More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0933 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0933  ribosomal protein S15  100 
 
 
89 aa  181  4.0000000000000006e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00230376  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3181  ribosomal protein S15  75.28 
 
 
89 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.624341 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1657  ribosomal protein S15  70.79 
 
 
89 aa  135  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.4988  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1951  ribosomal protein S15  73.03 
 
 
89 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.245042  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3671  30S ribosomal protein S15  71.26 
 
 
88 aa  130  5e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000549892  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1055  SSU ribosomal protein S15P  68.54 
 
 
89 aa  129  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000690643  hitchhiker  0.0000086131 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1056  30S ribosomal protein S15  68.97 
 
 
88 aa  127  4.0000000000000003e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000322002  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1160  30S ribosomal protein S15  67.42 
 
 
89 aa  126  9.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129722  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1145  ribosomal protein S15  66.29 
 
 
89 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1905  30S ribosomal protein S15  66.67 
 
 
88 aa  125  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000149248  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2052  30S ribosomal protein S15  67.42 
 
 
89 aa  125  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1449  SSU ribosomal protein S15P  66.29 
 
 
89 aa  124  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00001939  normal  0.2265 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1708  ribosomal protein S15  71.43 
 
 
87 aa  123  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0417  30S ribosomal protein S15  71.95 
 
 
87 aa  122  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0791  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 
95 aa  122  1e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000412622  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3846  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 
89 aa  120  5e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3630  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 
89 aa  120  5e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0989611  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3659  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 
89 aa  120  5e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000386008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3549  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 
89 aa  120  5e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3567  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 
89 aa  120  5e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000530871  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1338  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 
89 aa  120  5e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0311618 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2460  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 
89 aa  120  5e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0021133  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3819  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 
89 aa  120  5e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.73221e-63 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3945  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 
89 aa  120  5e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3906  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 
89 aa  120  5e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1441  ribosomal protein S15  66.28 
 
 
88 aa  120  5e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3855  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 
89 aa  120  5e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0905  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 
89 aa  120  7e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.713518  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1673  30S ribosomal protein S15  64.37 
 
 
88 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000247174  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1640  30S ribosomal protein S15  67.82 
 
 
88 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1333  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 
89 aa  119  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.927081  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1359  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 
89 aa  119  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1166  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 
89 aa  118  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.466617  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1590  30S ribosomal protein S15  65.52 
 
 
88 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.18687e-19  normal  0.0361736 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1106  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 
89 aa  118  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1234  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 
89 aa  118  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0854619  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1233  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 
89 aa  119  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1145  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 
89 aa  118  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.150061  normal  0.144917 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1560  30S ribosomal protein S15  62.07 
 
 
88 aa  118  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.2194e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1935  30S ribosomal protein S15  68.67 
 
 
87 aa  117  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1653  30S ribosomal protein S15  68.67 
 
 
87 aa  117  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2509  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 
89 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0967  30S ribosomal protein S15  63.22 
 
 
88 aa  117  6e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000355811  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1307  30S ribosomal protein S15  60.92 
 
 
88 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000433754  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2977  30S ribosomal protein S15  60.92 
 
 
88 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1740699999999999e-20 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3166  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 
89 aa  115  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.177567  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2521  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 
89 aa  115  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.846935  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1592  30S ribosomal protein S15  63.22 
 
 
88 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000646106  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1439  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 
90 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000011609  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1485  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 
90 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0180662  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3228  ribosomal protein S15  63.64 
 
 
90 aa  114  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3723  SSU ribosomal protein S15P  62.92 
 
 
89 aa  113  8.999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0840  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 
89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0081  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 
89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2437  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 
89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.39623  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4063  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 
89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2483  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 
89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.629413  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3030  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 
89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000113979  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0061  ribosomal protein S15  63.41 
 
 
84 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000000587421  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0718  ribosomal protein S15  63.95 
 
 
88 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000223942  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4383  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 
89 aa  111  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.846173 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0490  ribosomal protein S15  62.92 
 
 
89 aa  111  3e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.515865 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3445  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 
89 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0542  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 
89 aa  110  5e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.243245  normal  0.231043 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2074  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 
89 aa  110  7.000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.446463 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2767  30S ribosomal protein S15  63.22 
 
 
88 aa  110  7.000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0332694  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3587  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 
89 aa  110  9e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.99726  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0289  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 
89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.043506 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2419  ribosomal protein S15  58.43 
 
 
89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.746866  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0948  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 
89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0269  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 
89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0214678 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0173  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 
89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.401011  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0614  ribosomal protein S15  60.47 
 
 
88 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.318285  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1417  SSU ribosomal protein S15P  61.63 
 
 
88 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0360533  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2479  ribosomal protein S15  60.67 
 
 
89 aa  109  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.053537  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1257  ribosomal protein S15  57.3 
 
 
89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1920  ribosomal protein S15  59.77 
 
 
87 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1124  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 
89 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2069  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 
89 aa  108  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.614484  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1835  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 
89 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1284  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 
89 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.942726  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1429  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 
89 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2014  ribosomal protein S15  59.55 
 
 
89 aa  108  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0275051  normal  0.303203 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1055  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 
89 aa  108  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00453834  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0743  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 
89 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.660742  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0407  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 
89 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1292  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 
89 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.608351  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0055  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 
89 aa  108  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07890  ribosomal protein S15  60.47 
 
 
88 aa  108  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0070  SSU ribosomal protein S15P  58.43 
 
 
89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000286421  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1433  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 
89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0572737  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1310  ribosomal protein S15  58.43 
 
 
89 aa  107  5e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1338  30S ribosomal protein S15  59.09 
 
 
90 aa  107  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0211534  normal  0.0449315 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2994  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 
89 aa  107  5e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3219  30S ribosomal protein S15  59.09 
 
 
90 aa  107  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.962482 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0212  ribosomal protein S15  60.67 
 
 
89 aa  107  5e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3193  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 
89 aa  107  6e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00194624  normal  0.0112652 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4508  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 
89 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.264804 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1663  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 
89 aa  107  7.000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.1386  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1023  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 
89 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.672022 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>