46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0940 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0940  hypothetical protein  100 
 
 
330 aa  675    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3172  protein of unknown function DUF114  65.23 
 
 
328 aa  454  1e-127  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.601853  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3346  protein of unknown function DUF114  32.42 
 
 
258 aa  127  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106769  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1836  hypothetical protein  28.19 
 
 
354 aa  89  1e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1629  R2.LlaJI  27.03 
 
 
349 aa  84.3  0.000000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0248162  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0878  hypothetical protein  26.04 
 
 
338 aa  83.2  0.000000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000902689  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2861  protein of unknown function DUF114  26.72 
 
 
336 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1299  protein of unknown function DUF114  29.55 
 
 
277 aa  68.6  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.856082  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1334  protein of unknown function DUF114  32.14 
 
 
280 aa  67.4  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.611057  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03440  periplasmic serine protease (ClpP class)  24.68 
 
 
268 aa  66.6  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4766  protein of unknown function DUF114  27.65 
 
 
296 aa  66.2  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0583634  hitchhiker  0.000468876 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3527  protein of unknown function DUF114  27.92 
 
 
275 aa  65.9  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0011  hypothetical protein  30.34 
 
 
284 aa  65.5  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0011  hypothetical protein  30.34 
 
 
284 aa  65.5  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1198  hypothetical protein  35.87 
 
 
283 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1874  hypothetical protein  30.35 
 
 
297 aa  64.7  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.923248  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3727  hypothetical protein  26.57 
 
 
354 aa  64.7  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.175021  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1781  hypothetical protein  29.57 
 
 
276 aa  65.1  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4091  hypothetical protein  26.85 
 
 
293 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7800  hypothetical protein  35.66 
 
 
276 aa  63.9  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.842137  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1401  protein of unknown function DUF114  30.71 
 
 
277 aa  63.5  0.000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.129163  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0335  hypothetical protein  36 
 
 
281 aa  62.8  0.000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0491521  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3424  protein of unknown function DUF114  25.46 
 
 
339 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0381  hypothetical protein  41.56 
 
 
276 aa  61.2  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.824542  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11070  periplasmic serine protease (ClpP class)  29.6 
 
 
265 aa  61.2  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000898783  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0926  hypothetical protein  34.78 
 
 
274 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2943  hypothetical protein  28.29 
 
 
279 aa  60.8  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0215  protein of unknown function DUF114  31.25 
 
 
278 aa  60.5  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0321874  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1020  hypothetical protein  33.7 
 
 
274 aa  60.5  0.00000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2712  protein of unknown function DUF114  31.54 
 
 
269 aa  60.5  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1661  hypothetical protein  33.7 
 
 
274 aa  60.1  0.00000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2773  hypothetical protein  46.15 
 
 
323 aa  60.1  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1552  hypothetical protein  34.11 
 
 
279 aa  59.7  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238673 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3097  hypothetical protein  28.14 
 
 
282 aa  59.3  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.645048 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1233  hypothetical protein  27.31 
 
 
292 aa  58.2  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.17311  normal  0.434623 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3319  hypothetical protein  33.85 
 
 
278 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0404  protein of unknown function DUF114  33.33 
 
 
280 aa  57.8  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1537  hypothetical protein  29.46 
 
 
301 aa  57.4  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.675779  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4681  hypothetical protein  27.23 
 
 
338 aa  57.4  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.214959  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0558  protein of unknown function DUF114  32.08 
 
 
283 aa  57  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2297  protein of unknown function DUF114  40.91 
 
 
286 aa  57  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0678  hypothetical protein  26.21 
 
 
279 aa  56.6  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0202  protein of unknown function DUF114  24.87 
 
 
283 aa  56.2  0.0000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1139  hypothetical protein  33.77 
 
 
272 aa  56.2  0.0000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3471  protein of unknown function DUF114  29.82 
 
 
296 aa  53.1  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3600  hypothetical protein  33.33 
 
 
272 aa  49.3  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.354038  normal  0.0141904 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>