More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1127 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  100 
 
 
235 aa  463  9.999999999999999e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  68.38 
 
 
235 aa  332  3e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  68.67 
 
 
239 aa  324  6e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  67.81 
 
 
234 aa  324  8.000000000000001e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  69.23 
 
 
235 aa  322  3e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  66.09 
 
 
234 aa  318  6e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  65.67 
 
 
234 aa  312  1.9999999999999998e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  65.67 
 
 
233 aa  312  2.9999999999999996e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  62.23 
 
 
234 aa  311  3.9999999999999997e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  66.09 
 
 
233 aa  310  1e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  64.81 
 
 
233 aa  308  5.9999999999999995e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  64.81 
 
 
235 aa  307  9e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  62.23 
 
 
237 aa  299  3e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  61.54 
 
 
234 aa  297  8e-80  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  57.94 
 
 
236 aa  295  3e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3251  ABC transporter related  63.95 
 
 
244 aa  295  3e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.409865  normal  0.293601 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  64.81 
 
 
259 aa  294  7e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  58.97 
 
 
237 aa  293  1e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  63.4 
 
 
238 aa  293  1e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  62.23 
 
 
235 aa  293  1e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0731  ABC transporter related  63.09 
 
 
236 aa  290  9e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.346803 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1578  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.08 
 
 
236 aa  288  4e-77  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0402  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  58.8 
 
 
236 aa  288  6e-77  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  64.81 
 
 
235 aa  286  2e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  62.66 
 
 
237 aa  285  5.999999999999999e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  60.68 
 
 
234 aa  284  7e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  59.23 
 
 
236 aa  282  2.0000000000000002e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1086  ABC transporter related  66.09 
 
 
237 aa  282  3.0000000000000004e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0710157  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  58.8 
 
 
236 aa  281  8.000000000000001e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0408  ABC transporter-like protein  59.05 
 
 
237 aa  281  9e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.314132  normal  0.281925 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  61.97 
 
 
236 aa  279  2e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4073  ABC transporter related  61.54 
 
 
243 aa  279  2e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.131918 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2310  ABC transporter related protein  59.66 
 
 
237 aa  279  3e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  61.37 
 
 
237 aa  278  6e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4412  ABC transporter related  58.8 
 
 
238 aa  278  6e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.376021  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0476  ABC transporter related  57.26 
 
 
236 aa  277  1e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  56.65 
 
 
235 aa  277  1e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  60.26 
 
 
245 aa  276  1e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  61.54 
 
 
236 aa  276  2e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  59.83 
 
 
239 aa  275  3e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  58.97 
 
 
249 aa  275  3e-73  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0484  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  55.36 
 
 
237 aa  276  3e-73  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0473  ABC transporter-like  57.51 
 
 
260 aa  275  4e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.492847  normal  0.175391 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  60.26 
 
 
238 aa  274  7e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20640  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  60.17 
 
 
239 aa  274  1.0000000000000001e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.171574  normal  0.883119 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2185  ABC transporter related protein  59.66 
 
 
247 aa  273  1.0000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0936  ABC transporter related  57.08 
 
 
234 aa  273  1.0000000000000001e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000438141  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  60.09 
 
 
235 aa  273  1.0000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  60.94 
 
 
258 aa  273  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.56 
 
 
247 aa  272  3e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  58.97 
 
 
239 aa  272  3e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1209  ABC transporter related  58.55 
 
 
256 aa  271  6e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.093328  normal  0.473951 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1748  ABC transporter component  59.66 
 
 
240 aa  271  7e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.644006  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5692  ABC transporter related  57.51 
 
 
234 aa  270  2e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.010773 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1865  ABC transporter related  58.4 
 
 
247 aa  270  2e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2042  ABC transporter related  58.4 
 
 
247 aa  269  2e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000858552 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1819  ABC transporter-related protein  57.56 
 
 
247 aa  269  2.9999999999999997e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2960  ABC transporter related protein  58.12 
 
 
256 aa  269  2.9999999999999997e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587097  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1675  ABC transporter related  58.4 
 
 
247 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3056  ABC transporter related  58.05 
 
 
239 aa  268  7e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0387789  hitchhiker  0.000278383 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  54.7 
 
 
238 aa  267  1e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0345  ABC transporter related  59.83 
 
 
242 aa  266  1e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.636106  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2495  ABC transporter related  57.94 
 
 
238 aa  267  1e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0427915  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2754  ABC transporter related  55.13 
 
 
238 aa  266  2e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5837  ABC transporter related  57.08 
 
 
234 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000984285 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3291  hypothetical protein  58.3 
 
 
237 aa  265  5.999999999999999e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3770  ABC transporter related protein  60.52 
 
 
237 aa  264  8e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  0.0116376 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3016  ABC transporter related  58.47 
 
 
247 aa  264  8.999999999999999e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498705  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3062  ABC transporter related  58.47 
 
 
247 aa  264  8.999999999999999e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3204  ABC transporter related  54.27 
 
 
237 aa  264  1e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2492  ATPase  58.37 
 
 
237 aa  263  1e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00256607 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0641  ABC transporter related  55.98 
 
 
234 aa  264  1e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2953  ABC transporter related  57.69 
 
 
251 aa  264  1e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.680743  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0464  ABC transporter related protein  53.42 
 
 
236 aa  264  1e-69  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2931  ABC transporter related  56.22 
 
 
237 aa  263  1e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0731  ABC transporter related  57.08 
 
 
237 aa  263  2e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0356  ABC transporter related  58.8 
 
 
240 aa  263  2e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3031  ABC transporter related  58.05 
 
 
247 aa  262  3e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0358479  normal  0.333299 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1215  ABC transporter related  57.69 
 
 
236 aa  262  4e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2125  ABC transporter related  56.72 
 
 
247 aa  261  4.999999999999999e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1435  ABC transporter-related protein  54.27 
 
 
234 aa  261  8e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1530  ABC transporter related  54.7 
 
 
234 aa  261  8e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.62 
 
 
235 aa  260  1e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0999  ABC transporter related  59.49 
 
 
246 aa  260  1e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5998  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.94 
 
 
235 aa  260  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355908  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2428  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  53.85 
 
 
234 aa  260  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1743  ABC transporter related  58.37 
 
 
258 aa  259  2e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2250  ABC transporter related  54.27 
 
 
238 aa  259  2e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3199  ABC transporter-related protein  58.37 
 
 
234 aa  259  3e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2009  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.27 
 
 
234 aa  258  4e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.378013  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0356  ABC transporter related  54.08 
 
 
242 aa  258  5.0000000000000005e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2476  ABC transporter-related protein  54.08 
 
 
233 aa  258  6e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.865811  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26090  ABC transporter, ATP-binding protein  58.8 
 
 
238 aa  258  7e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0561039  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0838  ABC transporter related  55.79 
 
 
239 aa  258  7e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1874  ABC transporter related  54.7 
 
 
233 aa  258  7e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal  0.184488 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4863  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  57.51 
 
 
238 aa  257  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0000477464  hitchhiker  0.0000052401 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1451  ABC transporter related  53.85 
 
 
234 aa  257  1e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.544969  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4741  ABC transporter related  57.51 
 
 
238 aa  257  1e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000344378  hitchhiker  0.000000131699 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3093  ABC transporter related  55.36 
 
 
245 aa  257  1e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2393  ABC transporter related  57.94 
 
 
234 aa  257  1e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361611  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>