More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0991 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  100 
 
 
564 aa  1123    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  55.04 
 
 
553 aa  576  1.0000000000000001e-163  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  50.71 
 
 
561 aa  570  1e-161  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  52.29 
 
 
553 aa  549  1e-155  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  47.32 
 
 
558 aa  529  1e-149  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  47.71 
 
 
558 aa  524  1e-147  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  47.25 
 
 
571 aa  515  1.0000000000000001e-145  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  46.29 
 
 
871 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  49.29 
 
 
554 aa  506  9.999999999999999e-143  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  45.45 
 
 
564 aa  503  1e-141  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  47.42 
 
 
553 aa  496  1e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  45.73 
 
 
556 aa  492  9.999999999999999e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  45.22 
 
 
573 aa  492  9.999999999999999e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  46.13 
 
 
553 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  45.13 
 
 
555 aa  489  1e-137  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  42.46 
 
 
787 aa  489  1e-137  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  46.68 
 
 
557 aa  488  1e-136  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  45 
 
 
563 aa  488  1e-136  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  45.44 
 
 
568 aa  483  1e-135  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  43.97 
 
 
558 aa  484  1e-135  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  46.54 
 
 
561 aa  483  1e-135  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  46.5 
 
 
557 aa  483  1e-135  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  42.5 
 
 
570 aa  479  1e-134  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  45.8 
 
 
568 aa  481  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1022  type II secretion system protein E  47.89 
 
 
554 aa  480  1e-134  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  45.8 
 
 
568 aa  481  1e-134  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  45.36 
 
 
568 aa  478  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  44.6 
 
 
571 aa  478  1e-133  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  43.24 
 
 
561 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  43.32 
 
 
566 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1408  type II secretion system protein E  43.44 
 
 
577 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.22381  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.78 
 
 
571 aa  468  9.999999999999999e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  42.28 
 
 
561 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1166  type II secretion system protein E  45.93 
 
 
572 aa  464  1e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  41.86 
 
 
562 aa  464  1e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  43.36 
 
 
603 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  42.28 
 
 
568 aa  457  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0426  type II secretion system protein E  43.79 
 
 
577 aa  455  1e-127  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0285266  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1792  type II secretion system protein E  43.83 
 
 
573 aa  458  1e-127  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.608065 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.23 
 
 
568 aa  456  1e-127  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  43.33 
 
 
599 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  41.4 
 
 
568 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2272  secretion system protein E  41.76 
 
 
563 aa  455  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  43.51 
 
 
599 aa  453  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.62 
 
 
568 aa  449  1e-125  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2744  type II secretion system protein E  45.44 
 
 
527 aa  449  1e-125  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.804654  normal  0.322952 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1996  type II secretion system protein E  42.96 
 
 
567 aa  450  1e-125  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  43.03 
 
 
599 aa  450  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1028  type II secretion system protein E  43.09 
 
 
568 aa  449  1e-125  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328232 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  44.85 
 
 
563 aa  451  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1731  type II secretion system protein E  40.58 
 
 
561 aa  446  1.0000000000000001e-124  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0239334 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.8 
 
 
568 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.78 
 
 
568 aa  442  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0410  type II secretion system protein E  40.39 
 
 
565 aa  443  1e-123  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.430305  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0594  type II secretion system protein E  43.09 
 
 
888 aa  443  1e-123  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0229677 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  43.27 
 
 
885 aa  442  1e-123  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1924  type II secretion system protein E  42.61 
 
 
576 aa  443  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.13 
 
 
568 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  43.79 
 
 
559 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0879  type II secretion system protein E  45.02 
 
 
569 aa  436  1e-121  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0042  type II secretion system protein E  43.14 
 
 
568 aa  437  1e-121  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4189  type II secretion system protein E  42.75 
 
 
557 aa  434  1e-120  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0608  general secretory pathway protein E  45.06 
 
 
520 aa  432  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000611826 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2895  type II secretion system protein E  41.43 
 
 
580 aa  433  1e-120  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.847539  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1299  general secretory pathway protein E  43.59 
 
 
575 aa  434  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0445374 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0263  type II secretion system protein E  43.99 
 
 
891 aa  433  1e-120  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.198237  normal  0.68743 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4160  general secretory pathway protein E  44.13 
 
 
578 aa  434  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00895585 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1042  general secretory pathway protein E  42.56 
 
 
570 aa  434  1e-120  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.90473  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2420  type II secretion system protein E  42.59 
 
 
573 aa  433  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1276  type II secretion system protein E  41.02 
 
 
563 aa  430  1e-119  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0547  ATPase, type IV pilus assembly protein PilB  42.7 
 
 
565 aa  430  1e-119  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1684  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  42.31 
 
 
577 aa  430  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0417932  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0594  general secretory pathway protein E  45.06 
 
 
520 aa  431  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3004  type II secretion system protein E  42.41 
 
 
573 aa  427  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000330393 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0138  type II secretion system protein E  41.7 
 
 
569 aa  427  1e-118  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0326  type II secretion system protein E  42.4 
 
 
612 aa  426  1e-118  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.038954  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  44.27 
 
 
520 aa  428  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0756  type II secretion system protein E  43.16 
 
 
589 aa  427  1e-118  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1279  type II secretion system protein E  42.43 
 
 
573 aa  424  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0131  type II secretory pathway and PulE/Tfp pilus assembly pathway ATPase PilB  42.63 
 
 
578 aa  422  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0641  type II secretion system protein E  39.78 
 
 
560 aa  425  1e-117  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0579  type II secretion system protein E  40.1 
 
 
576 aa  422  1e-117  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000642239 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1156  type II secretion system protein E  43.49 
 
 
591 aa  425  1e-117  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0688  general secretory pathway protein E  43.44 
 
 
578 aa  424  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0831226 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1039  type II secretion system protein E  39.58 
 
 
583 aa  423  1e-117  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3407  type II secretion system protein E  39.89 
 
 
568 aa  419  1e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2089  general secretory pathway protein E  41.96 
 
 
559 aa  422  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1864  type II secretion system protein E  41.61 
 
 
573 aa  419  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.468476 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0090  type II secretion system protein E  42.22 
 
 
566 aa  422  1e-116  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2609  general secretory pathway protein E  42.56 
 
 
610 aa  421  1e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0938454  normal  0.754135 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2305  general secretion pathway protein E  44.74 
 
 
503 aa  417  9.999999999999999e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18700  type II secretion system protein E  41.83 
 
 
514 aa  416  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0752  pilus assembly pathway ATPase PilB  44.21 
 
 
577 aa  417  9.999999999999999e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.440841  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1103  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.32 
 
 
571 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202418  decreased coverage  0.00743342 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0078  type II secretion system protein E  41.05 
 
 
554 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0328  general secretion pathway protein E  47.68 
 
 
514 aa  412  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3083  type II secretion system protein E  44.93 
 
 
550 aa  413  1e-114  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0750364 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3360  type II secretion system protein E  41.98 
 
 
585 aa  413  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1349  general secretory pathway protein E  52.06 
 
 
520 aa  414  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00254  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshE (pilus type IV)  40.07 
 
 
570 aa  413  1e-114  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>