113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0589 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0589  glutamine amidotransferase  100 
 
 
241 aa  482  1e-135  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.188888  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1154  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  67.23 
 
 
243 aa  326  2.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2008  glutamine amidotransferase  62.45 
 
 
241 aa  318  3.9999999999999996e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0374573  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0444  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  62.66 
 
 
243 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1346  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  57.14 
 
 
254 aa  273  1.0000000000000001e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000213034  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0007  glutamine amidotransferase  51.68 
 
 
243 aa  268  7e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3477  glutamine amidotransferase  53.94 
 
 
250 aa  243  9.999999999999999e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.856737  normal  0.267363 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2612  glutamine amidotransferase  48.55 
 
 
245 aa  237  1e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000419892  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0439  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  49.37 
 
 
248 aa  236  2e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1484  glutamine amidotransferase  54.2 
 
 
270 aa  236  3e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2070  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  50.21 
 
 
248 aa  235  5.0000000000000005e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0157617  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3349  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  52.54 
 
 
248 aa  233  1.0000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000323164 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0995  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  54.7 
 
 
246 aa  230  1e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00101565  normal  0.046971 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1393  CobB/CobQ family glutamine amidotransferase  47.88 
 
 
243 aa  223  2e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000283202  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1207  CobB/CobQ family glutamine amidotransferase  47.88 
 
 
243 aa  223  2e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000807553  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1784  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  48.71 
 
 
237 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000240979  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0012  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  46.61 
 
 
251 aa  212  4.9999999999999996e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3015  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  52.48 
 
 
249 aa  211  5.999999999999999e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2123  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  46.85 
 
 
264 aa  211  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2170  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  46.85 
 
 
264 aa  211  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.586275  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0967  glutamine amidotransferase  46.81 
 
 
243 aa  211  9e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1026  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  49.37 
 
 
255 aa  210  2e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3272  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  51.54 
 
 
242 aa  208  6e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3001  domain of unknown function DUF1727  46.03 
 
 
744 aa  200  1.9999999999999998e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.954679 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1626  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  49.78 
 
 
238 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1558  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  45.1 
 
 
262 aa  197  7.999999999999999e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.115303 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1429  cobyric acid synthase, putative  44.12 
 
 
241 aa  192  5e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4286  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  43.19 
 
 
272 aa  188  8e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4133  CobB/CobQ domain-containing protein glutamine amidotransferase  43.19 
 
 
270 aa  186  3e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.601486  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1945  glutamine amidotransferase  44.64 
 
 
243 aa  186  4e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1979  glutamine amidotransferase  44.64 
 
 
243 aa  186  4e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0846367  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0984  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  42.72 
 
 
218 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000559589  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0449  glutamine amidotransferase  41.43 
 
 
235 aa  166  2e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2037  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  44.5 
 
 
254 aa  166  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000233635 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1234  cobyric acid synthase  40.25 
 
 
262 aa  162  5.0000000000000005e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2307  glutamine amidotransferase  43.54 
 
 
240 aa  158  6e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0042539  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1600  glutamine amidotransferase  37.9 
 
 
244 aa  152  5.9999999999999996e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1789  glutamine amidotransferase  36.24 
 
 
243 aa  151  1e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.959878  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0883  cobyric acid synthase, putative  40.28 
 
 
261 aa  149  3e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2713  hypothetical protein  40.69 
 
 
236 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1783  glutamine amidotransferase  38.5 
 
 
227 aa  146  4.0000000000000006e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000285682 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0469  CobB/CobQ domain-containing protein glutamine amidotransferase  39.83 
 
 
235 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1033  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  38.81 
 
 
235 aa  143  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4902  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  41.18 
 
 
238 aa  142  5e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.405596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4991  glutamine amidotransferase  41.18 
 
 
238 aa  142  5e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5270  glutamine amidotransferase  40.89 
 
 
238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0914  glutamine amidotransferase-like protein  38.98 
 
 
238 aa  139  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.154978  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0649  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  40.77 
 
 
237 aa  138  7.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5521  glutamine amidotransferase  40.2 
 
 
238 aa  138  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.69589  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0441  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  38.26 
 
 
240 aa  137  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.824669  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1207  cobyric acid synthase  38.93 
 
 
262 aa  137  2e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.295396  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1290  glutamine amidotransferase  38.89 
 
