218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0477 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0477  hypothetical protein  100 
 
 
473 aa  964    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1757  protein of unknown function UPF0027  68.71 
 
 
473 aa  677    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0019  hypothetical protein  50.43 
 
 
480 aa  421  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000140083  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0127  protein of unknown function UPF0027  48.6 
 
 
486 aa  409  1e-113  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0966  protein of unknown function UPF0027  48.33 
 
 
484 aa  403  1e-111  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0155  protein of unknown function UPF0027  48.17 
 
 
462 aa  401  9.999999999999999e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00324351  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2571  hypothetical protein  46.76 
 
 
477 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.444433  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0269  hypothetical protein  47.75 
 
 
482 aa  397  1e-109  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0186  hypothetical protein  46.64 
 
 
480 aa  395  1e-109  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.490529  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1281  hypothetical protein  46.85 
 
 
480 aa  398  1e-109  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.141518  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1252  hypothetical protein  47.19 
 
 
500 aa  394  1e-108  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1472  hypothetical protein  45.74 
 
 
474 aa  393  1e-108  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0141  hypothetical protein  48.16 
 
 
484 aa  392  1e-108  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0637  hypothetical protein  46.2 
 
 
480 aa  393  1e-108  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0603804  normal  0.09209 
 
 
-
 
NC_002936  DET0823  hypothetical protein  46.14 
 
 
486 aa  390  1e-107  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.521188  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0172  hypothetical protein  47.52 
 
 
498 aa  390  1e-107  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.329648 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0157  hypothetical protein  47.3 
 
 
484 aa  388  1e-106  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.540934  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1426  hypothetical protein  45.74 
 
 
474 aa  388  1e-106  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1453  hypothetical protein  42.95 
 
 
482 aa  383  1e-105  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2355  hypothetical protein  46.88 
 
 
486 aa  384  1e-105  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.314227  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0129  hypothetical protein  47.07 
 
 
477 aa  384  1e-105  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0681  hypothetical protein  45.2 
 
 
472 aa  384  1e-105  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2726  hypothetical protein  45.69 
 
 
493 aa  381  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.627662  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0875  hypothetical protein  43.2 
 
 
443 aa  380  1e-104  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2207  hypothetical protein  46.42 
 
 
486 aa  377  1e-103  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112717  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1752  hypothetical protein  44.81 
 
 
460 aa  377  1e-103  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000000573149  normal  0.0520768 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0742  hypothetical protein  47.19 
 
 
486 aa  378  1e-103  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1945  protein of unknown function UPF0027  44.16 
 
 
482 aa  375  1e-102  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0738266  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0703  hypothetical protein  43.38 
 
 
480 aa  374  1e-102  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1219  hypothetical protein  46.87 
 
 
484 aa  369  1e-101  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1374  hypothetical protein  47.51 
 
 
473 aa  366  1e-100  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1651  hypothetical protein  45.99 
 
 
478 aa  367  1e-100  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1393  hypothetical protein  44.4 
 
 
485 aa  367  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_727  hypothetical protein  45.89 
 
 
486 aa  368  1e-100  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3271  protein of unknown function UPF0027  43.68 
 
 
486 aa  364  2e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1864  hypothetical protein  44.64 
 
 
484 aa  363  2e-99  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000183648  normal  0.470127 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1018  protein of unknown function UPF0027  48.16 
 
 
477 aa  363  5.0000000000000005e-99  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.725171  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4795  protein of unknown function UPF0027  46.1 
 
 
481 aa  362  6e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0989  protein of unknown function UPF0027  43.68 
 
 
486 aa  362  6e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0480  hypothetical protein  48.95 
 
 
484 aa  359  5e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.188355  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2758  protein of unknown function UPF0027  42.55 
 
 
486 aa  357  2.9999999999999997e-97  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0799133  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2548  hypothetical protein  47.81 
 
 
472 aa  355  7.999999999999999e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0808238  decreased coverage  0.00000419114 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1314  hypothetical protein  45.44 
 
 
477 aa  355  1e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.171787  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1619  hypothetical protein  43.13 
 
 
485 aa  353  4e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.691717  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2142  hypothetical protein  43.74 
 
 
485 aa  352  7e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.053171  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0835  hypothetical protein  46.74 
 
 
465 aa  351  2e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.500441  normal  0.402596 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1684  hypothetical protein  43.78 
 
 
485 aa  349  5e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1792  hypothetical protein  46.85 
 
 
477 aa  350  5e-95  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.873352 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2399  hypothetical protein  47.39 
 
