More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0921 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  100 
 
 
107 aa  216  7e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  4.45063e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  61.9 
 
 
110 aa  150  7e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  1.31883e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  58.1 
 
 
105 aa  147  5e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  55.24 
 
 
105 aa  136  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  2.01022e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  55.77 
 
 
115 aa  134  6e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  50.94 
 
 
109 aa  129  1e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  50 
 
 
108 aa  127  6e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0867  thioredoxin  49.52 
 
 
105 aa  126  9e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.800963  hitchhiker  0.0030343 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3190  thioredoxin  50.98 
 
 
108 aa  126  9e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425401  hitchhiker  0.00537167 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0093  thioredoxin  49.51 
 
 
106 aa  124  4e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00548015 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4710  thioredoxin  50.48 
 
 
105 aa  124  4e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.015363  normal  0.0508397 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0505  thioredoxin  49.06 
 
 
109 aa  124  6e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000129794  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  47.66 
 
 
107 aa  123  7e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  47.66 
 
 
107 aa  123  7e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0301  thioredoxin  49.06 
 
 
106 aa  123  1e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3067  thioredoxin  49.04 
 
 
109 aa  122  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.788534  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  48.51 
 
 
107 aa  122  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  48.51 
 
 
107 aa  122  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  45.79 
 
 
107 aa  121  3e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  7.62931e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0691  thioredoxin  48 
 
 
105 aa  121  3e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3877  thioredoxin  48.04 
 
 
108 aa  121  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  8.66569e-05 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3952  thioredoxin  48.04 
 
 
108 aa  121  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4070  thioredoxin  48.04 
 
 
108 aa  121  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3929  thioredoxin  48.04 
 
 
108 aa  121  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  46.73 
 
 
107 aa  121  3e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  1.30429e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  49.5 
 
 
107 aa  121  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3216  thioredoxin  50 
 
 
108 aa  121  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.604019  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0406  thioredoxin 1  48.04 
 
 
108 aa  121  4e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0409  thioredoxin  48.04 
 
 
108 aa  121  4e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00884025 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3615  thioredoxin  48.04 
 
 
108 aa  121  4e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0410  thioredoxin  48.04 
 
 
108 aa  121  4e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0404  thioredoxin  51.96 
 
 
109 aa  120  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3433  thioredoxin  49.02 
 
 
108 aa  120  5e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2997  thioredoxin  50 
 
 
108 aa  120  5e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140108  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04950  thioredoxin  45.71 
 
 
105 aa  120  7e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0448  thioredoxin  50 
 
 
108 aa  120  8e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0621  thioredoxin  53.26 
 
 
108 aa  120  8e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000184635  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  50.96 
 
 
108 aa  119  1e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0460  thioredoxin  49.02 
 
 
108 aa  119  1e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.810082  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2950  thioredoxin  49.51 
 
 
106 aa  119  1e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.184197  normal  0.155868 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3281  thioredoxin  49.06 
 
 
109 aa  119  1e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0404  thioredoxin  50 
 
 
109 aa  119  1e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  1.90247e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18120  thioredoxin  47.47 
 
 
106 aa  119  1e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.83291e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2805  thioredoxin  42.86 
 
 
109 aa  119  2e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686799 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  47.52 
 
 
107 aa  119  2e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4110  thioredoxin  48.08 
 
 
108 aa  119  2e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.465308  hitchhiker  7.24164e-05 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  47.31 
 
 
107 aa  118  2e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  47.31 
 
 
107 aa  118  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0513  thioredoxin  48.08 
 
 
108 aa  118  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2698  thioredoxin  47.12 
 
 
108 aa  118  3e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0171911  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  47.52 
 
 
110 aa  118  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0179  thioredoxin  48.54 
 
 
106 aa  117  4e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.292519  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  43.27 
 
 
108 aa  117  4e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  43.27 
 
 
108 aa  117  4e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  43.27 
 
 
108 aa  117  4e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  43.27 
 
 
108 aa  117  4e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  43.27 
 
 
108 aa  117  4e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  43.27 
 
 
108 aa  117  4e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1529  thioredoxin  48.54 
 
 
106 aa  117  4e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.643867  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0398  thioredoxin  47.12 
 
 
108 aa  117  4e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  46.53 
 
 
119 aa  117  5e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4906  thioredoxin  46.53 
 
 
106 aa  117  5e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.803641  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4956  thioredoxin  45.54 
 
 
106 aa  117  6e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  43.27 
 
 
146 aa  117  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5927  thioredoxin  44.23 
 
 
110 aa  117  7e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365173  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2289  thioredoxin  50.56 
 
 
108 aa  117  7e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  8.76713e-08  normal  0.363166 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0156  thioredoxin  44.23 
 
 
108 aa  117  7e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2323  thioredoxin  43.14 
 
 
110 aa  116  8e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4174  thioredoxin  43.69 
 
 
107 aa  117  8e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  43.27 
 
 
108 aa  116  9e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  43.27 
 
 
108 aa  116  9e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  43.27 
 
 
108 aa  116  9e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  43.27 
 
 
108 aa  116  9e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  43.27 
 
 
108 aa  116  9e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  47.06 
 
 
107 aa  116  9e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  43.27 
 
 
108 aa  116  9e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  43.27 
 
 
108 aa  116  9e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0175  thioredoxin  50.56 
 
 
108 aa  116  1e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2185  thioredoxin  54.12 
 
 
112 aa  116  1e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  1.21318e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  43.27 
 
 
146 aa  115  1e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3230  thioredoxin  46.23 
 
 
109 aa  116  1e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  9.30614e-09  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  46.15 
 
 
114 aa  116  1e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  47.52 
 
 
110 aa  115  1e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4407  thioredoxin  48.51 
 
 
113 aa  116  1e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  46.67 
 
 
133 aa  115  1e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2211  thioredoxin  54.12 
 
 
112 aa  116  1e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  7.65425e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  46.6 
 
 
150 aa  116  1e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  44.23 
 
 
108 aa  116  1e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  42.31 
 
 
108 aa  115  2e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  43.14 
 
 
106 aa  115  2e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3582  thioredoxin  46.74 
 
 
107 aa  115  2e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.968394  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  43.27 
 
 
108 aa  115  2e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1344  thioredoxin  44.55 
 
 
107 aa  115  2e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00788637  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2362  thioredoxin  48.31 
 
 
108 aa  115  2e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0224789  normal  0.140308 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  43.27 
 
 
108 aa  115  2e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1825  thioredoxin  48.31 
 
 
108 aa  115  2e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0606148  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0363  thioredoxin  46.23 
 
 
109 aa  115  2e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.45924e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0950  thioredoxin  48.31 
 
 
108 aa  115  2e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.263431  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3439  thioredoxin  48.42 
 
 
106 aa  114  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0028  thioredoxin  50 
 
 
106 aa  115  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>