More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0624 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 
215 aa  428  1e-119  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  57.47 
 
 
221 aa  253  2e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  2.64198e-06 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  60.75 
 
 
216 aa  252  4e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2092  riboflavin synthase subunit alpha  61.5 
 
 
187 aa  238  4e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0540242  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  52.75 
 
 
218 aa  238  5e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  56.28 
 
 
214 aa  233  2e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  48.39 
 
 
218 aa  228  5e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1221  riboflavin synthase subunit alpha  50 
 
 
226 aa  226  2e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.464139  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  47.06 
 
 
217 aa  218  4e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0386  riboflavin synthase subunit alpha  52.34 
 
 
214 aa  214  8e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0916  riboflavin synthase subunit alpha  54.17 
 
 
217 aa  213  1e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00048096  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  50 
 
 
215 aa  211  5e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3107  riboflavin synthase, alpha subunit  57.29 
 
 
223 aa  211  8e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.409641 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  49.07 
 
 
216 aa  211  9e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  47.53 
 
 
223 aa  209  3e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  49.53 
 
 
215 aa  209  4e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2779  riboflavin synthase, alpha subunit  45.79 
 
 
211 aa  206  2e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4221  riboflavin synthase subunit alpha  44.95 
 
 
214 aa  206  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1379  riboflavin synthase subunit alpha  52.73 
 
 
220 aa  206  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  58.25 
 
 
199 aa  206  3e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  43.78 
 
 
217 aa  206  3e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  43.78 
 
 
217 aa  205  5e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0123  riboflavin synthase, alpha subunit  48.77 
 
 
239 aa  205  5e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  50.23 
 
 
219 aa  204  6e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  53.77 
 
 
200 aa  204  7e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2809  riboflavin synthase subunit alpha  44.19 
 
 
214 aa  203  1e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  52.51 
 
 
227 aa  204  1e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0937  riboflavin synthase, alpha subunit  50 
 
 
217 aa  204  1e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2448  riboflavin synthase subunit alpha  56.04 
 
 
217 aa  202  2e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0747  riboflavin synthase subunit alpha  47.69 
 
 
216 aa  202  3e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1868  riboflavin synthase subunit alpha  55.05 
 
 
220 aa  202  3e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0021  riboflavin synthase, alpha subunit  46.51 
 
 
207 aa  202  4e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1016  riboflavin synthase subunit alpha  44.5 
 
 
214 aa  202  4e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11441  riboflavin synthase subunit alpha  57.87 
 
 
201 aa  201  5e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.370285 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2078  riboflavin synthase, alpha subunit  47.95 
 
 
216 aa  201  7e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00424988  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  48.62 
 
 
220 aa  201  1e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  1.27826e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  52.05 
 
 
217 aa  200  1e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2833  Riboflavin synthase  55.67 
 
 
202 aa  201  1e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351084  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  53.96 
 
 
202 aa  199  3e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  46.76 
 
 
216 aa  199  3e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  46.76 
 
 
217 aa  198  5e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1875  riboflavin synthase subunit alpha  54.36 
 
 
221 aa  197  8e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0923  riboflavin synthase subunit alpha  45.62 
 
 
218 aa  194  7e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  49.77 
 
 
220 aa  193  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01167  riboflavin synthase subunit alpha  44.91 
 
 
217 aa  193  2e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3721  riboflavin synthase subunit alpha  56.35 
 
 
203 aa  192  3e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  53.5 
 
 
205 aa  192  3e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  42.01 
 
 
220 aa  192  3e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1145  riboflavin synthase subunit alpha  46.76 
 
 
217 aa  191  6e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000276723  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2562  riboflavin synthase, alpha subunit  48.31 
 
 
207 aa  190  1e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.503864  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  48.61 
 
 
216 aa  189  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3942  riboflavin synthase subunit alpha  45.41 
 
 
214 aa  189  3e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  48.62 
 
 
219 aa  189  3e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  46.58 
 
 
221 aa  188  4e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  46.58 
 
 
221 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  46.58 
 
 
221 aa  188  4e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1017  riboflavin synthase subunit alpha  49.07 
 
 
217 aa  189  4e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.743536  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  46.58 
 
 
221 aa  188  4e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18150  riboflavin synthase, alpha subunit  56.72 
 
