More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1216 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  65.91 
 
 		 483 aa  657    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  100 
 
 		 478 aa  967    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2617  periplasmic binding protein  42.31 
 
 		 380 aa  290  4e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1218  periplasmic binding protein  41.09 
 
 		 358 aa  247  4e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0017043  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0547  periplasmic binding protein  36.13 
 
 		 359 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0286  periplasmic binding protein  36.25 
 
 		 338 aa  212  1e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.234357  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1597  periplasmic binding protein  36.36 
 
 		 409 aa  206  1e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.465677  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1645  periplasmic binding protein  34.35 
 
 		 354 aa  196  5.000000000000001e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.399451  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2098  periplasmic binding protein  33.02 
 
 		 402 aa  192  2e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1317  periplasmic binding protein  34.13 
 
 		 307 aa  172  1e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0528  periplasmic binding protein  34.29 
 
 		 361 aa  170  4e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147263  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1185  periplasmic binding protein  34.94 
 
 		 354 aa  171  4e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.306422  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1591  periplasmic binding protein  32.38 
 
 		 377 aa  168  2e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0970823  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1042  periplasmic binding protein  34.67 
 
 		 354 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1593  periplasmic binding protein  34.59 
 
 		 372 aa  164  3e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0653353  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1151  hypothetical protein  32.79 
 
 		 333 aa  162  2e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0444  periplasmic binding protein  31.79 
 
 		 356 aa  156  8e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0972  periplasmic binding protein  31.07 
 
 		 429 aa  155  1e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2396  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  29.38 
 
 		 375 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.507465 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0712  copper amine oxidase domain-containing protein  58.47 
 
 		 175 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4298  copper amine oxidase domain protein  46.41 
 
 		 452 aa  140  6e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0700285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  30.25 
 
 		 315 aa  140  7e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1314  periplasmic binding protein  29.33 
 
 		 380 aa  139  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0394754 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1056  periplasmic binding protein  31.14 
 
 		 341 aa  139  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0283  periplasmic binding protein  30.75 
 
 		 383 aa  138  3.0000000000000003e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.996344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0025  periplasmic binding protein  33.1 
 
 		 289 aa  137  5e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  29.62 
 
 		 315 aa  137  6.0000000000000005e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0836  periplasmic binding protein  28.53 
 
 		 397 aa  136  7.000000000000001e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00603144  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0650  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, periplasmic binding protein, putative  29.82 
 
 		 338 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000661971  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0684  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, periplasmic binding protein, putative  29.82 
 
 		 338 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0151926  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2212  periplasmic binding protein  30.69 
 
 		 318 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0620  periplasmic binding protein  29.12 
 
 		 337 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000216594  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_588  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, periplasmic component  28.77 
 
 		 338 aa  130  6e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378985  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0416  periplasmic binding protein  30.29 
 
 		 318 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3729  periplasmic binding protein  33.59 
 
 		 312 aa  129  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0685211  hitchhiker  0.00414028 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1754  periplasmic binding protein  30 
 
 		 318 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000128267  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3690  copper amine oxidase domain protein  56.36 
 
 		 216 aa  127  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18990  periplasmic binding protein  29.01 
 
 		 318 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2669  putative ABC transporter, periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  28.82 
 
 		 389 aa  125  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1538  putative ABC transporter periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  28.82 
 
 		 381 aa  125  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2060  periplasmic binding protein  28.07 
 
 		 309 aa  125  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.182535  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2751  periplasmic binding protein  28.82 
 
 		 389 aa  125  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.369256  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7105  ABC Fe3+-hydroxamate transporter, periplasmic ligand binding protein  29.6 
 
 		 401 aa  124  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.320123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0467  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  27.93 
 
 		 384 aa  124  5e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1481  periplasmic binding protein  28.49 
 
 		 354 aa  124  5e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0555  periplasmic binding protein  29.45 
 
 		 317 aa  123  8e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0435  periplasmic binding protein  31.32 
 
 		 362 aa  123  8e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000278634  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3079  periplasmic binding protein  32.3 
 
 		 291 aa  123  9e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498127  normal  0.441233 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0377  periplasmic binding protein  32.62 
 
 		 682 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.786135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3188  copper amine oxidase-like protein  44.03 
 
 		 495 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000368192  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2847  periplasmic binding protein  28.82 
 
 		 354 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1430  periplasmic binding protein  27.87 
 
