More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1186 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1186  tryptophan synthase subunit beta  100 
 
 
394 aa  803  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00284462  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0253  tryptophan synthase subunit beta  71.65 
 
 
396 aa  576  1e-163  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.208201  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1157  tryptophan synthase subunit beta  73.97 
 
 
395 aa  573  1e-162  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1291  tryptophan synthase subunit beta  67.87 
 
 
397 aa  562  1e-159  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1757  tryptophan synthase subunit beta  70.8 
 
 
402 aa  560  1e-158  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  1.3956e-06  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1337  tryptophan synthase subunit beta  70.18 
 
 
401 aa  561  1e-158  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130625  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1211  tryptophan synthase subunit beta  66.58 
 
 
396 aa  546  1e-154  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4200  tryptophan synthase subunit beta  68.91 
 
 
434 aa  544  1e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0203217  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4057  tryptophan synthase subunit beta  68.39 
 
 
431 aa  541  1e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1267  tryptophan synthase subunit beta  65.89 
 
 
399 aa  540  1e-152  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1864  tryptophan synthase subunit beta  65.71 
 
 
391 aa  538  1e-152  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2482  tryptophan synthase subunit beta  66.32 
 
 
396 aa  540  1e-152  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.10786e-10  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0755  tryptophan synthase subunit beta  64.94 
 
 
414 aa  540  1e-152  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1268  tryptophan synthase subunit beta  65.89 
 
 
399 aa  540  1e-152  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3288  tryptophan synthase subunit beta  64.01 
 
 
397 aa  535  1e-151  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.35451e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2069  tryptophan synthase subunit beta  65.89 
 
 
399 aa  537  1e-151  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.166636  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1727  tryptophan synthase subunit beta  65.89 
 
 
399 aa  537  1e-151  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.476833  hitchhiker  0.00551797 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4173  tryptophan synthase subunit beta  67.62 
 
 
432 aa  536  1e-151  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2495  tryptophan synthase subunit beta  65.63 
 
 
405 aa  535  1e-151  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  65.89 
 
 
409 aa  534  1e-150  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2079  tryptophan synthase subunit beta  65.12 
 
 
403 aa  532  1e-150  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1698  tryptophan synthase subunit beta  64.43 
 
 
400 aa  531  1e-150  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.251029 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3321  tryptophan synthase subunit beta  64.78 
 
 
396 aa  531  1e-150  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  3.86703e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1020  tryptophan synthase subunit beta  64.86 
 
 
394 aa  532  1e-150  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1914  tryptophan synthase subunit beta  66.67 
 
 
399 aa  533  1e-150  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.148244  normal  0.536089 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1334  tryptophan synthase, beta subunit  63.82 
 
 
402 aa  530  1e-149  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.999699  normal  0.825059 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2125  tryptophan synthase subunit beta  65.12 
 
 
397 aa  528  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  decreased coverage  0.00480263 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3050  tryptophan synthase subunit beta  66.58 
 
 
420 aa  525  1e-148  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35063  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3066  tryptophan synthase subunit beta  66.84 
 
 
420 aa  526  1e-148  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.910366  normal  0.238699 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4409  tryptophan synthase subunit beta  65.12 
 
 
397 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3062  tryptophan synthase subunit beta  65.12 
 
 
403 aa  526  1e-148  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0925  tryptophan synthase subunit beta  64.01 
 
 
396 aa  526  1e-148  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.74109e-34 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3570  tryptophan synthase subunit beta  65.12 
 
 
397 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266435  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0772  tryptophan synthase subunit beta  65.03 
 
 
397 aa  525  1e-148  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.482746  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1558  tryptophan synthase subunit beta  64.6 
 
 
406 aa  527  1e-148  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3958  tryptophan synthase subunit beta  65.12 
 
 
397 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3109  tryptophan synthase subunit beta  66.58 
 
 
420 aa  525  1e-148  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.284372  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1682  tryptophan synthase subunit beta  66.32 
 
 
428 aa  522  1e-147  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1788  tryptophan synthase subunit beta  63.52 
 
 
435 aa  521  1e-147  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2307  tryptophan synthase subunit beta  64.6 
 
 
397 aa  521  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3348  tryptophan synthase subunit beta  65.12 
 
 
397 aa  523  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0451347  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3046  tryptophan synthase subunit beta  64.86 
 
 
434 aa  522  1e-147  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4374  tryptophan synthase subunit beta  65.12 
 
 
397 aa  521  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4622  tryptophan synthase subunit beta  64.86 
 
 
397 aa  522  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227508  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2157  tryptophan synthase subunit beta  66.06 
 
 
412 aa  524  1e-147  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.595682  normal  0.092632 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3853  tryptophan synthase subunit beta  65.12 
 
 
397 aa  524  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1804  tryptophan synthase subunit beta  65.89 
 
 
404 aa  522  1e-147  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.603761  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1838  tryptophan synthase, beta subunit  65.9 
 
 
417 aa  522  1e-147  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.425448  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1049  tryptophan synthase subunit beta  64.77 
 
 
397 aa  523  1e-147  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.548234 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1149  tryptophan synthase subunit beta  64.42 
 
