More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0912 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0635  alanyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 
860 aa  669  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.427199  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00147  alanyl-tRNA synthetase  44.48 
 
 
882 aa  691  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.328967  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0744  alanyl-tRNA synthetase  43.73 
 
 
888 aa  707  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.453512  normal  0.711122 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2824  alanyl-tRNA synthetase  44.14 
 
 
874 aa  717  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0756598 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3180  alanyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 
876 aa  696  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  2.08446e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1613  alanyl-tRNA synthetase  44.37 
 
 
874 aa  725  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894889  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2405  alanyl-tRNA synthetase  43.3 
 
 
901 aa  672  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.665825  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0087  alanyl-tRNA synthetase  44.17 
 
 
884 aa  674  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000138455  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1324  alanyl-tRNA synthetase  43.37 
 
 
874 aa  710  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1437  alanyl-tRNA synthetase  43.39 
 
 
874 aa  684  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.738644 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2001  alanyl-tRNA synthetase  42.92 
 
 
875 aa  658  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.79189e-06 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0101  alanyl-tRNA synthetase  43.91 
 
 
884 aa  679  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5834  alanyl-tRNA synthetase  46.16 
 
 
886 aa  686  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.227807 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1387  alanyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 
874 aa  705  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.371658 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3339  alanyl-tRNA synthetase  42.63 
 
 
874 aa  699  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0101035  hitchhiker  6.88194e-07 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5607  alanyl-tRNA synthetase  45.63 
 
 
892 aa  707  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.346592  normal  0.706144 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3763  alanyl-tRNA synthetase  45.08 
 
 
897 aa  684  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.469111  normal  0.276016 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1780  alanyl-tRNA synthetase  48.34 
 
 
878 aa  857  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2626  alanyl-tRNA synthetase  44.98 
 
 
891 aa  704  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.643973  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1052  alanyl-tRNA synthetase  44.96 
 
 
877 aa  713  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.103695 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3136  alanyl-tRNA synthetase  44.2 
 
 
876 aa  712  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299814  hitchhiker  0.000378627 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2946  alanyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 
876 aa  706  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00651312  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3633  alanyl-tRNA synthetase  45.84 
 
 
875 aa  756  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511669  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3839  alanyl-tRNA synthetase  46.86 
 
 
905 aa  757  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.538554  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02846  alanyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 
865 aa  680  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.12148  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1536  alanyl-tRNA synthetase  39.68 
 
 
856 aa  653  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  2.7092e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2978  alanyl-tRNA synthetase  44.09 
 
 
876 aa  712  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.471212  decreased coverage  0.000181445 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3013  alanyl-tRNA synthetase  44.2 
 
 
876 aa  712  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.627309  decreased coverage  1.32365e-06 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3029  alanyl-tRNA synthetase  44.2 
 
 
876 aa  712  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0315037  decreased coverage  3.67228e-05 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1478  alanyl-tRNA synthetase  44.83 
 
 
882 aa  690  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.734898  normal  0.362746 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0302  alanyl-tRNA synthetase  42.75 
 
 
885 aa  647  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.125416 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4372  alanyl-tRNA synthetase  45.44 
 
 
889 aa  702  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0330  alanyl-tRNA synthetase  42.33 
 
 
886 aa  655  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.43097  normal  0.0181617 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3154  alanyl-tRNA synthetase  47.24 
 
 
876 aa  807  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0146  alanyl-tRNA synthetase  45.34 
 
 
876 aa  743  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0010822  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2820  alanyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 
876 aa  698  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  7.29274e-05  hitchhiker  2.729e-05 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1433  alanyl-tRNA synthetase  45.63 
 
 
863 aa  745  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1015  alanyl-tRNA synthetase  43.23 
 
 
876 aa  699  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00108503  hitchhiker  0.000252417 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1268  alanyl-tRNA synthetase  46.58 
 
 
876 aa  748  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1694  alanyl-tRNA synthetase  43.98 
 
 
892 aa  682  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0569274  normal  0.130258 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1196  alanyl-tRNA synthetase  42.97 
 
 
875 aa  686  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00838926  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0843  alanyl-tRNA synthetase  43.82 
 
 
892 aa  721  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  2.00247e-06  unclonable  3.09197e-08 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1318  alanyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 
874 aa  700  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0106685  hitchhiker  0.00151314 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2980  alanyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 
876 aa  698  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  4.68314e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2833  alanyl-tRNA synthetase  43.23 
 
 
876 aa  700  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.53011e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03511  alanyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 
865 aa  674  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3711  alanyl-tRNA synthetase  45.5 
 
 
905 aa  726  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.296443  hitchhiker  6.4855e-05 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0990  alanyl-tRNA synthetase  41.94 
 
 
865 aa  686  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4081  alanyl-tRNA synthetase  44.2 
 
 
884 aa  644  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2579  alanyl-tRNA synthetase  43.71 
 
