More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0822 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0822  diguanylate cyclase  100 
 
 
287 aa  575  1.0000000000000001e-163  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1016  diguanylate cyclase  54.64 
 
 
283 aa  305  7e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0521  diguanylate cyclase  53 
 
 
290 aa  287  1e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164906  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2740  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.6 
 
 
774 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.023979  normal  0.735502 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  36.04 
 
 
148 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0750  CBS domain containing protein  41.96 
 
 
867 aa  75.9  0.0000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.596795  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  39.45 
 
 
845 aa  76.3  0.0000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  36.04 
 
 
147 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  39.64 
 
 
145 aa  75.9  0.0000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0610  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.63 
 
 
901 aa  75.9  0.0000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.999827  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1636  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  30.49 
 
 
465 aa  75.5  0.0000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2006  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.6 
 
 
724 aa  75.1  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.332381  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4004  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.5 
 
 
820 aa  74.3  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00611465  normal  0.165942 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0318  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.75 
 
 
612 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1136  signal transduction protein  36.36 
 
 
214 aa  73.9  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4523  diguanylate cyclase with GAF sensor  34.88 
 
 
499 aa  73.9  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.967133  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0773  diguanylate cyclase  40.7 
 
 
323 aa  73.2  0.000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000797  GGDEF family protein  34.92 
 
 
337 aa  72.4  0.000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2495  diguanylate cyclase  36.64 
 
 
422 aa  71.6  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3790  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.13 
 
 
300 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1900  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.07 
 
 
405 aa  71.6  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.56282  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0336  diguanylate cyclase  31.51 
 
 
519 aa  71.2  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0386848  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1953  diguanylate cyclase  30.51 
 
 
454 aa  71.2  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.363504  normal  0.99023 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0137  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  39.69 
 
 
763 aa  70.5  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0207  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  30.83 
 
 
772 aa  70.5  0.00000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.53871  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1177  two component signal transduction response regulator  24.39 
 
 
470 aa  70.1  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1569  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.48 
 
 
476 aa  69.7  0.00000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0264  signal protein  35.65 
 
 
614 aa  69.7  0.00000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1616  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.53 
 
 
796 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000405684 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3628  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.71 
 
 
645 aa  69.3  0.00000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.11345 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3031  hypothetical protein  41.18 
 
 
405 aa  69.3  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal  0.918064 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0336  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.97 
 
 
319 aa  68.9  0.00000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.208046  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1481  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.38 
 
 
949 aa  68.9  0.00000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3115  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  35.67 
 
 
626 aa  68.9  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.972183  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3873  diguanylate cyclase  29.76 
 
 
430 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4172  GGDEF domain-containing protein  31.14 
 
 
431 aa  68.9  0.00000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1019  diguanylate cyclase  35.16 
 
 
351 aa  68.9  0.00000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1192  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  29.85 
 
 
316 aa  68.9  0.00000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.59 
 
 
450 aa  68.9  0.00000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000908772  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1256  signal-transduction protein  32.28 
 
 
210 aa  68.6  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1482  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  42 
 
 
482 aa  68.2  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3785  sensory box/GGDEF family protein  31.55 
 
 
431 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0152  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.94 
 
 
928 aa  68.6  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.575219 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0684  polynucleotide adenylyltransferase region  39.64 
 
 
877 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7110  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.37 
 
 
780 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.494922 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0596  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.11 
 
 
474 aa  68.2  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000817529  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  35.2 
 
 
155 aa  68.6  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7031  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.34 
 
 
1327 aa  68.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.153977  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0218  diguanylate cyclase  34.11 
 
 
304 aa  68.6  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1436  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  42 
 
 
482 aa  68.2  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0782  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.59 
 
 
450 aa  68.9  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000969424  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5901  diguanylate cyclase  30.34 
 
 
386 aa  68.2  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1175  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.95 
 
 
489 aa  68.6  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.654831  normal  0.725895 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0129  metal dependent phosphohydrolase  36.72 
 
 
505 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1779  diguanylate cyclase  30.93 
 
 
215 aa  67.8  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000143574  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0797  CBS domain protein  39.09 
 
 
139 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.65672e-35 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2018  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.78 
 
 
355 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.414914  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3190  diguanylate cyclase  31.56 
 
 
852 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.43423  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  41.96 
 
 
769 aa  67.4  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3956  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.89 
 
 
357 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.892783  normal  0.485051 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1693  diguanylate cyclase  37.04 
 
 
527 aa  68.2  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3470  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.73 
 
 
353 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.843913  normal  0.949354 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4311  diguanylate cyclase  36.73 
 
 
354 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.750548  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1918  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.52 
 
 
769 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4025  diguanylate cyclase  34.58 
 
 
516 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000068225 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0060  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.76 
 
 
815 aa  67.8  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1510  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  35.38 
 
 
581 aa  67.8  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.865852  normal  0.193576 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1805  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  44.44 
 
 
485 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0147128  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0797  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.83 
 
 
374 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2801  diguanylate cyclase  32.11 
 
 
628 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.615763  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3449  diguanylate cyclase  38.89 
 
 
357 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.103484 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4055  diguanylate cyclase  36.73 
 
 
354 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.33875  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0261  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.3 
 
 
463 aa  67.8  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.3078  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5305  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.63 
 
 
814 aa  67  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4111  sensory box/GGDEF family protein, putative  30.95 
 
 
430 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0687  CBS domain-containing protein  39.09 
 
 
139 aa  67  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.740174  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3954  sensory box/GGDEF family protein  30.95 
 
 
431 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0631  CBS domain-containing protein  39.09 
 
 
139 aa  67  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000812315  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3800  sensory box/GGDEF family protein  30.36 
 
 
431 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0221299  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  30.56 
 
 
141 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4064  putative sensory box/GGDEF family protein  30.95 
 
 
431 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  35.56 
 
 
201 aa  67.4  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0720  CBS domain-containing protein  39.09 
 
 
139 aa  67  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000162258  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4263  sensory box/GGDEF family protein  30.95 
 
 
430 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4153  putative sensory box/GGDEF family protein  29.76 
 
 
430 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.36181  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1333  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.52 
 
 
575 aa  67.4  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.76071  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1085  putative sensory box/GGDEF family protein  30.36 
 
 
430 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0519  diguanylate cyclase  41.18 
 
 
631 aa  67  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.447681 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3890  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.82 
 
 
824 aa  67.4  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4104  diguanylate cyclase  30.81 
 
 
610 aa  67  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.147884 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4175  putative sensory box/GGDEF family protein  30.95 
 
 
430 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00125122  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2169  putative signal transduction protein with CBS domains  36.11 
 
 
261 aa  67  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2343  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  40.31 
 
 
921 aa  67  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.762005  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  42.02 
 
 
216 aa  67  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3973  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.34 
 
 
362 aa  67  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.415221  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12380  diguanylate cyclase  32.35 
 
 
499 aa  67  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00534046  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2230  diguanylate cyclase  38.4 
 
 
215 aa  66.6  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0737618  normal  0.167136 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0014  diguanylate cyclase  41.38 
 
 
387 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0018  diguanylate cyclase  41.38 
 
 
387 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000219286 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1715  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  34.57 
 
 
749 aa  67  0.0000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>