102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0824 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0824  hypothetical protein  100 
 
 
379 aa  757  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0690  hypothetical protein  43.54 
 
 
376 aa  323  4e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  unclonable  8.47515e-09 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1269  hypothetical protein  36.22 
 
 
387 aa  227  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2052  domain of unknown function DUF1745  36.94 
 
 
379 aa  214  2e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1909  domain of unknown function DUF1745  30.63 
 
 
408 aa  169  7e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2153  hypothetical protein  26.63 
 
 
400 aa  152  8e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2079  domain of unknown function DUF1745  27.07 
 
 
417 aa  147  2e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00286991  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2107  domain of unknown function DUF1745  26.77 
 
 
401 aa  145  8e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.206498 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2864  domain of unknown function DUF1745  26.34 
 
 
396 aa  124  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.965957  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1352  domain of unknown function DUF1745  26.28 
 
 
396 aa  119  7e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.33222e-19 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3184  hypothetical protein  27.12 
 
 
377 aa  116  5e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4131  domain of unknown function DUF1745  26.8 
 
 
396 aa  116  6e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4040  domain of unknown function DUF1745  26.41 
 
 
396 aa  116  7e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2119  hypothetical protein  25 
 
 
402 aa  115  9e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3362  hypothetical protein  27.9 
 
 
377 aa  113  6e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.103972 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1241  hypothetical protein  26.38 
 
 
381 aa  112  8e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.430619 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2954  hypothetical protein  29.08 
 
 
395 aa  111  2e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2151  hypothetical protein  25.26 
 
 
383 aa  102  9e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.509879 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0895  FIST C domain protein  26.07 
 
 
350 aa  101  2e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  4.43325e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1899  hypothetical protein  25.78 
 
 
395 aa  100  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.598311  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0012  hypothetical protein  26.12 
 
 
379 aa  96.7  6e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0572769  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1520  domain of unknown function DUF1745  26.45 
 
 
1101 aa  96.7  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.593307 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3322  domain of unknown function DUF1745  27.98 
 
 
373 aa  92.4  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0128  hypothetical protein  28.16 
 
 
379 aa  92  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.193314  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3657  domain of unknown function DUF1745  25.33 
 
 
416 aa  89  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0288  hypothetical protein  26.4 
 
 
467 aa  85.1  2e-15  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0354  hypothetical protein  25.68 
 
 
387 aa  85.1  2e-15  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3873  hypothetical protein  29.45 
 
 
380 aa  83.2  7e-15  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3884  domain of unknown function DUF1745  28.77 
 
 
1852 aa  80.1  6e-14  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4141  hypothetical protein  26.35 
 
 
365 aa  80.1  6e-14  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2665  domain of unknown function DUF1745  26.26 
 
 
427 aa  79  1e-13  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.955158 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1369  hypothetical protein  27.7 
 
 
468 aa  78.6  2e-13  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0615  hypothetical protein  26.09 
 
 
468 aa  77.8  3e-13  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.948448  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0526  hypothetical protein  25.72 
 
 
380 aa  77.4  4e-13  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0331  hypothetical protein  23.42 
 
 
387 aa  77  5e-13  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0550  hypothetical protein  25.07 
 
 
467 aa  77  5e-13  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2305  domain of unknown function DUF1745  27.38 
 
 
389 aa  75.9  1e-12  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02432  hypothetical protein  24.9 
 
 
391 aa  74.3  3e-12  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1434  domain of unknown function DUF1745  23.87 
 
 
402 aa  73.2  7e-12  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.318192  normal  0.236861 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1204  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  27.62 
 
 
931 aa  72.8  9e-12  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.271509 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2474  hypothetical protein  25.76 
 
 
447 aa  69.7  8e-11  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0911  hypothetical protein  20.62 
 
 
400 aa  69.7  8e-11  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.36206  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1203  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  26.44 
 
 
932 aa  67.8  3e-10  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00343755  normal  0.259486 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2542  hypothetical protein  25.3 
 
 
395 aa  67  5e-10  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0268  diguanylate cyclase  24.07 
 
 
933 aa  67  5e-10  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0380534  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1561  hypothetical protein  20.81 
 
 
394 aa  67  6e-10  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0408772  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4044  hypothetical protein  24.72 
 
 
401 aa  66.2  8e-10  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1202  fused sensor protein/response regulator  23.79 
 
 
934 aa  65.5  2e-09  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127641  normal  0.087847 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1892  hypothetical protein  26.13 
 
 
382 aa  64.7  2e-09  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.056146  normal  0.181862 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1435  hypothetical protein  23.34 
 
