More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0745 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0745  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  100 
 
 
460 aa  909  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3198  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  34.81 
 
 
456 aa  263  7e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  7.28956e-05 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0471  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  45.24 
 
 
225 aa  143  6e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0687563 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1870  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.71 
 
 
470 aa  139  8e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  3.1179e-08  normal  0.169965 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3688  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  31.05 
 
 
280 aa  132  1e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2401  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  26.74 
 
 
456 aa  116  1e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.283788  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1622  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  32.62 
 
 
275 aa  115  2e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0401  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  26.64 
 
 
479 aa  111  2e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14600  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.05 
 
 
445 aa  105  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.27922e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0385  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  33.87 
 
 
280 aa  103  7e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0904  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  33.82 
 
 
241 aa  102  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2769  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.09 
 
 
303 aa  100  8e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0499  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.16 
 
 
287 aa  97.8  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000111074  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0511  sensor histidine kinase  27.06 
 
 
516 aa  97.4  4e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0500  sensor histidine kinase  27.06 
 
 
516 aa  97.4  5e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1579  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.14 
 
 
277 aa  97.1  7e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000246185  normal  0.151427 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1240  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  32.39 
 
 
541 aa  96.7  8e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.76458e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0538  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  26.19 
 
 
290 aa  89.4  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5600  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  35.65 
 
 
549 aa  88.6  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0363476  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2632  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  25.32 
 
 
291 aa  85.1  3e-15  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1041  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  33.58 
 
 
563 aa  83.6  6e-15  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0515  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  26.45 
 
 
526 aa  82.4  1e-14  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3869  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  33.77 
 
 
540 aa  82  2e-14  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0780654  normal  0.0130314 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1377  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  25.83 
 
 
525 aa  80.9  4e-14  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4346  sensor histidine kinase  27.78 
 
 
529 aa  80.1  7e-14  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.149156  hitchhiker  1.86115e-13 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01630  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  28.14 
 
 
325 aa  80.1  8e-14  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0869  sensor histidine kinase  28.24 
 
 
529 aa  79.3  1e-13  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0965  sensor histidine kinase  28.77 
 
 
529 aa  79.7  1e-13  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1089  sensor histidine kinase  27.93 
 
 
529 aa  79.3  1e-13  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0923  sensor histidine kinase  28.24 
 
 
529 aa  79.3  1e-13  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4645  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  27.62 
 
 
529 aa  79.7  1e-13  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0010254  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0811  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  28.24 
 
 
529 aa  79  2e-13  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1570  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  26.5 
 
 
278 aa  78.2  3e-13  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  6.77983e-15 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0597  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  36.45 
 
 
524 aa  78.2  3e-13  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00345786 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37840  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  32.03 
 
 
527 aa  78.2  3e-13  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.183307 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3300  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  34.65 
 
 
539 aa  77.8  4e-13  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.814205  hitchhiker  0.00983464 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3238  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  34.65 
 
 
539 aa  77.8  4e-13  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.698752  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3249  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  34.65 
 
 
539 aa  77.8  4e-13  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.710576  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3378  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  28.19 
 
 
545 aa  77.8  4e-13  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.960766  normal  0.505448 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0837  sensor histidine kinase  27.31 
 
 
529 aa  77.8  4e-13  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1749  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.22 
 
 
534 aa  77.4  5e-13  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000244457  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3457  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  23.11 
 
 
443 aa  77.4  5e-13  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4414  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  33.19 
 
 
558 aa  77.4  5e-13  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1004  sensor histidine kinase  27.31 
 
 
529 aa  77  6e-13  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.68776e-61 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2021  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.78 
 
 
534 aa  75.9  1e-12  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.769355  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1009  sensor histidine kinase  26.39 
 
 
529 aa  73.9  5e-12  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3624  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  31.37 
 
 
534 aa  73.9  6e-12  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0863  putative sensor histidine kinase  23.38 
 
 
420 aa  73.9  6e-12  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.147928  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3731  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.33 
 
 
532 aa  73.9  6e-12  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.95506  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0490  sensory histidine kinase DcuS  27.65 
 
 
534 aa  73.2  9e-12  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2224  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  31.17 
 
 
541 aa  72.4  2e-11  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.691075  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3117  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  27.69 
 
 
342 aa  72.4  2e-11  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.853672  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0614  sensory histidine kinase DcuS  27.27 
 
 
534 aa  72  2e-11  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2304  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  34.36 
 