 
238 aa  135  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1230  putative glutamine amidotransferase  40.79 
 
 
250 aa  136  4e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.102244  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13745  cobyric acid synthase cobQ2  40.38 
 
 
231 aa  135  5e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000597942  normal  0.560943 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0077  CobB/CobQ-like protein  40 
 
 
264 aa  132  6.999999999999999e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000405616 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4003  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  36.32 
 
 
245 aa  127  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.587157  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4347  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  37.23 
 
 
236 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0371298  normal  0.659111 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2660  CobB/CobQ domain-containing protein glutamine amidotransferase  39.61 
 
 
239 aa  122  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3449  glutamine amidotransferase  38.84 
 
 
240 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3223  glutamine amidotransferase  37.95 
 
 
240 aa  117  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0176125 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6530  glutamine amidotransferase  36.05 
 
 
250 aa  117  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.18713 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1705  glutamine amidotransferase  36.49 
 
 
272 aa  112  6e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.192765  hitchhiker  0.00572744 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0283  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  38.21 
 
 
247 aa  107  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1441  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  35.41 
 
 
235 aa  77.4  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.45382  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0375  cobyric acid synthase  30.77 
 
 
492 aa  60.1  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0399109  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1457  cobyric acid synthase  30.99 
 
 
492 aa  59.3  0.00000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1326  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  26.78 
 
 
248 aa  56.6  0.0000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000536393  hitchhiker  0.000591695 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4467  cobyric acid synthase  25.67 
 
 
485 aa  51.2  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.540538  normal  0.0758348 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1901  cobyric acid synthase  33.54 
 
 
480 aa  50.1  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.461706 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0858  cobyric acid synthase CobQ  29.93 
 
 
465 aa  49.7  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.924146  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2705  cobyric acid synthase CobQ  30.6 
 
 
512 aa  49.3  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.554279  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1045  cobyric acid synthase  30.46 
 
 
535 aa  48.9  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1200  cobyric acid synthase  30.46 
 
 
585 aa  48.9  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4723  cobyric acid synthase CobQ  30.54 
 
 
500 aa  48.5  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.376659  normal  0.401883 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000116  cobyric acid synthase  31.86 
 
 
485 aa  48.9  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0697  cobyric acid synthase  29.89 
 
 
512 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342942  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2316  cobyric acid synthase  29.89 
 
 
531 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.0037254  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2971  cobyric acid synthase  29.89 
 
 
523 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.106945  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1628  cobyric acid synthase  29.89 
 
 
529 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115512  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3692  cobyric acid synthase CobQ  32.61 
 
 
484 aa  47.8  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556866  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5262  cobyric acid synthase CobQ  30.37 
 
 
488 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.841841 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1039  cobyric acid synthase  29.89 
 
 
545 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.999214  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0181  cobyric acid synthase CobQ  32.5 
 
 
494 aa  47.8  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0190399  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1872  cobyric acid synthase  33.58 
 
 
483 aa  46.6  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0240  cobyric acid synthase  26.39 
 
 
485 aa  46.2  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0530  cobyric acid synthase  29.46 
 
 
491 aa  45.4  0.0008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.479348  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2157  cobyric acid synthase  30.91 
 
 
485 aa  45.4  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.711251  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05724  cobyric acid synthase  28.98 
 
 
475 aa  45.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2195  cobyric acid synthase  30.99 
 
 
513 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1693  cobyric acid synthase CobQ  30.89 
 
 
507 aa  45.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0137801  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1559  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.74 
 
 
454 aa  44.7  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2992  cobyric acid synthase  32.77 
 
 
532 aa  44.3  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0144  cobyric acid synthase  30.77 
 
 
487 aa  44.3  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0666  cobyric acid synthase  30 
 
 
484 aa  43.9  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1252  cobyric acid synthase  29.77 
 
 
493 aa  44.3  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2241  cobyric acid synthase  30.99 
 
 
506 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.386357  normal  0.07507 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2188  cobyric acid synthase  28.57 
 
 
506 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2141  cobyric acid synthase  30.99 
 
 
506 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2354  cobyric acid synthase  30.99 
 
 
506 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.066722 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2504  cobyric acid synthase  29.81 
 
 
520 aa  43.9  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.177282  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>