 
501 aa  63.2  7e-09  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.95663  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2724  domain of unknown function DUF1745  28.97 
 
 
374 aa  60.8  4e-08  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.43445  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1054  hypothetical protein  24.17 
 
 
405 aa  60.1  6e-08  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3141  hypothetical protein  23.56 
 
 
460 aa  59.7  9e-08  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2191  diguanylate cyclase  27.71 
 
 
806 aa  59.3  1e-07  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00068502 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0600  hypothetical protein  25.98 
 
 
392 aa  58.2  2e-07  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2313  GfdT protein  25.98 
 
 
392 aa  58.2  2e-07  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1924  hypothetical protein  25.98 
 
 
392 aa  58.2  2e-07  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1717  hypothetical protein  25.98 
 
 
392 aa  58.2  2e-07  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1661  hypothetical protein  25.98 
 
 
384 aa  58.5  2e-07  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2659  hypothetical protein  26.05 
 
 
406 aa  58.2  2e-07  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2230  hypothetical protein  25.98 
 
 
392 aa  57.8  3e-07  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0710  hypothetical protein  25.98 
 
 
384 aa  57.8  3e-07  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.251408  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1476  domain of unknown function DUF1745  24.78 
 
 
629 aa  57  5e-07  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.153758  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10891  hypothetical protein  25.67 
 
 
386 aa  57  5e-07  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.824347  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0466  domain of unknown function DUF1745  25.71 
 
 
385 aa  56.6  7e-07  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2479  hypothetical protein  23.24 
 
 
379 aa  55.8  1e-06  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.492023 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1931  hypothetical protein  28.78 
 
 
385 aa  54.3  3e-06  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.429127  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2592  hypothetical protein  28.78 
 
 
386 aa  53.5  5e-06  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.71341  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0140  FIST C domain protein  21.95 
 
 
379 aa  53.5  6e-06  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1250  hypothetical protein  28.78 
 
 
386 aa  53.5  6e-06  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.7579 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0696  transcriptional regulator, TrmB  30.91 
 
 
512 aa  53.1  9e-06  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2993  hypothetical protein  23.68 
 
 
368 aa  52.8  1e-05  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0700  hypothetical protein  24.62 
 
 
380 aa  52.4  1e-05  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.155862  normal  0.0832434 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02305  hypothetical protein  22.09 
 
 
395 aa  51.6  2e-05  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2940  hypothetical protein  26.61 
 
 
402 aa  52  2e-05  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00513133 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003465  hypothetical protein  21.79 
 
 
393 aa  52  2e-05  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4045  hypothetical protein  24.72 
 
 
378 aa  51.6  2e-05  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3344  hypothetical protein  23.23 
 
 
464 aa  51.2  3e-05  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0732  hypothetical protein  25 
 
 
386 aa  50.8  4e-05  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3246  domain of unknown function DUF1745  24.64 
 
 
396 aa  50.1  6e-05  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.116005  normal  0.61148 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1139  hypothetical protein  24.76 
 
 
392 aa  49.7  9e-05  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3551  hypothetical protein  22.7 
 
 
371 aa  49.7  9e-05  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6102  domain of unknown function DUF1745  23.37 
 
 
386 aa  49.3  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0294  hypothetical protein  22.62 
 
 
375 aa  49.3  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3668  hypothetical protein  28.33 
 
 
385 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.432885  hitchhiker  0.00253652 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2663  hypothetical protein  25.32 
 
 
387 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0292  capsular polysaccharide export inner-membrane protein KpsE  26.17 
 
 
371 aa  47.4  0.0004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2171  hypothetical protein  25.32 
 
 
387 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4193  domain of unknown function DUF1745  26.44 
 
 
386 aa  47  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351241  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2339  domain of unknown function DUF1745  22.19 
 
 
383 aa  47  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.25177 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29005  predicted protein  28.85 
 
 
313 aa  47  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.161534  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3140  hypothetical protein  23.66 
 
 
387 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1400  domain of unknown function DUF1745  22.55 
 
 
398 aa  46.2  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.653815  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3953  hypothetical protein  24.04 
 
 
389 aa  46.2  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00305  sensory transduction protein kinase  23.79 
 
 
828 aa  45.4  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1561  hypothetical protein  26.05 
 
 
404 aa  45.1  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3518  hypothetical protein  24.42 
 
 
400 aa  43.9  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.49503  normal  0.689004 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8558  hypothetical protein  24.66 
 
 
398 aa  43.9  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1816  protein of unknown function DUF1745  21.7 
 
 
389 aa  43.1  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.988519 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2353  hypothetical protein  29.67 
 
 
393 aa  43.1  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.18015  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>