More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1201 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1201  tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 
327 aa  676    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1300  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.04 
 
 
324 aa  438  9.999999999999999e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1133  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.62 
 
 
330 aa  434  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.698787  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0686  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.93 
 
 
329 aa  428  1e-119  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3426  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.04 
 
 
326 aa  426  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2757  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.06 
 
 
329 aa  387  1e-106  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000506928  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1469  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.32 
 
 
329 aa  385  1e-106  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2250  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.71 
 
 
327 aa  379  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000268792  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0792  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.43 
 
 
325 aa  376  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00324527  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0682  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.48 
 
 
330 aa  374  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.415308  normal  0.0278863 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1687  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.58 
 
 
326 aa  370  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0957395  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1833  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.8 
 
 
327 aa  367  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.985699  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2171  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.01 
 
 
331 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.44803  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2119  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.25 
 
 
332 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.926064  normal  0.0320454 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2260  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.01 
 
 
330 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0032  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.5 
 
 
329 aa  366  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1685  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.4 
 
 
331 aa  361  1e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26874  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0775  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 
329 aa  361  1e-98  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.203902  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1925  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.58 
 
 
327 aa  358  6e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3860  tryptophanyl-tRNA synthetase  50 
 
 
359 aa  358  8e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.968888  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2298  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.98 
 
 
327 aa  357  9.999999999999999e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0765  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.69 
 
 
330 aa  357  9.999999999999999e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.664559  normal  0.580666 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1882  tryptophanyl-tRNA synthetase  50 
 
 
328 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0014344  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2336  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.75 
 
 
329 aa  354  1e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3607  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.6 
 
 
329 aa  350  2e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0443  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.42 
 
 
328 aa  350  2e-95  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0428  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.42 
 
 
328 aa  350  2e-95  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2825  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.8 
 
 
329 aa  349  4e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1960  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.12 
 
 
328 aa  348  5e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000535382  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1919  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.91 
 
 
337 aa  338  8e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00690514  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0343  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.6 
 
 
392 aa  330  2e-89  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000289554  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08970  Tryptophanyl-tRNA synthetase  49.09 
 
 
333 aa  328  6e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0887  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.24 
 
 
327 aa  326  4.0000000000000003e-88  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.512903  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0320  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.3 
 
 
331 aa  323  3e-87  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0352  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.9 
 
 
325 aa  320  1.9999999999999998e-86  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0672  tryptophan--tRNA ligase  47.26 
 
 
331 aa  308  5.9999999999999995e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0240521  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1343  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.38 
 
 
323 aa  307  1.0000000000000001e-82  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163691  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1125  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.38 
 
 
323 aa  305  5.0000000000000004e-82  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1154  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.15 
 
 
323 aa  304  1.0000000000000001e-81  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2485  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.94 
 
 
340 aa  304  1.0000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0895292  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0072  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.22 
 
 
354 aa  299  5e-80  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2090  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.06 
 
 
342 aa  298  7e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.679306  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2877  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.06 
 
 
348 aa  298  8e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2236  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.19 
 
 
340 aa  295  6e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.139935  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2482  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.19 
 
 
340 aa  291  9e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1224  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.73 
 
 
373 aa  291  9e-78  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.142423  normal  0.402373 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2700  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.31 
 
 
340 aa  290  2e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2157  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.87 
 
 
335 aa  282  6.000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108936 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1456  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.95 
 
 
335 aa  278  1e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256847  normal  0.958171 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3480  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.38 
 
 
331 aa  271  1e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000674679  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1837  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.1 
 
 
404 aa  269  4e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394357  normal  0.603848 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1145  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.5 
 
 
352 aa  266  4e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000761726 
 
 
-
 
NC_002620  TC0874  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.14 
 
 
346 aa  265  8.999999999999999e-70  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2459  tryptophanyl-tRNA synthetase  66.47 
 
 
400 aa  259  5.0000000000000005e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.915849  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1159  tryptophanyl-tRNA synthetase  61 
 
 
404 aa  258  1e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1602  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 
333 aa  256  2e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.598858  normal  0.880818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0142  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.56 
 
 
327 aa  257  2e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1726  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.5 
 
 
406 aa  256  4e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1466  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 
403 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1789  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 
403 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1686  tryptophanyl-tRNA synthetase  67.06 
 
 
400 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0720  tryptophanyl-tRNA synthetase  60 
 
 
404 aa  254  1.0000000000000001e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1038  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.37 
 
 
405 aa  251  1e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.548207  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0005  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 
351 aa  251  1e-65  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0985  tryptophanyl-tRNA synthetase  68.24 
 
 
400 aa  251  1e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.103287 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1081  tryptophanyl-tRNA synthetase  68.24 
 
 
400 aa  251  1e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.785266  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0584  tryptophanyl-tRNA synthetase  65.88 
 
 
405 aa  249  3e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.118419  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1143  tryptophanyl-tRNA synthetase  67.65 
 
 
400 aa  249  4e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.422783  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0739  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.42 
 
 
402 aa  247  2e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0845  tryptophanyl-tRNA synthetase  65.29 
 
 
400 aa  247  2e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2014  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.71 
 
 
405 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00685202  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0993  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.71 
 
 
400 aa  245  8e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498703  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1399  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.12 
 
 
404 aa  243  1.9999999999999999e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0034  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.62 
 
 
356 aa  244  1.9999999999999999e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2145  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.62 
 
 
356 aa  244  1.9999999999999999e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.106152  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1525  tryptophanyl-tRNA synthetase  68.97 
 
 
400 aa  243  3e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0769059 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1597  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.53 
 
 
404 aa  243  3.9999999999999997e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2317  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.43 
 
 
400 aa  242  5e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2528  tryptophanyl-tRNA synthetase II  43.83 
 
 
346 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1609  tryptophanyl-tRNA synthetase II  43.83 
 
 
346 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0230  tryptophanyl-tRNA synthetase II  43.83 
 
 
346 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0956  tryptophanyl-tRNA synthetase II  43.83 
 
 
346 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2670  tryptophanyl-tRNA synthetase II  43.83 
 
 
346 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.552159  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0267  tryptophanyl-tRNA synthetase II  43.83 
 
 
346 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1413  tryptophanyl-tRNA synthetase II  43.83 
 
 
346 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.718903  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1429  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.12 
 
 
400 aa  236  4e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0450  tryptophanyl-tRNA synthetase II  40.79 
 
 
342 aa  235  7e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.481954 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1177  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.76 
 
 
400 aa  233  3e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000348346 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1680  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.76 
 
 
400 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.544279  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2701  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.76 
 
 
400 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1904  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.76 
 
 
400 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2182  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.76 
 
 
400 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2621  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.76 
 
 
400 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1455  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.76 
 
 
400 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3135  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.76 
 
 
400 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.539368  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2567  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.76 
 
 
400 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.83961  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1583  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.35 
 
 
400 aa  232  5e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.527529  normal  0.529268 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5980  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.76 
 
 
400 aa  232  6e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.107124  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2097  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.76 
 
 
400 aa  232  6e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0501  tryptophanyl-tRNA synthetase II  41.54 
 
 
366 aa  232  7.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163921  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>