84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0505 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0505  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  100 
 
 		 663 aa  1365    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0949649  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3140  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  37.85 
 
 		 681 aa  439  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.239895  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3711  SMC domain protein  29.33 
 
 		 653 aa  264  3e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4848  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.93 
 
 		 626 aa  213  9e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4641  ATP-dependent endonuclease  27.19 
 
 		 626 aa  208  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.01769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4711  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  27.54 
 
 		 648 aa  184  6e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1846  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.16 
 
 		 589 aa  114  5e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147928 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1497  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.01 
 
 		 573 aa  99.8  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  28.74 
 
 		 564 aa  95.1  4e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1111  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.59 
 
 		 603 aa  84.3  0.000000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0949  hypothetical protein  20 
 
 		 603 aa  73.9  0.000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0257  hypothetical protein  30.34 
 
 		 159 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00160125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2727  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.42 
 
 		 607 aa  71.2  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  20.86 
 
 		 666 aa  71.2  0.00000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2624  hypothetical protein  23.73 
 
 		 505 aa  71.2  0.00000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1302  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.13 
 
 		 634 aa  69.3  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0225  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.57 
 
 		 578 aa  68.9  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000140656 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1883  SMC protein-like protein  21.25 
 
 		 688 aa  68.2  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4449  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  25.21 
 
 		 564 aa  67.8  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1866  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.03 
 
 		 595 aa  67  0.0000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3102  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.2 
 
 		 582 aa  65.9  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3567  OLD family ATP-dependent endonuclease-like protein  25.21 
 
 		 604 aa  63.9  0.000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274046 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  40.22 
 
 		 650 aa  62.4  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06203  hypothetical protein  28.93 
 
 		 669 aa  63.2  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0886  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  24.45 
 
 		 579 aa  62.4  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0477165  normal  0.341394 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0870  ATP-dependent OLD family endonuclease  21.19 
 
 		 591 aa  62.4  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1087  ATP-dependent OLD family endonuclease  20.95 
 
 		 616 aa  60.1  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3087  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.28 
 
 		 605 aa  60.1  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3193  plasmid-related protein  22.86 
 
 		 674 aa  60.1  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0945381 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3445  hypothetical protein  21.29 
 
 		 628 aa  59.7  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.919866  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3363  hypothetical protein  27.36 
 
 		 607 aa  59.3  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.194578  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2782  hypothetical protein  25.66 
 
 		 440 aa  58.2  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1596  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.69 
 
 		 652 aa  57.8  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0001  hypothetical protein  25 
 
 		 707 aa  56.2  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.426286  unclonable  0.0000000168459 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1844  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.84 
 
 		 640 aa  55.5  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0640  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  23.72 
 
 		 601 aa  55.8  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2666  hypothetical protein  28.43 
 
 		 553 aa  55.8  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0206  ATP-dependent OLD family endonuclease  30.99 
 
 		 689 aa  55.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02258  hypothetical protein  47.83 
 
 		 626 aa  53.1  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2848  ATP-dependent OLD family endonuclease  31.51 
 
 		 674 aa  52  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351188  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3543  SMC protein-like  25.91 
 
 		 695 aa  51.2  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4153  SMC domain-containing protein  26.86 
 
 		 574 aa  51.6  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0910063 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3650  hypothetical protein  32.97 
 
 		 426 aa  51.6  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.574815  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3955  AAA ATPase  25.53 
 
 		 642 aa  51.2  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262295  hitchhiker  0.00100841 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1915  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  28.97 
 
 		 529 aa  50.8  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3277  hypothetical protein  21.89 
 
 		 728 aa  50.8  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0296184  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0885  hypothetical protein  25.13 
 
 		 670 aa  50.8  0.00009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0242137  hitchhiker  0.00462841 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3408  hypothetical protein  28.37 
 
 		 594 aa  50.4  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.043782  normal  0.188523 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4907  hypothetical protein  29.76 
 
 		 769 aa  50.4  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.50635  normal  0.10457 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  27.23 
 
 		 584 aa  50.4  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0630  hypothetical protein  26.88 
 
 		 513 aa  50.1  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  21.53 
 
 		 623 aa  49.7  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3655  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.24 
 
 		 793 aa  49.7  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523201  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0155  AAA ATPase  39.66 
 
 		 544 aa  48.9  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.754147  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5488  putative nucleoside triphosphate hydrolase domain-containing protein  22.84 
 
 		 598 aa  48.5  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003289  pathogenesis related protein  25.44 
 
 		 714 aa  48.1  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.31747  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1604  hypothetical protein  21.99 
 
 		 685 aa  47.8  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1691  SMC domain protein  45.65 
 
 		 385 aa  47.4  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  hitchhiker  0.000000699352 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6253  ATPase, RecF-like protein  45.83 
 
 		 393 aa  47.4  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.131288 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1472  ATPase-like protein  36.71 
 
 		 426 aa  47.4  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0862565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5526  hypothetical protein  40 
 
 		 384 aa  47  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.768664  normal  0.0253524 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4312  hypothetical protein  47.83 
 
 		 388 aa  47  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4219  ATP-dependent endonuclease, OLD family  26.67 
 
 		 780 aa  47  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1796  hypothetical protein  30.67 
 
 		 676 aa  46.2  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2459  hypothetical protein  20.8 
 
 		 606 aa  46.2  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.707067  normal  0.551867 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1811  hypothetical protein  45.65 
 
 		 390 aa  45.4  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.93186  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0681  overcoming lysogenization defect protein  24.41 
 
 		 696 aa  45.8  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1858  hypothetical protein  45.65 
 
 		 390 aa  45.4  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.111795 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2035  hypothetical protein  45.65 
 
 		 388 aa  45.8  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.224754  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2281  ATPase  45.65 
 
 		 390 aa  45.4  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1792  hypothetical protein  45.65 
 
 		 390 aa  45.4  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0744  ATP-dependent OLD family endonuclease  39.29 
 
 		 642 aa  45.4  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1171  ATPase, RecF-like protein  43.18 
 
 		 390 aa  45.4  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2994  ATP-dependent OLD family endonuclease  30.93 
 
 		 608 aa  45.1  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0449  hypothetical protein  34.44 
 
 		 554 aa  45.1  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.380291  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2169  ABC transporter related  32.76 
 
 		 235 aa  44.7  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3548  hypothetical protein  38.18 
 
 		 368 aa  45.1  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3452  hypothetical protein  37.1 
 
 		 519 aa  44.7  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2954  putative exonuclease  22.88 
 
 		 659 aa  44.3  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3272  OLD family-like ATP-dependent endonuclease  25 
 
 		 758 aa  44.3  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0013  RecF/RecN/SMC domain protein  36.96 
 
 		 362 aa  44.3  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0144  ATPase  38.64 
 
 		 565 aa  43.9  0.009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0046  GTP-binding protein LepA  33.33 
 
 		 276 aa  43.9  0.009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0304076  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  33.85 
 
 		 369 aa  43.9  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.408353 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>