 
402 aa  72.4  2e-11  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0452576 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0632  sensory histidine kinase DcuS  27.27 
 
 
534 aa  71.2  3e-11  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0639  sensory histidine kinase DcuS  27.65 
 
 
534 aa  71.6  3e-11  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0576  sensory histidine kinase DcuS  27.27 
 
 
534 aa  71.6  3e-11  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.391584  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2269  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  25.95 
 
 
442 aa  71.6  3e-11  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8198  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  32.91 
 
 
538 aa  71.6  3e-11  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0545  sensory histidine kinase DcuS  27.27 
 
 
534 aa  71.6  3e-11  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.847766  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0489  sensory histidine kinase DcuS  27.27 
 
 
534 aa  71.6  3e-11  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4399  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  31.38 
 
 
525 aa  71.2  4e-11  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.262296  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0487  sensory histidine kinase DcuS  27.27 
 
 
534 aa  71.2  4e-11  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3596  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  33.33 
 
 
519 aa  71.2  4e-11  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4725  sensory histidine kinase DcuS  26.82 
 
 
534 aa  70.9  5e-11  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.678206  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2325  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.82 
 
 
531 aa  70.5  6e-11  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.18048  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0499  sensor histidine kinase  25.79 
 
 
431 aa  70.5  6e-11  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  2.46195e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2898  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30 
 
 
553 aa  70.1  7e-11  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4243  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  32.04 
 
 
525 aa  70.1  8e-11  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0209492  normal  0.158943 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1210  putative sensor kinase citA  28.44 
 
 
538 aa  70.1  8e-11  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000551679  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4177  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  32.04 
 
 
525 aa  70.1  8e-11  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0530735  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1396  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  33.05 
 
 
556 aa  69.7  9e-11  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0792453  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25730  PAS domain S-box  31.56 
 
 
520 aa  69.7  1e-10  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0559  sensor histidine kinase  29.22 
 
 
536 aa  69.3  1e-10  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0527  sensor histidine kinase  29.22 
 
 
536 aa  69.3  1e-10  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2789  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  28.57 
 
 
536 aa  68.9  2e-10  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8065  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  34.87 
 
 
583 aa  68.2  3e-10  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4697  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  31.28 
 
 
527 aa  67.8  4e-10  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.269439  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2555  sensory histidine kinase DcuS  28.72 
 
 
538 aa  67.4  6e-10  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.129089 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0680  sensor kinase DpiB  27.14 
 
 
553 aa  67  6e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.520362  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0032  histidine kinase-related ATPase, putative  26.5 
 
 
248 aa  66.6  9e-10  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  7.37644e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0666  sensor kinase DpiB  27.14 
 
 
553 aa  66.2  1e-09  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.863518  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0487  sensor histidine kinase  25.79 
 
 
431 aa  66.2  1e-09  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0885624  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0470  sensor histidine kinase  28.31 
 
 
536 aa  65.9  1e-09  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.398861  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0834  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  31.92 
 
 
540 aa  66.2  1e-09  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0952704  normal  0.0982471 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0740  sensor kinase DpiB  27.14 
 
 
553 aa  66.2  1e-09  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0784  sensor kinase DpiB  27.14 
 
 
553 aa  66.2  1e-09  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.636686  normal  0.450792 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1492  accessory gene regulator protein C  22.4 
 
 
429 aa  65.5  2e-09  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.108947  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5077  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  32.38 
 
 
558 aa  65.5  2e-09  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.669392 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4744  sensor protein CitS  27.52 
 
 
533 aa  64.7  3e-09  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0688  sensor histidine kinase  27.52 
 
 
534 aa  64.7  3e-09  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0638  sensor histidine kinase DpiB  26.32 
 
 
552 aa  64.7  3e-09  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.736103  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3503  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  31.19 
 
 
546 aa  65.1  3e-09  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.243231 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3006  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  26.32 
 
 
552 aa  64.3  4e-09  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0620  sensor histidine kinase  27.52 
 
 
536 aa  64.7  4e-09  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2797  sensor histidine kinase  30.77 
 
 
385 aa  64.3  4e-09  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.64259e-05 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3910  sensory histidine kinase DcuS  28.12 
 
 
537 aa  63.9  5e-09  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0670  sensor histidine kinase DpiB  26.32 
 
 
552 aa  64.3  5e-09  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0246714  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00589  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with citB  25.12 
 
 
552 aa  64.3  5e-09  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3003  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  31.96 
 
 
503 aa  63.9  5e-09  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0343689 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>