More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1110 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  100 
 
 
422 aa  827  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  6.12987e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  58.66 
 
 
421 aa  451  1e-126  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3611  GTP-binding proten HflX  58.98 
 
 
414 aa  443  1e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0108116  normal  0.379187 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  50.24 
 
 
441 aa  374  1e-102  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2262  GTP-binding proten HflX  50 
 
 
435 aa  370  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11140  small GTP-binding protein  53.11 
 
 
395 aa  366  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  51.3 
 
 
461 aa  365  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  3.56343e-05  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2081  small GTP-binding protein  51.38 
 
 
582 aa  364  1e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00812611  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3241  GTP-binding proten HflX  53.99 
 
 
553 aa  354  1e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300166  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  50 
 
 
413 aa  353  2e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27610  GTP-binding proten HflX  52.58 
 
 
482 aa  350  2e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7080  GTP-binding proten HflX  51.9 
 
 
502 aa  350  2e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0178  GTP-binding proten HflX  50.12 
 
 
596 aa  349  5e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.22171  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  50.6 
 
 
454 aa  348  9e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1231  small GTP-binding protein  51.47 
 
 
503 aa  345  6e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.592117  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2263  GTP-binding family protein ; K03665 GTP-binding protein HflX  52.38 
 
 
494 aa  345  1e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0586252 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1051  GTP-binding proten HflX  48.41 
 
 
509 aa  345  1e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.128813 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1140  GTP-binding proten HflX  53.38 
 
 
501 aa  343  3e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.762868 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0820  small GTP-binding protein domain-containing protein  51.76 
 
 
493 aa  343  4e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0010  hypothetical protein  50 
 
 
414 aa  343  5e-93  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0010  hypothetical protein  50 
 
 
414 aa  342  5e-93  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3269  GTP-binding proten HflX  51.46 
 
 
485 aa  342  6e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000617793  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0684  GTP-binding proten HflX  50.84 
 
 
512 aa  340  2e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.518988  normal  0.674112 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  49.88 
 
 
440 aa  338  1e-91  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  49.4 
 
 
454 aa  337  2e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10790  GTP-binding proten HflX  47.16 
 
 
433 aa  336  4e-91  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000931239  unclonable  2.74038e-09 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1174  GTP-binding protein HflX  45.97 
 
 
431 aa  335  1e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.929711  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  49.88 
 
 
433 aa  334  2e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  49.64 
 
 
433 aa  333  3e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4208  GTP-binding protein, HSR1-related  53.33 
 
 
574 aa  330  2e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.552873 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2215  GTP-binding proten HflX  47.49 
 
 
484 aa  331  2e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23070  GTP-binding proten HflX  51.66 
 
 
515 aa  331  2e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0748737 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1800  GTP-binding proten HflX  50.72 
 
 
479 aa  331  2e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  46.4 
 
 
444 aa  330  3e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0275  GTP-binding proten HflX  55.62 
 
 
564 aa  329  4e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0275  GTP-binding proten HflX  55.62 
 
 
564 aa  329  5e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3511  small GTP-binding protein domain-containing protein  53.37 
 
 
486 aa  329  5e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.67992  normal  0.0915245 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10600  GTP-binding proten HflX  50.85 
 
 
521 aa  329  5e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.697427  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1689  GTP1/OBG protein  43.24 
 
 
419 aa  329  6e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00650  GTP-binding protein HflX  46.52 
 
 
429 aa  328  8e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108619  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1872  GTP-binding protein  42.51 
 
 
419 aa  328  8e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26379e-12 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1951  GTP-binding protein  42.51 
 
 
419 aa  328  1e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.697887  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1674  GTP-binding protein  42.26 
 
 
419 aa  327  2e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.887073  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2666  putative GTP-binding protein  48.18 
 
 
441 aa  327  2e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1650  GTP-binding protein  42.26 
 
 
419 aa  327  3e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101149  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3024  GTP-binding protein HflX  48.43 
 
 
435 aa  327  3e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  9.9061e-05  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1562  GTP-binding proten HflX  49.88 
 
 
505 aa  326  4e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.410019  hitchhiker  0.00407104 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  50.13 
 
 
442 aa  326  5e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1693  GTP-binding protein  42.26 
 
 
419 aa  326  5e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.78132  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1828  GTP-binding protein  42.26 
 
 
419 aa  326  5e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1834  GTP-binding protein, HSR1-related  54.21 
 
 
528 aa  326  6e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807644  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2436  GTP-binding proten HflX  50.99 
 
 
493 aa  326  6e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.292704  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3237  GTP-binding protein, HSR1-related  47.03 
 