 
200 aa  188  6e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2597  riboflavin synthase subunit alpha  50.51 
 
 
193 aa  187  8e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.195355  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_002936  DET1189  riboflavin synthase subunit alpha  45.33 
 
 
205 aa  187  9e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1188  riboflavin synthase subunit alpha  46.82 
 
 
221 aa  187  1e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0484679  normal  0.881373 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  46.15 
 
 
221 aa  186  2e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5219  riboflavin synthase, alpha subunit  54.17 
 
 
212 aa  186  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0952881  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1860  riboflavin synthase subunit alpha  45.37 
 
 
217 aa  186  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1383  riboflavin synthase subunit alpha  46.12 
 
 
220 aa  186  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00417649  hitchhiker  3.86622e-07 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2693  riboflavin synthase subunit alpha  53.23 
 
 
205 aa  186  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00070  riboflavin synthase, alpha subunit  53.12 
 
 
204 aa  186  2e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1624  riboflavin synthase subunit alpha  45.05 
 
 
219 aa  186  3e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.137296  normal  0.0697591 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4244  riboflavin synthase subunit alpha  45.41 
 
 
214 aa  186  3e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4180  riboflavin synthase subunit alpha  45.41 
 
 
214 aa  186  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2979  riboflavin synthase, alpha subunit  53.03 
 
 
209 aa  185  4e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.209687  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4332  riboflavin synthase subunit alpha  44.95 
 
 
214 aa  185  4e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3866  riboflavin synthase subunit alpha  44.95 
 
 
214 aa  185  4e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4019  riboflavin synthase subunit alpha  44.95 
 
 
214 aa  185  4e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2766  riboflavin synthase, alpha subunit  50.5 
 
 
201 aa  185  4e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.210112  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4134  riboflavin synthase subunit alpha  44.95 
 
 
214 aa  185  4e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3852  riboflavin synthase subunit alpha  44.95 
 
 
214 aa  185  4e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15720  riboflavin synthase, alpha subunit  51.04 
 
 
208 aa  185  5e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3187  riboflavin synthase subunit alpha  48.1 
 
 
238 aa  185  5e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00151033  normal  0.190561 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1723  riboflavin synthase subunit alpha  48.4 
 
 
227 aa  185  5e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516188  hitchhiker  0.00196087 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2435  riboflavin synthase subunit alpha  46.43 
 
 
224 aa  185  5e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00995075  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0061  riboflavin synthase subunit alpha  47.25 
 
 
218 aa  185  5e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.201459  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1421  riboflavin synthase subunit alpha  45.91 
 
 
220 aa  185  6e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00972231  normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01560  riboflavin synthase, alpha subunit  49.51 
 
 
204 aa  184  8e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.913253 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3112  riboflavin synthase, alpha subunit  53.62 
 
 
208 aa  184  9e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2389  riboflavin synthase subunit alpha  52.71 
 
 
203 aa  184  9e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.160272  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2436  riboflavin synthase subunit alpha  52.71 
 
 
203 aa  184  9e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.399629 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0731  riboflavin synthase subunit alpha  41.13 
 
 
232 aa  183  1e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2430  riboflavin synthase subunit alpha  52.22 
 
 
203 aa  183  2e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  46.79 
 
 
220 aa  183  2e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2354  riboflavin synthase, alpha subunit  51.76 
 
 
215 aa  183  2e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0725923  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  43.64 
 
 
221 aa  182  2e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3707  riboflavin synthase, alpha subunit  48.22 
 
 
196 aa  182  2e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0376  riboflavin synthase subunit alpha  48.85 
 
 
221 aa  182  2e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0815037 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1036  riboflavin synthase subunit alpha  45.66 
 
 
219 aa  182  3e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00015592  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1000  riboflavin synthase subunit alpha  45.33 
 
 
205 aa  182  3e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.665002  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1859  riboflavin synthase, alpha subunit  53.81 
 
 
204 aa  182  3e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.261551  normal  0.387572 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1304  riboflavin synthase, alpha subunit  46.91 
 
 
216 aa  182  4e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.851086  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2189  riboflavin synthase subunit alpha  53.37 
 
 
201 aa  181  5e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  5.72802e-06 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>