 
472 aa  349  7e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.722236  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1007  protein of unknown function UPF0027  47.48 
 
 
487 aa  349  7e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0324917  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2560  protein of unknown function UPF0027  41.74 
 
 
488 aa  348  9e-95  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0946  hypothetical protein  47.27 
 
 
487 aa  348  1e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.504697  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1004  protein of unknown function UPF0027  47.06 
 
 
488 aa  347  2e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1950  protein of unknown function UPF0027  45.53 
 
 
476 aa  346  5e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00816316  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0333  protein of unknown function UPF0027  45.68 
 
 
476 aa  346  5e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0374  protein of unknown function UPF0027  43.04 
 
 
477 aa  345  8e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12650  hypothetical protein  46.45 
 
 
432 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000105377  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2359  hypothetical protein  45.32 
 
 
476 aa  343  5e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.442678 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0504  protein of unknown function UPF0027  50.26 
 
 
988 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0414  protein of unknown function UPF0027  41.61 
 
 
488 aa  342  9e-93  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.042837  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0986  hypothetical protein  45.55 
 
 
479 aa  342  1e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3181  hypothetical protein  45.47 
 
 
477 aa  341  2e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2151  hypothetical protein  41.7 
 
 
476 aa  340  5e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2125  hypothetical protein  41.7 
 
 
476 aa  339  5e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2024  protein of unknown function UPF0027  41.12 
 
 
502 aa  339  8e-92  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.724572  normal  0.445146 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0903  hypothetical protein  43.13 
 
 
475 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.354068  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2089  hypothetical protein  41.75 
 
 
478 aa  333  3e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2027  protein of unknown function UPF0027  45.72 
 
 
475 aa  331  1e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000742967  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46150  hypothetical protein  44.68 
 
 
476 aa  331  2e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.377544  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1728  hypothetical protein  43.82 
 
 
475 aa  329  7e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22420  hypothetical protein  44.14 
 
 
447 aa  325  8.000000000000001e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0134  hypothetical protein  42.75 
 
 
963 aa  323  3e-87  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2183  protein of unknown function UPF0027  39.34 
 
 
451 aa  319  6e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00364968  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0195  hypothetical protein  42.55 
 
 
476 aa  318  1e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.739539  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1265  RtcB  40 
 
 
477 aa  317  3e-85  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.268683  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25152  predicted protein  40.58 
 
 
514 aa  316  5e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0747524  normal  0.0655449 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3852  hypothetical protein  41.91 
 
 
476 aa  312  7.999999999999999e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2009  hypothetical protein  31.25 
 
 
396 aa  190  5e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0383885  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3893  protein of unknown function UPF0027  33.93 
 
 
406 aa  186  9e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2495  protein of unknown function UPF0027  31.77 
 
 
514 aa  182  2e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23210  hypothetical protein  31.97 
 
 
398 aa  171  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.280562  normal  0.598303 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1410  protein of unknown function UPF0027  31.83 
 
 
389 aa  166  6.9999999999999995e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0288746 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0235  protein of unknown function UPF0027  33.56 
 
 
406 aa  164  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1873  hypothetical protein  31.49 
 
 
398 aa  164  5.0000000000000005e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5947  hypothetical protein  31.64 
 
 
395 aa  163  7e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2449  protein of unknown function UPF0027  32.04 
 
 
402 aa  162  9e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.995987  normal  0.287762 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4449  hypothetical protein  31.97 
 
 
395 aa  162  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.317252 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5608  hypothetical protein  32.23 
 
 
511 aa  162  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.30311  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3555  hypothetical protein  32.62 
 
 
466 aa  161  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.771976  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1711  protein of unknown function UPF0027  32.41 
 
 
398 aa  161  3e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0543  protein of unknown function UPF0027  31.07 
 
 
388 aa  160  6e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60650  hypothetical protein  32.18 
 
 
404 aa  159  9e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3740  protein of unknown function UPF0027  31.43 
 
 
466 aa  159  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.349709  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1273  hypothetical protein  29.55 
 
 
409 aa  158  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1193  hypothetical protein  32.05 
 
 
408 aa  158  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0576  hypothetical protein  31.53 
 
 
401 aa  158  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5225  hypothetical protein  31.96 
 
 
404 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1473  hypothetical protein  32.26 
 
 
410 aa  156  8e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.375634  normal  0.152694 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5339  hypothetical protein  32.45 
 
 
384 aa  156  9e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.535527  normal  0.804772 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1934  protein of unknown function UPF0027  32.73 
 
 
410 aa  156  1e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.209355  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>