 
430 aa  326  6e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0665  GTP-binding protein, HSR1-related  48.59 
 
 
445 aa  325  6e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0655164  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1835  GTP-binding protein  42.01 
 
 
419 aa  325  7e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3508  GTP-binding protein  41.77 
 
 
419 aa  325  1e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32115  predicted protein  43.19 
 
 
519 aa  325  1e-87  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0250041 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1482  small GTP-binding protein  50 
 
 
524 aa  325  1e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.578947  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1906  GTP-binding proten HflX  54.34 
 
 
583 aa  324  1e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1731  GTP-binding proten HflX  44.94 
 
 
434 aa  324  2e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1737  GTP-binding protein, HSR1-related  45.84 
 
 
434 aa  323  2e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.260139  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0574  GTP-binding protein, HSR1-related  52.73 
 
 
421 aa  323  3e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227405  hitchhiker  2.64606e-10 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4111  GTP-binding proten HflX  47.8 
 
 
425 aa  323  3e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1434  GTP-binding protein HSR1-related  41.28 
 
 
419 aa  323  4e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0164  GTPase  46.93 
 
 
501 aa  322  7e-87  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3981  GTP-binding proten HflX  50.88 
 
 
487 aa  322  1e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0693971  normal  0.0467716 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2631  GTP-binding protein HSR1-related  47.13 
 
 
429 aa  321  2e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315157  unclonable  6.08691e-12 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17490  GTP-binding proten HflX  48.89 
 
 
517 aa  321  2e-86  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106124  normal  0.236778 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1255  GTP-binding proten HflX  50.8 
 
 
515 aa  320  2e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1503  small GTP-binding protein  48.93 
 
 
530 aa  320  3e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0726763  normal  0.6234 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1466  small GTP-binding protein  47.88 
 
 
522 aa  320  3e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00807526  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2768  GTP-binding protein, HSR1-related  47.54 
 
 
432 aa  320  4e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0497  GTP-binding proten HflX  47.2 
 
 
441 aa  319  6e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.135524  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4769  GTP-binding protein, HSR1-related  48.46 
 
 
433 aa  318  8e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4893  GTP-binding protein HflX  48.46 
 
 
433 aa  318  8e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2776  putative GTPase HflX  45.52 
 
 
439 aa  318  9e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.114582  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4945  GTP-binding proten HflX  48.46 
 
 
433 aa  318  9e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1472  GTP-binding proten HflX  45.24 
 
 
436 aa  318  1e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1355  GTP-binding protein HflX  45.68 
 
 
435 aa  318  1e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4704  putative GTPase HflX  46.62 
 
 
426 aa  318  1e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0970  GTP-binding proten HflX  44.84 
 
 
433 aa  318  1e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.602614 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3820  GTP-binding proten HflX  46.62 
 
 
426 aa  318  1e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0373648  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5689  putative GTPase HflX  46.62 
 
 
426 aa  317  2e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0600434  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3840  putative GTPase HflX  46.62 
 
 
426 aa  317  2e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.209609  hitchhiker  2.30034e-07 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1612  GTP-binding proten HflX  47.3 
 
 
436 aa  317  2e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  2.11402e-05  unclonable  5.44053e-16 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4644  putative GTPase HflX  46.62 
 
 
426 aa  317  2e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0602066 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04002  hypothetical protein  46.62 
 
 
426 aa  317  2e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.170688  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4731  putative GTPase HflX  46.62 
 
 
426 aa  317  2e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04040  predicted GTPase  46.62 
 
 
426 aa  317  2e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.188583  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1922  GTPase  51.81 
 
 
375 aa  317  2e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.321489  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4415  putative GTPase HflX  46.62 
 
 
426 aa  317  2e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.446722  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3204  GTP-binding protein, HSR1-related  51.39 
 
 
435 aa  317  2e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4640  putative GTPase HflX  46.14 
 
 
426 aa  317  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.208484  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4630  putative GTPase HflX  46.14 
 
 
426 aa  317  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.048412  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4780  putative GTPase HflX  46.14 
 
 
426 aa  317  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0452958  normal  0.331117 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4723  putative GTPase HflX  46.14 
 
 
426 aa  317  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0534  GTP-binding proten HflX  46.59 
 
 
420 aa  317  3e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  1.87355e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4759  putative GTPase HflX  46.14 
 
 
426 aa  316  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3905  GTP-binding proten HflX  51.86 
 
 
512 aa  316  5e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.13556  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3539  small GTP-binding protein  54.37 
 
 
431 aa  316  6e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0887499  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>