 		 300 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0250  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  29.35 
 
 		 356 aa  121  3e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0491648  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2367  periplasmic binding protein  26.62 
 
 		 322 aa  121  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0126  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  52.25 
 
 		 907 aa  121  3e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.861357  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0706  copper amine oxidase domain-containing protein  47.06 
 
 		 298 aa  120  4.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0185  periplasmic binding protein  25.56 
 
 		 426 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0952847  normal  0.560438 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0229  periplasmic binding protein  31.12 
 
 		 293 aa  120  6e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3249  periplasmic binding protein  26.54 
 
 		 322 aa  120  7e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000036127  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_68  cobalamin-binding protein  29.41 
 
 		 517 aa  119  7.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1374  MoxR-like ATPases-like  29.02 
 
 		 331 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  hitchhiker  0.000595014 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1316  periplasmic binding protein  28.32 
 
 		 390 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.867732  normal  0.0135564 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1424  periplasmic binding protein  28.28 
 
 		 354 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2309  periplasmic binding protein  28.96 
 
 		 358 aa  117  3e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.66047  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0227  periplasmic binding protein  32.31 
 
 		 682 aa  117  3e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0299459  normal  0.536447 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0526  copper amine oxidase domain-containing protein  45.77 
 
 		 456 aa  117  3.9999999999999997e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000165573  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1596  periplasmic binding protein  30.8 
 
 		 339 aa  117  5e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.691704  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5751  periplasmic binding protein  29.9 
 
 		 313 aa  117  6.9999999999999995e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.48327  hitchhiker  0.000000000101276 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2755  ABC transporter, substrate binding protein  27.48 
 
 		 375 aa  117  6.9999999999999995e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0000138231  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4771  periplasmic binding protein  30.3 
 
 		 370 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3141  periplasmic binding protein  26.51 
 
 		 371 aa  116  8.999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0342  periplasmic binding protein  32.89 
 
 		 267 aa  116  8.999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.102535  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5271  periplasmic binding protein  33.98 
 
 		 274 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1322  periplasmic binding protein  30.74 
 
 		 297 aa  115  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.689282  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0983  periplasmic binding protein  30.85 
 
 		 351 aa  114  4.0000000000000004e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.750238  normal  0.171605 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2741  periplasmic binding protein  27.34 
 
 		 296 aa  114  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2656  periplasmic binding protein  31.56 
 
 		 269 aa  114  4.0000000000000004e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0373  periplasmic binding protein  31.67 
 
 		 723 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.390993 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1093  V-type ATPase, 116 kDa subunit  29.04 
 
 		 376 aa  114  5e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3557  periplasmic binding protein  30.77 
 
 		 276 aa  114  6e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000210628  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1304  periplasmic binding protein  28.52 
 
 		 293 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.76346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1221  ABC transporter substrate binding protein (iron)  28.41 
 
 		 406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0231  periplasmic binding protein  31.38 
 
 		 723 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.999715  normal  0.640564 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0844  periplasmic binding protein  29.64 
 
 		 299 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0726  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.74 
 
 		 304 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.19297  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1693  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  29.97 
 
 		 370 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2146  copper amine oxidase-like protein  53.92 
 
 		 113 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2363  periplasmic binding protein  28.19 
 
 		 289 aa  110  5e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0601  periplasmic binding protein  26.3 
 
 		 354 aa  110  5e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.56983  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0867  periplasmic binding protein  29.43 
 
 		 297 aa  110  6e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3107  copper amine oxidase domain-containing protein  43.31 
 
 		 480 aa  110  6e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000580148  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2696  periplasmic binding protein  27.09 
 
 		 377 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.773462  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0137  periplasmic binding protein  32.95 
 
 		 263 aa  109  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2792  periplasmic binding protein  30.5 
 
 		 292 aa  109  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.912226 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0779  copper amine oxidase-like protein  39.55 
 
 		 450 aa  109  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247024  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2550  periplasmic binding protein  31.27 
 
 		 289 aa  109  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3395  periplasmic binding protein  26.55 
 
 		 350 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.182926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1321  periplasmic binding protein  25.94 
 
 		 366 aa  108  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.77394  normal  0.0125945 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4774  periplasmic binding protein  31.42 
 
 		 311 aa  108  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.739783  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2735  putative iron complex transport system substrate-binding protein  26.69 
 
 		 427 aa  108  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0180927  decreased coverage  0.0000609348 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>