 
397 aa  521  1e-147  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0432  tryptophan synthase subunit beta  63.38 
 
 
424 aa  521  1e-147  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0679  tryptophan synthase subunit beta  64.6 
 
 
397 aa  523  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.614528  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0769  tryptophan synthase subunit beta  64.6 
 
 
397 aa  521  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  64.77 
 
 
409 aa  519  1e-146  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11310  tryptophan synthase subunit beta  62.08 
 
 
398 aa  521  1e-146  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  2.15917e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3216  tryptophan synthase, beta subunit  66.84 
 
 
449 aa  521  1e-146  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1776  tryptophan synthase subunit beta  64.71 
 
 
413 aa  518  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2445  tryptophan synthase subunit beta  64.34 
 
 
397 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.844513  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0103  tryptophan synthase subunit beta  64.42 
 
 
410 aa  518  1e-146  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4048  tryptophan synthase subunit beta  64.16 
 
 
397 aa  518  1e-146  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1361  tryptophan synthase subunit beta  63.9 
 
 
397 aa  518  1e-146  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0755  tryptophan synthase subunit beta  63.9 
 
 
415 aa  520  1e-146  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  9.54006e-07  normal  0.692308 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1858  tryptophan synthase subunit beta  64.34 
 
 
397 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.308005  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1983  tryptophan synthase subunit beta  64.34 
 
 
403 aa  520  1e-146  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00755336 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1328  tryptophan synthase subunit beta  64.34 
 
 
404 aa  520  1e-146  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.000691779  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0467  tryptophan synthase subunit beta  63.12 
 
 
424 aa  520  1e-146  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.826366 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1296  tryptophan synthase subunit beta  64.42 
 
 
397 aa  519  1e-146  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2306  tryptophan synthase subunit beta  64.86 
 
 
397 aa  519  1e-146  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1721  tryptophan synthase subunit beta  64.34 
 
 
397 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0038  tryptophan synthase subunit beta  63.94 
 
 
402 aa  520  1e-146  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.206234  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0529  tryptophan synthase subunit beta  64.34 
 
 
397 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6842  tryptophan synthase subunit beta  64.34 
 
 
397 aa  519  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.726467  normal  0.411948 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1649  tryptophan synthase subunit beta  64.34 
 
 
397 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0093  tryptophan synthase subunit beta  62.69 
 
 
410 aa  521  1e-146  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1135  tryptophan synthase subunit beta  64.16 
 
 
397 aa  518  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1749  tryptophan synthase subunit beta  64.71 
 
 
413 aa  519  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1511  tryptophan synthase subunit beta  64.95 
 
 
406 aa  515  1e-145  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.818044  normal  0.388935 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1141  tryptophan synthase subunit beta  64.16 
 
 
397 aa  517  1e-145  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1074  tryptophan synthase subunit beta  66.67 
 
 
425 aa  517  1e-145  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.32093  normal  0.660313 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1966  tryptophan synthase subunit beta  63.75 
 
 
411 aa  516  1e-145  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0810  tryptophan synthase subunit beta  64.68 
 
 
406 aa  514  1e-145  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00450  tryptophan synthase subunit beta  62.66 
 
 
402 aa  516  1e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.236429 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1398  tryptophan synthase subunit beta  64.16 
 
 
397 aa  516  1e-145  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.369323  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1693  tryptophan synthase subunit beta  64.51 
 
 
405 aa  516  1e-145  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738848  hitchhiker  7.03836e-07 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28100  tryptophan synthase subunit beta  65.8 
 
 
406 aa  516  1e-145  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.54821  normal  0.926175 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2137  tryptophan synthase subunit beta  64.08 
 
 
397 aa  517  1e-145  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22591  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2042  tryptophan synthase subunit beta  63.57 
 
 
403 aa  515  1e-145  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.104617  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1813  tryptophan synthase subunit beta  64.08 
 
 
397 aa  517  1e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1912  tryptophan synthase subunit beta  63.57 
 
 
398 aa  515  1e-145  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02120  tryptophan synthase subunit beta  64.42 
 
 
406 aa  515  1e-145  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3191  tryptophan synthase, beta subunit  63.31 
 
 
405 aa  515  1e-145  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2467  tryptophan synthase subunit beta  64.6 
 
 
407 aa  516  1e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.379928 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1049  tryptophan synthase, beta subunit  67.18 
 
 
402 aa  516  1e-145  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.644397  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1253  tryptophan synthase subunit beta  64.16 
 
 
397 aa  517  1e-145  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1159  tryptophan synthase subunit beta  65.28 
 
 
418 aa  515  1e-145  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.445238  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0480  tryptophan synthase subunit beta  63.73 
 
 
405 aa  514  1e-145  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1161  tryptophan synthase subunit beta  64.16 
 
 
397 aa  517  1e-145  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1236  tryptophan synthase subunit beta  64.25 
 
 
411 aa  516  1e-145  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.617865  normal  0.527603 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0361  tryptophan synthase subunit beta  66.58 
 
 
398 aa  515  1e-145  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0098  tryptophan synthase subunit beta  63.64 
 
 
405 aa  511  1e-144  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>