 
913 aa  684  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.159446  normal  0.328441 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1499  alanyl-tRNA synthetase  44.03 
 
 
867 aa  731  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3238  alanyl-tRNA synthetase  42.92 
 
 
875 aa  679  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.22674e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3904  alanyl-tRNA synthetase  46.02 
 
 
904 aa  741  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.639044  normal  0.0112827 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3101  alanyl-tRNA synthetase  48 
 
 
880 aa  811  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.438368  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1642  alanyl-tRNA synthetase  44.18 
 
 
887 aa  676  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.338529  hitchhiker  2.32232e-10 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1819  alanyl-tRNA synthetase  43.74 
 
 
892 aa  686  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  3.66282e-05 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3373  alanyl-tRNA synthetase  42.92 
 
 
875 aa  679  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0247326  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0912  alanyl-tRNA synthetase  100 
 
 
880 aa  1781  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00106674  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1394  alanyl-tRNA synthetase  41.7 
 
 
883 aa  654  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3979  alanyl-tRNA synthetase  45.19 
 
 
897 aa  686  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.567891  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1489  alanyl-tRNA synthetase  49.37 
 
 
877 aa  875  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  1.63922e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4235  alanyl-tRNA synthetase  47.32 
 
 
880 aa  796  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.688921  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2598  alanyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 
891 aa  693  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.695693  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0898  alanyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 
875 aa  678  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.0723e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0883  alanyl-tRNA synthetase  41.83 
 
 
865 aa  684  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  8.18492e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1906  alanyl-tRNA synthetase  43.57 
 
 
874 aa  703  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.206627 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0620  alanyl-tRNA synthetase  43.79 
 
 
876 aa  758  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4054  alanyl-tRNA synthetase  42.82 
 
 
874 aa  697  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100715  normal  0.103124 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2617  alanyl-tRNA synthetase  45.48 
 
 
879 aa  783  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00109675  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3267  alanyl-tRNA synthetase  43.5 
 
 
874 aa  716  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.235906  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00511  alanyl-tRNA synthetase  43.31 
 
 
890 aa  645  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.409533  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3635  alanyl-tRNA synthetase  44.15 
 
 
889 aa  680  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.988674  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1987  alanyl-tRNA synthetase  44.61 
 
 
885 aa  684  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.363624  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3088  alanyl-tRNA synthetase  41.76 
 
 
880 aa  654  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.150623  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0962  alanyl-tRNA synthetase  50.06 
 
 
878 aa  822  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1440  alanyl-tRNA synthetase  56.88 
 
 
874 aa  943  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000329754  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3297  alanyl-tRNA synthetase  43.95 
 
 
891 aa  655  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000320998  normal  0.10569 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0311  alanyl-tRNA synthetase  46.02 
 
 
880 aa  767  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2268  alanyl-tRNA synthetase  57.88 
 
 
878 aa  1055  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  1.49569e-05 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2026  alanyl-tRNA synthetase  51.99 
 
 
879 aa  858  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0668165  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2555  alanyl-tRNA synthetase  47.46 
 
 
878 aa  769  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0457  alanyl-tRNA synthetase  44.12 
 
 
881 aa  679  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3181  alanyl-tRNA synthetase  46.92 
 
 
879 aa  756  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0936  alanyl-tRNA synthetase  41.06 
 
 
870 aa  686  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05100  alanyl-tRNA synthetase  46.6 
 
 
878 aa  753  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.637109  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07800  alanyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 
889 aa  727  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0367295 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1452  alanyl-tRNA synthetase  42.84 
 
 
879 aa  680  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15270  alanyl-tRNA synthetase  45.12 
 
 
888 aa  702  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0205422  normal  0.854238 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2378  alanyl-tRNA synthetase  42.22 
 
 
889 aa  665  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5265  alanyl-tRNA synthetase  43.21 
 
 
890 aa  660  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1116  alanyl-tRNA synthetase  43.37 
 
 
875 aa  673  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0502279  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0357  alanyl-tRNA synthetase  43.67 
 
 
872 aa  678  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.160702  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0223  alanyl-tRNA synthetase  44.83 
 
 
894 aa  660  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0181746 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3075  alanyl-tRNA synthetase  42.46 
 
 
888 aa  657  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.314973 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2047  alanyl-tRNA synthetase  43.71 
 
 
889 aa  670  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0621427  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1975  alanyl-tRNA synthetase  42.54 
 
 
890 aa  641  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.235306  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2952  alanyl-tRNA synthetase  45.44 
 
 
883 aa  669  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1614  alanyl-tRNA synthetase  45.75 
 
 
869 aa  699  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3034  alanyl-tRNA synthetase  44.98 
 
 
888 aa  668  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.672449  normal  0.0438493 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_50  alanyl-tRNA synthetase  45.87 
 
 
876 aa  734  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000334801  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>