More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0956 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  62.19 
 
 
558 aa  741  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  60.94 
 
 
561 aa  715  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  100 
 
 
561 aa  1129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  51.8 
 
 
553 aa  551  1e-155  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  49.82 
 
 
556 aa  538  1e-151  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  48.58 
 
 
871 aa  531  1e-149  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  49.91 
 
 
553 aa  527  1e-148  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  48.84 
 
 
557 aa  522  1e-147  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  48.31 
 
 
557 aa  518  1e-145  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  48.92 
 
 
553 aa  514  1e-144  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  47.28 
 
 
570 aa  514  1e-144  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  6.26903e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  47.02 
 
 
558 aa  514  1e-144  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  48.01 
 
 
558 aa  510  1e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1166  type II secretion system protein E  48.67 
 
 
572 aa  509  1e-143  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  47.03 
 
 
555 aa  503  1e-141  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  46.28 
 
 
561 aa  503  1e-141  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  44 
 
 
787 aa  498  1e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  45.03 
 
 
571 aa  496  1e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  46.92 
 
 
553 aa  498  1e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  48.01 
 
 
563 aa  494  1e-138  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  45.96 
 
 
573 aa  486  1e-136  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.62 
 
 
568 aa  486  1e-136  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  47.08 
 
 
564 aa  484  1e-135  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  43.56 
 
 
568 aa  484  1e-135  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  43.8 
 
 
571 aa  480  1e-134  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  43.26 
 
 
564 aa  479  1e-134  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  43.16 
 
 
568 aa  480  1e-134  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  42.86 
 
 
566 aa  476  1e-133  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.62 
 
 
563 aa  476  1e-133  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  46.95 
 
 
559 aa  478  1e-133  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.31 
 
 
571 aa  474  1e-132  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.91 
 
 
568 aa  472  1e-132  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  47.58 
 
 
520 aa  469  1e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  45.45 
 
 
561 aa  469  1e-131  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  44.97 
 
 
885 aa  468  1e-130  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.09 
 
 
568 aa  465  1e-130  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  42.86 
 
 
568 aa  465  1e-130  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.03 
 
 
568 aa  467  1e-130  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1792  type II secretion system protein E  45.76 
 
 
573 aa  466  1e-130  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.608065 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.03 
 
 
568 aa  468  1e-130  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.21 
 
 
568 aa  465  1e-130  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.56 
 
 
568 aa  467  1e-130  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1996  type II secretion system protein E  43.92 
 
 
567 aa  463  1e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0426  type II secretion system protein E  43.87 
 
 
577 aa  462  1e-129  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0285266  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  46.15 
 
 
599 aa  461  1e-128  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  46.15 
 
 
599 aa  460  1e-128  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  43.74 
 
 
603 aa  457  1e-127  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  45.8 
 
 
599 aa  457  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1028  type II secretion system protein E  45.44 
 
 
568 aa  456  1e-127  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328232 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1042  general secretory pathway protein E  42.81 
 
 
570 aa  457  1e-127  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.90473  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.33 
 
 
568 aa  454  1e-126  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1114  general secretion pathway protein E  46.14 
 
 
585 aa  452  1e-126  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0594  type II secretion system protein E  44.31 
 
 
888 aa  450  1e-125  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0229677 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1103  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.24 
 
 
571 aa  449  1e-125  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202418  decreased coverage  0.00743342 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1280  general secretory pathway protein E  49.59 
 
 
521 aa  452  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2609  general secretory pathway protein E  44.91 
 
 
610 aa  451  1e-125  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0938454  normal  0.754135 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0756  type II secretion system protein E  42.96 
 
 
589 aa  450  1e-125  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2089  general secretory pathway protein E  45.21 
 
 
559 aa  448  1e-124  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2305  general secretion pathway protein E  46.83 
 
 
503 aa  447  1e-124  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0408  type II secretion system protein E  41.56 
 
 
570 aa  445  1e-124  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  43.74 
 
 
554 aa  445  1e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0594  general secretory pathway protein E  46.68 
 
 
520 aa  442  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0608  general secretory pathway protein E  46.9 
 
 
520 aa  442  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.11826e-14 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1022  type II secretion system protein E  43.63 
 
 
554 aa  442  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0263  type II secretion system protein E  43.89 
 
 
891 aa  443  1e-123  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.198237  normal  0.68743 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0173  type II secretion system protein E  43.23 
 
 
637 aa  444  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  46.72 
 
 
520 aa  442  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00602  general secretory pathway protein E  47.19 
 
 
501 aa  439  1e-122  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1408  type II secretion system protein E  41.7 
 
 
577 aa  441  1e-122  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.22381  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001891  general secretion pathway protein E  47.29 
 
 
500 aa  441  1e-122  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1299  general secretory pathway protein E  43.75 
 
 
575 aa  440  1e-122  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0445374 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0328  general secretion pathway protein E  48.55 
 
 
514 aa  439  1e-122  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2272  secretion system protein E  42.98 
 
 
563 aa  439  1e-122  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0879  type II secretion system protein E  42.53 
 
 
569 aa  439  1e-122  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1276  type II secretion system protein E  44.17 
 
 
563 aa  437  1e-121  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2895  type II secretion system protein E  44.38 
 
 
580 aa  436  1e-121  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.847539  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  41.84 
 
 
562 aa  438  1e-121  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4160  general secretory pathway protein E  42.75 
 
 
578 aa  435  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00895585 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1585  type II secretion system protein E  42.75 
 
 
552 aa  432  1e-120  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.834386 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3271  type II secretion system protein E  42.83 
 
 
574 aa  432  1e-120  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0064  pilin secretion/fimbrial assembly system protein, PilB  39.86 
 
 
591 aa  429  1e-119  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.978792  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18700  type II secretion system protein E  43.39 
 
 
514 aa  431  1e-119  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0145  general secretory pathway protein E  45.9 
 
 
523 aa  431  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3618  general secretory pathway protein E  47.51 
 
 
523 aa  428  1e-118  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394925  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3528  type II secretion system protein E  45.51 
 
 
586 aa  427  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.305202  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1300  general secretory pathway protein E  51.79 
 
 
498 aa  427  1e-118  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0579  type II secretion system protein E  40.04 
 
 
576 aa  426  1e-118  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  6.42239e-05 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0152  type II secretion system protein E (GspE)  45.79 
 
 
521 aa  425  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.203719  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0157  type II secretion system protein E (GspE)  45.79 
 
 
521 aa  427  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0138  type II secretion system protein E  41.46 
 
 
569 aa  426  1e-118  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3393  type II secretion system protein E  51.08 
 
 
513 aa  426  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.118784  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1351  type II secretion system protein GspE  44.21 
 
 
778 aa  427  1e-118  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0106  general secretory pathway protein E  45.53 
 
 
514 aa  426  1e-118  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1526  type II secretion system protein E  45.28 
 
 
567 aa  426  1e-118  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.30964 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2923  general secretion pathway protein E  52.21 
 
 
499 aa  425  1e-118  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0069  type II secretion system protein E  39.93 
 
 
570 aa  427  1e-118  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.73093  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0152  type II secretion system protein E (GspE)  45.49 
 
 
521 aa  427  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3605  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.53 
 
 
569 aa  423  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.464844  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0388  MshA biogenesis protein MshE  41.01 
 
 
594 aa  423  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000356112  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3243  type II secretion system protein E  51.94 
 
 
499 aa  422  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.286765 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>