16 
 
 
139 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.993652  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0877  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 
548 aa  48.5  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.991624  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3742  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.3 
 
 
137 aa  48.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.943736  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0657  signal transduction protein  26.62 
 
 
309 aa  48.1  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00784458  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1624  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.68 
 
 
154 aa  48.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0508  histidine kinase  34.48 
 
 
632 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1673  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.69 
 
 
139 aa  47.4  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.11126 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1812  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.1 
 
 
151 aa  47.8  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2116  ATP-binding region ATPase domain protein  28.69 
 
 
137 aa  47.4  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.538209 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3343  histidine kinase  34.48 
 
 
632 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2488  putative anti-sigma regulatory factor (Ser/Thr protein kinase)  28.81 
 
 
129 aa  47  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2972  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.06 
 
 
134 aa  47  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.672639 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3252  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.25 
 
 
139 aa  46.2  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2977  anti-sigma regulatory factor (Ser/Thr protein kinase  35.48 
 
 
141 aa  47  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3113  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.29 
 
 
962 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0730498  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4827  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  27.7 
 
 
155 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0737  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.17 
 
 
133 aa  45.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1443  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 
607 aa  45.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2553  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  27.69 
 
 
324 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3857  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  25.98 
 
 
144 aa  46.2  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.479572 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0915  anti-sigma-factor antagonist  30.28 
 
 
243 aa  45.4  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.583996 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2146  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.96 
 
 
139 aa  46.2  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6564  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.51 
 
 
137 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.019429 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2405  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.81 
 
 
383 aa  45.4  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.109691  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0334  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  27.41 
 
 
149 aa  45.4  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0162  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  27.64 
 
 
133 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4099  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.46 
 
 
147 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.256347  normal  0.1124 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2664  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.32 
 
 
139 aa  45.1  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1429  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.39 
 
 
321 aa  44.7  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0628  signal transduction protein  24.82 
 
 
307 aa  44.7  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2684  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.71 
 
 
137 aa  44.7  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1475  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.39 
 
 
321 aa  44.7  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1228  putative anti-sigma regulatory factor (serine/threonine protein kinase)  31.68 
 
 
144 aa  44.7  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.011235 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3135  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.91 
 
 
137 aa  44.7  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.109754  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0691  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.09 
 
 
142 aa  44.7  0.0005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 
399 aa  44.3  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3439  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.08 
 
 
136 aa  44.3  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.438455  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>