64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0667 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0667  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 341 aa  694    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0691  spore photoproduct lyase  60.41 
 
 		 352 aa  413  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0238  Radical SAM domain protein  55.72 
 
 		 340 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2341  Radical SAM domain protein  54.07 
 
 		 357 aa  376  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0393103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0624  Radical SAM domain protein  53.08 
 
 		 339 aa  372  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00552775  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1928  spore photoproduct lyase, splB  53.41 
 
 		 340 aa  345  6e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0376642 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0720  spore photoproduct lyase  46.36 
 
 		 340 aa  333  4e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0712219  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22270  spore photoproduct lyase  48.26 
 
 		 340 aa  332  5e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2489  spore photoproduct lyase  48.39 
 
 		 342 aa  328  9e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3948  spore photoproduct lyase  47.38 
 
 		 341 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4225  spore photoproduct lyase  47.38 
 
 		 341 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0919  spore photoproduct lyase  47.09 
 
 		 341 aa  325  7e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4109  spore photoproduct lyase  47.09 
 
 		 341 aa  324  1e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4429  spore photoproduct lyase  47.09 
 
 		 341 aa  324  1e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3959  spore photoproduct lyase  47.09 
 
 		 341 aa  325  1e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.901366  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4278  spore photoproduct lyase  46.8 
 
 		 341 aa  322  4e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4315  spore photoproduct lyase  46.51 
 
 		 341 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4334  spore photoproduct lyase  46.8 
 
 		 341 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4058  spore photoproduct lyase  46.8 
 
 		 341 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0226  spore photoproduct lyase  46.65 
 
 		 341 aa  316  3e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2944  radical SAM domain-containing protein  36.93 
 
 		 371 aa  210  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164371 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2839  radical SAM domain protein  37.89 
 
 		 370 aa  206  4e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.95751  normal  0.218512 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1066  radical SAM domain-containing protein  34.15 
 
 		 387 aa  200  3e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.504445 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2717  radical SAM domain-containing protein  35.9 
 
 		 371 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.37756  normal  0.372526 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3293  spore photoproduct lyase  34.3 
 
 		 363 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5726  radical SAM domain-containing protein  36.08 
 
 		 359 aa  189  8e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.297493  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4460  Radical SAM domain protein  34.38 
 
 		 360 aa  180  2.9999999999999997e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.26561  decreased coverage  0.00586208 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4985  Radical SAM domain protein  31.92 
 
 		 373 aa  171  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.831424  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0830  radical SAM domain-containing protein  37.22 
 
 		 376 aa  166  5e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0103728 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1777  hypothetical protein  33.92 
 
 		 331 aa  165  8e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3628  hypothetical protein  32.18 
 
 		 334 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00018062  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1838  hypothetical protein  30.03 
 
 		 331 aa  137  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000126536  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1110  Radical SAM domain protein  27.57 
 
 		 359 aa  80.5  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1857  Radical SAM domain protein  24.44 
 
 		 354 aa  78.6  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000532474 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3333  Radical SAM domain protein  27.13 
 
 		 354 aa  76.3  0.0000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0827  radical SAM domain protein  25.53 
 
 		 359 aa  76.3  0.0000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3136  radical SAM domain-containing protein  26.83 
 
 		 354 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.2977  normal  0.0826196 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3457  radical SAM domain-containing protein  26.83 
 
 		 354 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1929  DNA repair photolyase-like protein  23.87 
 
 		 335 aa  68.6  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0715996  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2339  radical SAM domain-containing protein  22.71 
 
 		 350 aa  68.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.934755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2665  radical SAM family protein  25.58 
 
 		 370 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134857  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2710  radical SAM domain-containing protein  25.58 
 
 		 370 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0234574 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1416  radical SAM domain-containing protein  22.14 
 
 		 338 aa  66.6  0.0000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.285665  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2695  radical SAM domain-containing protein  25.58 
 
 		 370 aa  65.9  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.955919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1936  DNA repair photolyase-like protein  23.66 
 
 		 371 aa  64.7  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.290758  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1261  DNA repair photolyase-like  23.76 
 
 		 389 aa  65.1  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.288369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1282  DNA repair photolyase-like protein  26.8 
 
 		 426 aa  63.5  0.000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5436  radical SAM domain-containing protein  26.72 
 
 		 355 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.786254 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0354  radical SAM domain-containing protein  26.7 
 
 		 358 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360809  normal  0.699782 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1656  radical SAM domain protein  25.64 
 
 		 353 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0709  radical SAM domain protein  25.57 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000173731  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2595  DNA repair photolyase-like protein  22.67 
 
 		 336 aa  57.8  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0693761  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1237  hypothetical protein  27.62 
 
 		 291 aa  57  0.0000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.231628 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1935  Radical SAM domain protein  28.67 
 
 		 375 aa  55.8  0.0000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.779003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2907  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 368 aa  52.8  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0074  hypothetical protein  23.87 
 
 		 386 aa  52  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0268  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 301 aa  48.5  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.698085  normal  0.0396119 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2336  DNA repair photolyase-like protein  20.99 
 
 		 332 aa  48.5  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000245241  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0463  DNA repair photolyase  22.03 
 
 		 335 aa  47.4  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0639  DNA repair photolyase-like protein  23.83 
 
 		 337 aa  47.4  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.177826  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0196  radical SAM domain-containing protein  27.81 
 
 		 297 aa  47.4  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1281  radical SAM domain-containing protein  29.27 
 
 		 294 aa  43.9  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.558444  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2509  hypothetical protein  29.17 
 
 		 366 aa  43.9  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.690045 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3317  radical SAM domain-containing protein  27.98 
 
 		 355 aa  43.9  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.355052 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>