More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1067 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
202 aa  414  1e-115  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  5.9372e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  67.82 
 
 
205 aa  291  6e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  56.93 
 
 
213 aa  242  3e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  2.63977e-06  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  50.75 
 
 
208 aa  219  3e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  44.06 
 
 
209 aa  172  3e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  44.22 
 
 
214 aa  170  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  43.5 
 
 
209 aa  147  9e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  41 
 
 
209 aa  140  1e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  34.67 
 
 
200 aa  135  3e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  6.81703e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  40.7 
 
 
207 aa  135  6e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  40.39 
 
 
237 aa  134  9e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  33.5 
 
 
211 aa  134  9e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  34.31 
 
 
442 aa  134  1e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  33.17 
 
 
200 aa  134  1e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  2.1297e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 
209 aa  133  2e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  37.13 
 
 
214 aa  132  4e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  38.12 
 
 
235 aa  131  7e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  36.5 
 
 
213 aa  130  9e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  35.32 
 
 
213 aa  130  9e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  33.67 
 
 
200 aa  131  9e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  33.67 
 
 
200 aa  131  9e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0045  phosphoglycerate mutase  35.18 
 
 
217 aa  129  2e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.192648  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  34 
 
 
213 aa  127  8e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  36.14 
 
 
201 aa  126  2e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0084  Phosphoglycerate mutase  37.69 
 
 
207 aa  126  2e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.84 
 
 
442 aa  126  2e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  36.14 
 
 
201 aa  126  2e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.35 
 
 
442 aa  126  2e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0972  Phosphoglycerate mutase  39.11 
 
 
215 aa  125  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  39.2 
 
 
240 aa  125  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  37.36 
 
 
196 aa  124  8e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  1.5335e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  37 
 
 
207 aa  123  2e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  36.14 
 
 
212 aa  122  2e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.35 
 
 
442 aa  122  3e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  39.89 
 
 
222 aa  121  6e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  39.89 
 
 
222 aa  121  6e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1079  phosphoglycerate mutase  38 
 
 
214 aa  121  8e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  1.19918e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0960  phosphoglycerate mutase  38.5 
 
 
214 aa  120  1e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  4.42989e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  38 
 
 
227 aa  120  1e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2470  phosphoglycerate mutase  36.32 
 
 
213 aa  119  2e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  38.5 
 
 
226 aa  119  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  36.22 
 
 
207 aa  119  4e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  38.5 
 
 
226 aa  119  4e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  34.98 
 
 
211 aa  118  6e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  8.5953e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1230  phosphoglycerate mutase  35.5 
 
 
207 aa  118  6e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  34.65 
 
 
253 aa  117  8e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  34.01 
 
 
213 aa  117  1e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  36.45 
 
 
214 aa  117  1e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  36.45 
 
 
214 aa  117  1e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  36.89 
 
 
225 aa  116  2e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3084  alpha-ribazole phosphatase  34.54 
 
 
200 aa  116  2e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.237454  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  33.5 
 
 
442 aa  116  3e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  35.47 
 
 
223 aa  115  5e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  38.42 
 
 
224 aa  115  6e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  38 
 
 
440 aa  115  6e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  33.66 
 
 
217 aa  114  8e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  33.5 
 
 
442 aa  114  8e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  37.76 
 
 
200 aa  114  1e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  34.63 
 
 
220 aa  113  1e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 
214 aa  114  1e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  37.07 
 
 
213 aa  114  1e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  34.63 
 
 
220 aa  113  2e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0998  Phosphoglycerate mutase  31.47 
 
 
201 aa  113  2e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4654  Phosphoglycerate mutase  33.99 
 
 
212 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.40837e-06 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  43.04 
 
 
224 aa  112  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  33.66 
 
 
220 aa  112  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  37.78 
 
 
210 aa  112  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  34.45 
 
 
223 aa  112  4e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  36.1 
 
 
369 aa  112  5e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  31.82 
 
 
210 aa  111  6e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  1.10333e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  35.12 
 
 
445 aa  111  7e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.52 
 
 
443 aa  111  7e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0514  phosphoglycerate mutase  39.41 
 
 
224 aa  111  9e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.575889  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4242  phosphoglycerate mutase  32.85 
 
 
447 aa  110  1e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  35.82 
 
 
212 aa  110  1e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  30.54 
 
 
233 aa  110  1e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4185  phosphoglycerate mutase  31.98 
 
 
200 aa  109  2e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3007  phosphoglycerate mutase family protein, putative  37.06 
 
 
217 aa  109  2e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  35.9 
 
 
200 aa  109  2e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  35.29 
 
 
383 aa  109  2e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1797  Phosphoglycerate mutase  38.69 
 
 
192 aa  108  4e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  33.66 
 
 
221 aa  108  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3671  phosphoglycerate mutase  36.17 
 
 
207 aa  108  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.786994  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2451  phosphoglycerate mutase  41.57 
 
 
207 aa  108  6e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.590939  normal  0.0803681 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1599  phosphoglycerate mutase  37.44 
 
 
223 aa  108  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  33.66 
 
 
221 aa  108  7e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  33.66 
 
 
221 aa  108  7e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.5 
 
 
378 aa  108  7e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2815  phosphoglycerate mutase  31.44 
 
 
202 aa  107  8e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  31.5 
 
 
207 aa  107  8e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  36.68 
 
 
382 aa  108  8e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  34.41 
 
 
212 aa  107  9e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0171  phosphoglycerate mutase  35.26 
 
 
205 aa  107  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3811  alpha-ribazole phosphatase  33.5 
 
 
198 aa  107  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5474  Phosphoglycerate mutase  40.37 
 
 
198 aa  107  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1849  phosphatase PhoE  29.56 
 
 
203 aa  107  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  32.06 
 
 
223 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  29.56 
 
 
203 aa  106  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.37 
 
 
449 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3895  alpha-ribazole phosphatase  32.99 
 
 
198 aa  106  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0234787 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>